More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1470 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  99.3 
 
 
1141 aa  2183    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  99.3 
 
 
1141 aa  2183    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  69.55 
 
 
1141 aa  1424    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  100 
 
 
1141 aa  2199    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  68.18 
 
 
1148 aa  1432    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  44.9 
 
 
1198 aa  754    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  30.79 
 
 
1123 aa  255  4.0000000000000004e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  34.16 
 
 
1121 aa  251  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  34.33 
 
 
1150 aa  242  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  31.63 
 
 
1123 aa  234  9e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  34.74 
 
 
1118 aa  234  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  32.13 
 
 
1114 aa  233  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  32.4 
 
 
1071 aa  223  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  30.94 
 
 
1118 aa  220  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  35.17 
 
 
1161 aa  216  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  31.27 
 
 
1090 aa  198  5.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  29.99 
 
 
1132 aa  196  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  29.84 
 
 
723 aa  173  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2140  transcriptional regulator, SARP family  39.08 
 
 
1153 aa  169  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.032223  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  30.64 
 
 
1151 aa  168  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  37.07 
 
 
1000 aa  167  8e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6166  transcriptional regulator, SARP family  30.35 
 
 
1036 aa  167  9e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000170258  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  37.08 
 
 
969 aa  163  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  37.75 
 
 
957 aa  159  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  38.19 
 
 
1092 aa  157  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  31.55 
 
 
1146 aa  155  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  31.03 
 
 
940 aa  156  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  37.79 
 
 
1102 aa  155  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4694  transcriptional regulator, SARP family  36.03 
 
 
833 aa  154  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  42.05 
 
 
489 aa  151  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  37.19 
 
 
1125 aa  150  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2178  transcriptional activator domain-containing protein  39.85 
 
 
278 aa  148  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  32.69 
 
 
1022 aa  147  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  37.72 
 
 
919 aa  145  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  36.78 
 
 
943 aa  145  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  38.28 
 
 
378 aa  145  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  34.86 
 
 
631 aa  144  7e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  35.96 
 
 
960 aa  144  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  31.5 
 
 
1030 aa  144  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  33.82 
 
 
453 aa  140  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  32.09 
 
 
496 aa  140  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  38.69 
 
 
1103 aa  140  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  38.98 
 
 
268 aa  139  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  37.13 
 
 
1018 aa  139  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  36.15 
 
 
1186 aa  139  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  31.31 
 
 
1010 aa  138  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  37.43 
 
 
1055 aa  137  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  27.35 
 
 
1126 aa  137  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  36.83 
 
 
1017 aa  137  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  33.26 
 
 
931 aa  137  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  34.1 
 
 
965 aa  137  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  34.31 
 
 
1733 aa  136  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  34.75 
 
 
989 aa  136  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  34.05 
 
 
1020 aa  136  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2412  transcriptional regulator, SARP family  37.05 
 
 
370 aa  135  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0744334 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  36.22 
 
 
981 aa  135  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  34.47 
 
 
950 aa  135  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  31.72 
 
 
934 aa  135  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2413  SARP family transcriptional regulator  38.8 
 
 
760 aa  134  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0215803  normal  0.881826 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  34.14 
 
 
1158 aa  134  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  29.74 
 
 
1022 aa  134  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  32.47 
 
 
992 aa  133  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  37.43 
 
 
1048 aa  132  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  35.29 
 
 
952 aa  132  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  31.51 
 
 
1013 aa  132  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  34.5 
 
 
1097 aa  132  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  35.19 
 
 
1093 aa  132  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  31.83 
 
 
1025 aa  131  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  34.29 
 
 
990 aa  131  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  36.91 
 
 
910 aa  130  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  31.62 
 
 
654 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  31.76 
 
 
1071 aa  130  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2925  transcriptional regulator, SARP family  29.78 
 
 
668 aa  130  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  31.87 
 
 
981 aa  129  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 
995 aa  129  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  37.11 
 
 
919 aa  129  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  34.04 
 
 
1048 aa  129  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  41.63 
 
 
1025 aa  129  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  36.86 
 
 
926 aa  128  7e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  36.31 
 
 
956 aa  128  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11293  transcriptional regulatory protein embR  36.36 
 
 
388 aa  127  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00670672  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  30.41 
 
 
921 aa  126  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  29.47 
 
 
621 aa  126  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  32.39 
 
 
1088 aa  125  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  34.29 
 
 
1346 aa  125  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  31.23 
 
 
996 aa  124  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  34.3 
 
 
1108 aa  124  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  36.61 
 
 
1005 aa  124  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  38.36 
 
 
943 aa  124  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  35.26 
 
 
1100 aa  124  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  33.66 
 
 
941 aa  123  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4842  SARP family transcriptional regulator  35.89 
 
 
979 aa  123  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0556456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5257  transcriptional regulator, SARP family  38 
 
 
655 aa  121  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0459808  normal  0.112263 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2437  transcriptional activator domain-containing protein  34.04 
 
 
597 aa  121  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0868593  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  27.52 
 
 
1190 aa  120  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  31.54 
 
 
964 aa  120  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  30.55 
 
 
990 aa  120  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  26.71 
 
 
1029 aa  120  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  34.23 
 
 
1056 aa  120  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  38.52 
 
 
954 aa  120  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>