293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3681 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3681  SARP family transcriptional regulator  100 
 
 		 1217 aa  2444    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134161  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  27.78 
 
 		 1067 aa  160  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  29.11 
 
 		 1126 aa  143  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  26.85 
 
 		 1029 aa  141  7.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  29 
 
 		 494 aa  132  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  29.2 
 
 		 1075 aa  129  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2581  transcriptional activator domain-containing protein  27.71 
 
 		 1183 aa  118  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  28.91 
 
 		 1109 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  26.66 
 
 		 1015 aa  105  7e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  28.15 
 
 		 713 aa  103  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  28.44 
 
 		 1013 aa  103  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  27.13 
 
 		 1055 aa  102  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  31.04 
 
 		 1022 aa  99.4  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  27.5 
 
 		 1139 aa  97.4  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  29.48 
 
 		 1029 aa  97.1  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  23.92 
 
 		 1148 aa  95.9  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  28.24 
 
 		 954 aa  95.5  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  25.48 
 
 		 1193 aa  95.1  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  26.58 
 
 		 1034 aa  90.5  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  30.56 
 
 		 1054 aa  89.4  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  25.93 
 
 		 1190 aa  88.2  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  25.57 
 
 		 967 aa  85.9  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0515  ATPase-like  23.71 
 
 		 1079 aa  85.5  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.413543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2832  transcriptional regulator, SARP family  29.72 
 
 		 1145 aa  85.5  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  26.17 
 
 		 1163 aa  83.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  22.72 
 
 		 1175 aa  82.4  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 973 aa  82.4  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  26.03 
 
 		 1141 aa  81.6  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.96 
 
 		 1291 aa  80.9  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1512  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  28.63 
 
 		 561 aa  80.1  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  28.74 
 
 		 1056 aa  79  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 1116 aa  78.6  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  27.62 
 
 		 1051 aa  78.2  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.36 
 
 		 1081 aa  78.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.27 
 
 		 1080 aa  76.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  24.21 
 
 		 723 aa  76.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.23 
 
 		 1780 aa  76.3  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 1744 aa  74.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  27.35 
 
 		 900 aa  74.7  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  28.52 
 
 		 1123 aa  74.7  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 1064 aa  74.3  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  29.9 
 
 		 999 aa  73.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4588  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.79 
 
 		 1096 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537027  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  28.92 
 
 		 992 aa  73.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2653  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  26.91 
 
 		 572 aa  73.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  27.08 
 
 		 1006 aa  72.4  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  33.19 
 
 		 970 aa  72.4  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 895 aa  72  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  25.03 
 
 		 1013 aa  72  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  25.3 
 
 		 1118 aa  71.6  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  27.69 
 
 		 1143 aa  71.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  24.48 
 
 		 1050 aa  71.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  27.97 
 
 		 919 aa  71.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.48 
 
 		 1050 aa  71.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  29.4 
 
 		 983 aa  70.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  24.49 
 
 		 1123 aa  70.1  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  30.08 
 
 		 966 aa  69.7  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  35.85 
 
 		 981 aa  69.3  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  28.89 
 
 		 1163 aa  68.9  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  26.05 
 
 		 916 aa  68.6  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0072  transcriptional activator domain protein  25.07 
 
 		 1101 aa  68.6  0.0000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.713941  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  25.86 
 
 		 1121 aa  68.6  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  30.41 
 
 		 1044 aa  68.6  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  29.41 
 
 		 996 aa  68.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  27.52 
 
 		 1111 aa  68.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  26.93 
 
 		 952 aa  67.4  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  23.86 
 
 		 1295 aa  67.4  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0403  transcriptional regulator, LuxR family  29.59 
 
 		 981 aa  66.6  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.106797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6166  transcriptional regulator, SARP family  26.15 
 
 		 1036 aa  67  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000170258  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  26.15 
 
 		 1132 aa  66.6  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  26.84 
 
 		 2109 aa  66.6  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  28.03 
 
 		 992 aa  66.2  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  25.57 
 
 		 982 aa  65.9  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  27.08 
 
 		 1712 aa  66.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  26.73 
 
 		 1885 aa  65.5  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  25.44 
 
 		 1071 aa  65.1  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4139  SARP family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  25.6 
 
 		 1710 aa  65.1  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  23.68 
 
 		 1808 aa  64.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  28.44 
 
 		 1097 aa  64.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.34 
 
 		 1797 aa  64.3  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  29.32 
 
 		 957 aa  64.3  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  23.22 
 
 		 1089 aa  64.3  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  21.71 
 
 		 1774 aa  63.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  25.05 
 
 		 1064 aa  63.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  24.8 
 
 		 1668 aa  63.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0926  transcriptional regulator, LuxR family  25.22 
 
 		 999 aa  63.2  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  27.78 
 
 		 1271 aa  63.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.55 
 
 		 1055 aa  63.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  26.7 
 
 		 928 aa  63.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  20.43 
 
 		 1020 aa  62.8  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  24.75 
 
 		 1227 aa  62.8  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  27.27 
 
 		 993 aa  62.8  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  28.01 
 
 		 1733 aa  62.8  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2035  serine/threonine protein kinase  24.72 
 
 		 1383 aa  62.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202066 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25 
 
 		 1804 aa  62.4  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  24.53 
 
 		 1118 aa  62.4  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  24.4 
 
 		 1160 aa  62.4  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  28.78 
 
 		 937 aa  62  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 1000 aa  62  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>