More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2581 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2581  transcriptional activator domain-containing protein  100 
 
 		 1183 aa  2375    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  28.55 
 
 		 1067 aa  152  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  30.53 
 
 		 494 aa  135  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  29.68 
 
 		 1109 aa  132  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 1116 aa  131  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  27.08 
 
 		 1013 aa  127  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  26.3 
 
 		 1126 aa  126  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  27.15 
 
 		 1190 aa  123  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  25.74 
 
 		 1029 aa  123  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1015  SARP family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 1216 aa  122  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  27.63 
 
 		 1075 aa  120  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  26.49 
 
 		 1034 aa  119  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  26.69 
 
 		 713 aa  115  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  26.21 
 
 		 1143 aa  114  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  27.78 
 
 		 1055 aa  113  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 1151 aa  113  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  25.15 
 
 		 1148 aa  110  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  26.15 
 
 		 1193 aa  110  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  27.52 
 
 		 1118 aa  109  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 1064 aa  108  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  26.61 
 
 		 1141 aa  108  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  25.37 
 
 		 1139 aa  108  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  27.52 
 
 		 1118 aa  107  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 1015 aa  105  7e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  29.56 
 
 		 1022 aa  103  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  26.63 
 
 		 1123 aa  103  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  26.11 
 
 		 992 aa  103  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3681  SARP family transcriptional regulator  30.75 
 
 		 1217 aa  99.4  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134161  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  29.7 
 
 		 900 aa  99  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  22.82 
 
 		 1298 aa  98.2  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  29.93 
 
 		 967 aa  98.2  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.59 
 
 		 1117 aa  97.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  28.22 
 
 		 954 aa  97.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  30.82 
 
 		 1044 aa  97.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.45 
 
 		 1666 aa  95.9  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5633  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.51 
 
 		 1131 aa  95.5  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.32 
 
 		 1141 aa  94.7  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.32 
 
 		 1149 aa  94.7  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  26.81 
 
 		 1090 aa  94.7  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3733  transcriptional regulator, LuxR family  27.03 
 
 		 1007 aa  93.6  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  24.14 
 
 		 1271 aa  94  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  26.07 
 
 		 1403 aa  92.8  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  25.43 
 
 		 1114 aa  92.4  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 1050 aa  92  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 973 aa  91.3  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.84 
 
 		 1175 aa  91.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  26.25 
 
 		 1163 aa  90.9  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0329  ATPase-like protein  28.71 
 
 		 1169 aa  90.9  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.257596 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4797  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.85 
 
 		 1468 aa  90.1  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.19 
 
 		 1089 aa  90.5  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 1141 aa  89.7  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 1141 aa  89.7  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  26.31 
 
 		 1121 aa  89.4  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  33.1 
 
 		 999 aa  89  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2832  transcriptional regulator, SARP family  28.62 
 
 		 1145 aa  88.6  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  25.05 
 
 		 1048 aa  88.6  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  25.93 
 
 		 1050 aa  87.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.93 
 
 		 1050 aa  87.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 1141 aa  87.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  25.96 
 
 		 1054 aa  87  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  24.31 
 
 		 1122 aa  87  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  28.09 
 
 		 1132 aa  86.3  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  22.49 
 
 		 1134 aa  85.5  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2055  ATPase-like protein  26.51 
 
 		 1289 aa  85.9  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.125092  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  28.47 
 
 		 983 aa  84.7  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  23.85 
 
 		 1148 aa  84.3  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  32.23 
 
 		 919 aa  84.7  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0699  transcriptional activator domain-containing protein  31.33 
 
 		 1094 aa  84.3  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060152 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.77 
 
 		 1403 aa  84.3  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  27.29 
 
 		 959 aa  83.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  21.78 
 
 		 1295 aa  84  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  26.25 
 
 		 1118 aa  84  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  27.49 
 
 		 1198 aa  84  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2140  transcriptional regulator, SARP family  26.95 
 
 		 1153 aa  84  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.032223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.27 
 
 		 1055 aa  82.8  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  25 
 
 		 1146 aa  82.8  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  25.83 
 
 		 1160 aa  82.4  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  23.57 
 
 		 723 aa  82.4  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  29.28 
 
 		 916 aa  82  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  24.2 
 
 		 1051 aa  81.6  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  25.59 
 
 		 1150 aa  81.6  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1930  transcriptional activator domain-containing protein  29.87 
 
 		 991 aa  81.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.816243  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  23.28 
 
 		 1105 aa  80.9  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  21.9 
 
 		 1093 aa  81.3  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.69 
 
 		 852 aa  81.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3799  LuxR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 952 aa  80.9  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00558742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5410  LuxR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 952 aa  80.9  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  26.08 
 
 		 966 aa  80.1  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0337  transcriptional regulator, SARP family  25.57 
 
 		 647 aa  80.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  23.15 
 
 		 1046 aa  79.7  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.41 
 
 		 1081 aa  79.7  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0315  SARP family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 648 aa  79  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.658605  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.69 
 
 		 1053 aa  78.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4029  ATPase-like protein  28.43 
 
 		 758 aa  78.6  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00633058  normal  0.086403 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0403  transcriptional regulator, LuxR family  27.9 
 
 		 981 aa  78.6  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.106797 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1450  diguanylate cyclase  26.96 
 
 		 1774 aa  78.2  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4710  transcriptional regulator, LuxR family  27.02 
 
 		 973 aa  77.8  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  30.65 
 
 		 1108 aa  77.8  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5519  serine/threonine protein kinase  24.81 
 
 		 1188 aa  77.4  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  28.92 
 
 		 1095 aa  77.8  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>