More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4724 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  100 
 
 
713 aa  1423    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  38.34 
 
 
1034 aa  417  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  29.08 
 
 
1029 aa  228  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  30.86 
 
 
1013 aa  204  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  27.54 
 
 
1067 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  28.85 
 
 
1055 aa  197  7e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  27.34 
 
 
1163 aa  166  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  27.47 
 
 
1126 aa  152  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  27.43 
 
 
1075 aa  152  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  26.67 
 
 
1139 aa  148  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1630  SARP family transcriptional regulator  28.31 
 
 
1089 aa  145  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  28.86 
 
 
1015 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  26.45 
 
 
1193 aa  137  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1015  SARP family transcriptional regulator  27.06 
 
 
1216 aa  137  7.000000000000001e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  26.45 
 
 
1190 aa  133  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  28.25 
 
 
1143 aa  128  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  29.47 
 
 
967 aa  127  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  30.18 
 
 
494 aa  126  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  31.02 
 
 
954 aa  124  9e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  28.24 
 
 
1071 aa  123  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2581  transcriptional activator domain-containing protein  27.24 
 
 
1183 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808302  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  27.7 
 
 
973 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  29.24 
 
 
992 aa  118  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  30.02 
 
 
1006 aa  117  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  30.75 
 
 
1022 aa  117  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  31.06 
 
 
1013 aa  116  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  29.55 
 
 
983 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  28.03 
 
 
1118 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  28.14 
 
 
1198 aa  114  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  24.27 
 
 
1148 aa  114  7.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  25.53 
 
 
1141 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  29.4 
 
 
900 aa  112  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  27.59 
 
 
1403 aa  111  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  27.37 
 
 
723 aa  111  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  26.62 
 
 
1141 aa  111  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  26.62 
 
 
1141 aa  111  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.23 
 
 
1141 aa  110  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  26.55 
 
 
1105 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  25.17 
 
 
1116 aa  110  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  29.26 
 
 
998 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  26.4 
 
 
1141 aa  108  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6308  serine/threonine protein kinase  29.68 
 
 
1235 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  26.16 
 
 
1138 aa  105  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  27.42 
 
 
993 aa  104  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  26.32 
 
 
1227 aa  104  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  28.92 
 
 
982 aa  103  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.73 
 
 
1149 aa  102  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  26.9 
 
 
1109 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  25.24 
 
 
1020 aa  102  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  32.78 
 
 
1056 aa  101  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  23.88 
 
 
1148 aa  100  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  27.74 
 
 
1121 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  25.04 
 
 
1118 aa  98.6  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  25.07 
 
 
1118 aa  99  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0315  SARP family transcriptional regulator  26.11 
 
 
648 aa  98.2  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.658605  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  25.67 
 
 
959 aa  97.8  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  28.15 
 
 
1123 aa  96.7  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  25.86 
 
 
1123 aa  95.9  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.11 
 
 
1295 aa  95.5  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1734  ATPase-like protein  26.33 
 
 
977 aa  95.5  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  25.28 
 
 
1050 aa  95.1  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  26.03 
 
 
1114 aa  95.1  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.28 
 
 
1050 aa  95.1  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.06 
 
 
1422 aa  95.1  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.13 
 
 
1429 aa  95.1  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.4 
 
 
1055 aa  94  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  29.87 
 
 
970 aa  93.2  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  28.9 
 
 
916 aa  91.7  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5315  transcriptional regulator, LuxR family  28.61 
 
 
965 aa  92  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00819594  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  26.46 
 
 
1150 aa  91.3  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  27.86 
 
 
921 aa  91.3  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  25.16 
 
 
1065 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  26.96 
 
 
1264 aa  90.5  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0078  transcriptional activator domain-containing protein  27.59 
 
 
914 aa  89.7  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323405  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.57 
 
 
1441 aa  88.6  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  27.83 
 
 
966 aa  89  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0926  transcriptional regulator, LuxR family  27.07 
 
 
999 aa  89  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  26.87 
 
 
919 aa  88.2  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0072  transcriptional activator domain protein  26.08 
 
 
1101 aa  88.2  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.713941  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1930  transcriptional activator domain-containing protein  30.41 
 
 
991 aa  88.2  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.816243  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.72 
 
 
1175 aa  88.2  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6499  adenylate/guanylate cyclase  25.78 
 
 
1043 aa  87.8  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953876  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3733  transcriptional regulator, LuxR family  27.23 
 
 
1007 aa  87.8  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.32 
 
 
1360 aa  87  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5916  transcriptional regulator, LuxR family  28.11 
 
 
864 aa  87  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  23.84 
 
 
1084 aa  87  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  29.64 
 
 
967 aa  87  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  23.45 
 
 
1697 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  27.7 
 
 
963 aa  86.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
1000 aa  85.9  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  23.12 
 
 
1139 aa  85.5  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3681  SARP family transcriptional regulator  27.83 
 
 
1217 aa  85.1  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134161  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  25.28 
 
 
1122 aa  84.7  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5633  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.09 
 
 
1131 aa  84.3  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3369  transcriptional regulator, LuxR family  26.43 
 
 
872 aa  84.3  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0337  transcriptional regulator, SARP family  26.02 
 
 
647 aa  84.3  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  26.01 
 
 
1005 aa  84  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  28.27 
 
 
956 aa  84  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0817  diguanylate cyclase  21.78 
 
 
1826 aa  84  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.26 
 
 
1089 aa  82.8  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>