More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1406 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  100 
 
 		 1067 aa  2106    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  35.01 
 
 		 1126 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  38.33 
 
 		 494 aa  291  5.0000000000000004e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  30.02 
 
 		 1122 aa  265  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  29.27 
 
 		 1029 aa  232  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  27.37 
 
 		 1105 aa  220  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  30.78 
 
 		 1055 aa  204  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  27.54 
 
 		 713 aa  195  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.37 
 
 		 1141 aa  187  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  31.12 
 
 		 1075 aa  187  8e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  27.84 
 
 		 1034 aa  186  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  26.64 
 
 		 1046 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.23 
 
 		 1149 aa  184  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 1015 aa  184  7e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  28.06 
 
 		 1139 aa  178  5e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1630  SARP family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 1089 aa  174  6.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  26.09 
 
 		 1402 aa  173  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  29.65 
 
 		 1190 aa  172  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  26.95 
 
 		 1403 aa  171  9e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  28.15 
 
 		 1193 aa  170  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  25.6 
 
 		 1048 aa  170  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  27.25 
 
 		 1138 aa  169  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.25 
 
 		 1151 aa  168  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  26.89 
 
 		 1151 aa  163  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  26.79 
 
 		 1148 aa  162  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 1116 aa  162  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  27.56 
 
 		 1013 aa  161  7e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  26.24 
 
 		 1139 aa  158  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  29.53 
 
 		 1143 aa  157  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4100  tetratricopeptide TPR_4  26.3 
 
 		 1377 aa  147  7.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000225277 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3681  SARP family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 1217 aa  147  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134161  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.57 
 
 		 1175 aa  147  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  27.03 
 
 		 1163 aa  147  9e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  30.59 
 
 		 1118 aa  147  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  26.31 
 
 		 1055 aa  147  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4989  serine/threonine protein kinase  27.62 
 
 		 1348 aa  145  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3132  serine/threonine protein kinase  28.11 
 
 		 1349 aa  145  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  29.42 
 
 		 1109 aa  145  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  30.44 
 
 		 1118 aa  145  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.57 
 
 		 1117 aa  144  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5139  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 1349 aa  142  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5720  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 1349 aa  142  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.793186  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4507  serine/threonine protein kinase  28.33 
 
 		 1342 aa  141  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  32.47 
 
 		 992 aa  140  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  27.77 
 
 		 1133 aa  139  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2581  transcriptional activator domain-containing protein  27.62 
 
 		 1183 aa  134  9e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  30.61 
 
 		 916 aa  129  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  29.92 
 
 		 1022 aa  127  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  31.35 
 
 		 1029 aa  127  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  26.23 
 
 		 1037 aa  125  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  26.43 
 
 		 1141 aa  121  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  30.23 
 
 		 982 aa  120  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1015  SARP family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 1216 aa  120  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  27.25 
 
 		 967 aa  116  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  26.02 
 
 		 1134 aa  115  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  28.86 
 
 		 900 aa  115  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  29.77 
 
 		 1054 aa  114  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  30.71 
 
 		 1121 aa  114  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  31.08 
 
 		 954 aa  113  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.89 
 
 		 1429 aa  111  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 1064 aa  110  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  26.05 
 
 		 1148 aa  110  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  27.8 
 
 		 1118 aa  109  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0514  protein kinase domain-containing protein  29.18 
 
 		 1353 aa  108  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6308  serine/threonine protein kinase  29.29 
 
 		 1235 aa  108  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  26.53 
 
 		 1358 aa  107  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0817  diguanylate cyclase  21.25 
 
 		 1826 aa  106  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.7 
 
 		 1087 aa  106  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.91 
 
 		 1422 aa  106  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.84 
 
 		 1780 aa  105  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  26.45 
 
 		 1005 aa  104  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1237  adenylate/guanylate cyclase  29.5 
 
 		 1027 aa  103  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1254  adenylate/guanylate cyclase  29.5 
 
 		 1027 aa  103  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419758  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  28.38 
 
 		 1123 aa  102  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1991  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.36 
 
 		 1023 aa  102  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0171462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0315  SARP family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 648 aa  102  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.658605  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  29.7 
 
 		 1006 aa  102  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  32.48 
 
 		 999 aa  100  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0243  transcriptional activator domain protein  26.69 
 
 		 1083 aa  101  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  23.33 
 
 		 1774 aa  100  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  28.67 
 
 		 723 aa  100  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.61 
 
 		 1089 aa  100  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 1141 aa  99.8  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  25.51 
 
 		 1227 aa  99.4  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 1141 aa  99.8  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.1 
 
 		 2017 aa  98.6  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2055  ATPase-like protein  25.17 
 
 		 1289 aa  99  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.125092  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  30.07 
 
 		 1013 aa  98.2  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  27.97 
 
 		 992 aa  97.1  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  30.5 
 
 		 1044 aa  97.1  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1263  adenylate/guanylate cyclase  29.73 
 
 		 1027 aa  97.1  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505762  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.25 
 
 		 1942 aa  96.3  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  27.04 
 
 		 1094 aa  95.5  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  24.59 
 
 		 1123 aa  95.1  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  25.31 
 
 		 1142 aa  95.1  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0072  transcriptional activator domain protein  27.3 
 
 		 1101 aa  95.1  7e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.713941  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1214  adenylate/guanylate cyclase  23.63 
 
 		 1130 aa  94  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 1141 aa  94.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  23.99 
 
 		 1271 aa  94  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0233  transcriptional regulator, SARP family  25.77 
 
 		 911 aa  93.2  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>