More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7187 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  45.02 
 
 		 1141 aa  783    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  45.02 
 
 		 1141 aa  783    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  44.15 
 
 		 1141 aa  734    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  45.02 
 
 		 1141 aa  775    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  100 
 
 		 1198 aa  2295    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  35.29 
 
 		 1118 aa  229  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  34.32 
 
 		 1150 aa  222  3e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  31.6 
 
 		 1123 aa  211  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  31.08 
 
 		 1123 aa  208  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  31.91 
 
 		 1118 aa  207  8e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  49.43 
 
 		 1148 aa  207  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  33.33 
 
 		 1132 aa  200  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  33.09 
 
 		 1161 aa  187  8e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  30.79 
 
 		 1114 aa  181  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  31.47 
 
 		 1090 aa  177  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  28.94 
 
 		 723 aa  154  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  37.33 
 
 		 969 aa  154  8.999999999999999e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  31.87 
 
 		 1108 aa  140  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  37.5 
 
 		 1071 aa  136  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2925  transcriptional regulator, SARP family  29.96 
 
 		 668 aa  135  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  34.9 
 
 		 1054 aa  132  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  36.16 
 
 		 1125 aa  132  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4694  transcriptional regulator, SARP family  32.75 
 
 		 833 aa  130  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  35.53 
 
 		 919 aa  129  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  31.22 
 
 		 496 aa  129  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  33.66 
 
 		 1000 aa  128  8.000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  29.38 
 
 		 1006 aa  127  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  30.68 
 
 		 957 aa  127  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  29.15 
 
 		 1005 aa  126  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  35.06 
 
 		 1022 aa  124  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  38.25 
 
 		 1121 aa  124  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2413  SARP family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 760 aa  123  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0215803  normal  0.881826 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  32.82 
 
 		 1029 aa  123  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  35.16 
 
 		 983 aa  122  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  33.41 
 
 		 1013 aa  122  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2412  transcriptional regulator, SARP family  35.2 
 
 		 370 aa  121  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0744334 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  30.04 
 
 		 1010 aa  120  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 268 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  29.37 
 
 		 1022 aa  120  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 1319 aa  120  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  31.03 
 
 		 940 aa  120  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  35.48 
 
 		 378 aa  119  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  30.08 
 
 		 1126 aa  118  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  38.55 
 
 		 1092 aa  116  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11293  transcriptional regulatory protein embR  34.98 
 
 		 388 aa  117  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00670672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  35.98 
 
 		 1733 aa  116  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  28.92 
 
 		 1030 aa  116  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  36.97 
 
 		 965 aa  115  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 1071 aa  115  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  30.62 
 
 		 1020 aa  115  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5752  SARP family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 276 aa  114  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  28.31 
 
 		 1146 aa  114  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  35.89 
 
 		 1158 aa  113  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  33.16 
 
 		 1102 aa  114  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  33.95 
 
 		 1005 aa  112  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  36.92 
 
 		 1017 aa  113  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  37.96 
 
 		 1103 aa  112  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  33.44 
 
 		 934 aa  112  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.92 
 
 		 1055 aa  111  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  30.76 
 
 		 993 aa  111  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  31.34 
 
 		 1025 aa  110  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  33.83 
 
 		 1699 aa  110  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  29.14 
 
 		 952 aa  108  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  35.71 
 
 		 1014 aa  107  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  36.59 
 
 		 1017 aa  107  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3159  SARP family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 968 aa  107  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000459834 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2801  transcriptional regulator, SARP family  33.2 
 
 		 267 aa  107  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000654776  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  37.86 
 
 		 1025 aa  106  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  25.25 
 
 		 1190 aa  106  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  28.5 
 
 		 967 aa  107  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  31.77 
 
 		 992 aa  106  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 622 aa  105  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  33.62 
 
 		 900 aa  105  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  37.45 
 
 		 1055 aa  105  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 1346 aa  105  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  33.9 
 
 		 921 aa  105  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4842  SARP family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 979 aa  105  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0556456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  28.69 
 
 		 1011 aa  105  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  34.57 
 
 		 453 aa  105  8e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4017  transcriptional regulator, SARP family  30.98 
 
 		 535 aa  104  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00126088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  26.32 
 
 		 1193 aa  104  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  36.33 
 
 		 489 aa  104  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2193  transcriptional regulator, SARP family  36.33 
 
 		 385 aa  104  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163999  hitchhiker  0.00133858 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 1151 aa  103  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  28.55 
 
 		 1088 aa  103  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.03 
 
 		 1175 aa  103  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6166  transcriptional regulator, SARP family  29.64 
 
 		 1036 aa  103  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000170258  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0709  transcriptional regulator, SARP family  32.51 
 
 		 379 aa  103  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  37.04 
 
 		 950 aa  103  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  38.65 
 
 		 960 aa  102  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  33.07 
 
 		 1004 aa  102  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  35.71 
 
 		 996 aa  102  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 621 aa  102  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  27.29 
 
 		 1075 aa  101  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  24.96 
 
 		 1027 aa  101  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  36.21 
 
 		 931 aa  100  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2178  transcriptional activator domain-containing protein  32.18 
 
 		 278 aa  100  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13144  transcriptional regulator  31.27 
 
 		 297 aa  100  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.149221 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  27.9 
 
 		 990 aa  99.8  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  39.44 
 
 		 582 aa  99.8  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>