More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1815 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  69.49 
 
 		 1141 aa  1469    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  69.49 
 
 		 1141 aa  1469    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  100 
 
 		 1141 aa  2206    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  69.49 
 
 		 1141 aa  1466    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  80.47 
 
 		 1148 aa  1736    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  44.58 
 
 		 1198 aa  561  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  30.69 
 
 		 1123 aa  250  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  31.04 
 
 		 1123 aa  234  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  33.57 
 
 		 1161 aa  230  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  34.68 
 
 		 1121 aa  225  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  34.14 
 
 		 1118 aa  224  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  31.87 
 
 		 1114 aa  223  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  31.87 
 
 		 1118 aa  220  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  28.9 
 
 		 1150 aa  219  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  31.99 
 
 		 1071 aa  212  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  31.38 
 
 		 1090 aa  206  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  32.19 
 
 		 1132 aa  191  8e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  30.45 
 
 		 723 aa  185  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6166  transcriptional regulator, SARP family  31.06 
 
 		 1036 aa  177  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000170258  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  32.29 
 
 		 1146 aa  171  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 1151 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  38.41 
 
 		 1092 aa  160  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  37.5 
 
 		 378 aa  151  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  38.97 
 
 		 940 aa  151  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  35.77 
 
 		 1000 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2140  transcriptional regulator, SARP family  37.87 
 
 		 1153 aa  148  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.032223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  38.86 
 
 		 950 aa  148  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  36.44 
 
 		 1102 aa  147  9e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  36.62 
 
 		 969 aa  147  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  35.03 
 
 		 957 aa  145  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  32.52 
 
 		 1022 aa  143  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  33.11 
 
 		 965 aa  142  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  37.58 
 
 		 1055 aa  140  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  31.09 
 
 		 1022 aa  139  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  35.88 
 
 		 1017 aa  140  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4694  transcriptional regulator, SARP family  37.6 
 
 		 833 aa  139  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  37.96 
 
 		 496 aa  139  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  37.13 
 
 		 1103 aa  138  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  41.22 
 
 		 1158 aa  137  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  40.08 
 
 		 919 aa  135  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  35.61 
 
 		 1018 aa  134  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  34.9 
 
 		 1097 aa  133  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  33.42 
 
 		 921 aa  133  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  32.26 
 
 		 934 aa  133  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  35.92 
 
 		 453 aa  131  6e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  35.95 
 
 		 1125 aa  131  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  34.9 
 
 		 1733 aa  131  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  34.02 
 
 		 960 aa  130  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  32.81 
 
 		 1010 aa  130  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  36.07 
 
 		 910 aa  129  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 268 aa  127  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  27.65 
 
 		 1126 aa  126  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  26.1 
 
 		 1067 aa  126  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2178  transcriptional activator domain-containing protein  35.27 
 
 		 278 aa  126  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  31.77 
 
 		 992 aa  125  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 1071 aa  124  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  37.86 
 
 		 1339 aa  124  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  34.24 
 
 		 1088 aa  124  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  32.93 
 
 		 943 aa  123  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  31.64 
 
 		 981 aa  123  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  34.8 
 
 		 489 aa  123  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  35.56 
 
 		 919 aa  122  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  32.75 
 
 		 1029 aa  122  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  32.63 
 
 		 990 aa  121  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  31.83 
 
 		 956 aa  120  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  28.21 
 
 		 1193 aa  120  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 621 aa  120  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2413  SARP family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 760 aa  119  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0215803  normal  0.881826 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  34.76 
 
 		 921 aa  119  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0072  transcriptional activator domain protein  29.18 
 
 		 1101 aa  119  3.9999999999999997e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.713941  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  31.61 
 
 		 1699 aa  118  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  33.04 
 
 		 952 aa  118  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  32.44 
 
 		 989 aa  117  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  27.52 
 
 		 1055 aa  117  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  32.1 
 
 		 1013 aa  117  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  30.67 
 
 		 1030 aa  117  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  36.9 
 
 		 1025 aa  116  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2925  transcriptional regulator, SARP family  28.81 
 
 		 668 aa  116  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  37.36 
 
 		 954 aa  115  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5752  SARP family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 276 aa  115  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11293  transcriptional regulatory protein embR  33.47 
 
 		 388 aa  115  6e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00670672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4842  SARP family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 979 aa  114  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0556456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  34.25 
 
 		 1100 aa  113  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  26.72 
 
 		 1190 aa  113  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  34.13 
 
 		 931 aa  114  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13144  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 297 aa  112  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.149221 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  32.82 
 
 		 983 aa  112  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3100  transcriptional regulator, SARP family  33.85 
 
 		 262 aa  112  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.534297  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  32.95 
 
 		 1186 aa  112  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  32.22 
 
 		 1093 aa  112  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  38.84 
 
 		 1025 aa  112  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2911  transcriptional regulator, SARP family  34.42 
 
 		 885 aa  112  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00504446  hitchhiker  0.0000384659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2437  transcriptional activator domain-containing protein  31.01 
 
 		 597 aa  110  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0868593  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0709  transcriptional regulator, SARP family  36.28 
 
 		 379 aa  110  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122417  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 1048 aa  110  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  31.74 
 
 		 631 aa  111  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  32.82 
 
 		 930 aa  110  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 654 aa  110  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3159  SARP family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 968 aa  110  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000459834 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2193  transcriptional regulator, SARP family  39.18 
 
 		 385 aa  110  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163999  hitchhiker  0.00133858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>