More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0817 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0817  diguanylate cyclase  100 
 
 		 1826 aa  3729    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2580  GGDEF domain-containing protein  23.31 
 
 		 1774 aa  337  1e-90  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.386865  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2582  GGDEF domain-containing protein  24.86 
 
 		 1431 aa  301  8e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00148361  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0953  diguanylate cyclase  45.62 
 
 		 494 aa  160  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0926  diguanylate cyclase  45.28 
 
 		 494 aa  158  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4131  diguanylate cyclase  42.19 
 
 		 369 aa  157  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1298  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.45 
 
 		 353 aa  155  5.9999999999999996e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000090214  hitchhiker  0.00354722 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2258  diguanylate cyclase  30.15 
 
 		 353 aa  155  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000122425  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4523  diguanylate cyclase with GAF sensor  41.27 
 
 		 499 aa  154  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.967133  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3508  diguanylate cyclase  43.65 
 
 		 638 aa  153  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0970585 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1870  GGDEF domain-containing protein  36.84 
 
 		 342 aa  150  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  18.94 
 
 		 1666 aa  149  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  35.74 
 
 		 1644 aa  149  5e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2497  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.1 
 
 		 355 aa  149  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000595067  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3523  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  38.95 
 
 		 1079 aa  149  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3376  GGDEF/response regulator receiver domain-containing protein  39.27 
 
 		 308 aa  148  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1202  diguanylate cyclase  37.2 
 
 		 356 aa  148  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0240122  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3835  diguanylate cyclase  46.06 
 
 		 316 aa  148  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4457  GGDEF domain-containing protein  44.24 
 
 		 485 aa  147  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0195  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40 
 
 		 309 aa  147  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0106599  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0207  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.15 
 
 		 772 aa  148  1e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.53871  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0743  diguanylate cyclase  41.75 
 
 		 680 aa  147  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1315  diguanylate cyclase  42.77 
 
 		 608 aa  147  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243862  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3072  diguanylate cyclase  36.71 
 
 		 356 aa  146  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000986718 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1471  diguanylate cyclase  36.49 
 
 		 439 aa  146  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0069  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.53 
 
 		 314 aa  145  7e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.840661 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1282  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.54 
 
 		 550 aa  145  8e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101268  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1290  response regulator PleD  42.33 
 
 		 457 aa  144  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0138689  hitchhiker  0.00259394 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1477  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.83 
 
 		 730 aa  144  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2189  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.91 
 
 		 415 aa  144  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  40.2 
 
 		 792 aa  144  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3334  GGDEF family protein  42.31 
 
 		 574 aa  144  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2240  diguanylate cyclase  41.14 
 
 		 758 aa  144  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.365812 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1382  response regulator PleD  41.61 
 
 		 457 aa  144  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0299  hypothetical protein  40.62 
 
 		 609 aa  143  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  39.71 
 
 		 841 aa  143  3e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0645  diguanylate cyclase  40.68 
 
 		 659 aa  143  3e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4128  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  38.59 
 
 		 663 aa  143  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0185  diguanylate cyclase with GAF sensor  39.24 
 
 		 1125 aa  143  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0283  hypothetical protein  39.07 
 
 		 709 aa  143  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3753  diguanylate cyclase  39.6 
 
 		 485 aa  143  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.580016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0268  diguanylate cyclase  40.1 
 
 		 485 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.624982  hitchhiker  0.000186113 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1811  GGDEF/HD domain-containing protein  41.53 
 
 		 563 aa  142  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.63619  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1328  diguanylate cyclase  43.29 
 
 		 564 aa  142  4.999999999999999e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0263917  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2333  hypothetical protein  37.57 
 
 		 565 aa  142  6e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1357  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.5 
 
 		 901 aa  142  6e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000351362  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1530  GGDEF/HD domain-containing protein  41.53 
 
 		 564 aa  142  7e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.890216  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2477  hypothetical protein  37.57 
 
 		 273 aa  142  8.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  39.22 
 
 		 836 aa  141  8.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  40.22 
 
 		 721 aa  141  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3647  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.24 
 
 		 359 aa  141  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.745021  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21320  diguanylate cyclase  39.56 
 
 		 510 aa  141  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2740  diguanylate cyclase  41.72 
 
 		 555 aa  141  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0620  diguanylate cyclase  36.92 
 
 		 517 aa  140  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089586 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3745  diguanylate cyclase  31.63 
 
 		 681 aa  140  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2544  diguanylate cyclase  37.29 
 
 		 398 aa  140  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.871243  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1282  diguanylate cyclase  41.21 
 
 		 578 aa  140  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2671  diguanylate cyclase  41.76 
 
 		 578 aa  140  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00272144  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1211  diguanylate cyclase  40.66 
 
 		 578 aa  140  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0319  diguanylate cyclase  37.91 
 
 		 732 aa  140  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0269  diguanylate cyclase  38.12 
 
 		 485 aa  140  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.853723  hitchhiker  0.00000177476 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1387  cyclic nucleotide-binding protein  42.68 
 
 		 320 aa  140  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3525  diguanylate cyclase  41.24 
 
 		 227 aa  140  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.395826  normal  0.08798 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2287  diguanylate cyclase  41.77 
 
 		 764 aa  139  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2679  diguanylate cyclase  42.77 
 
 		 459 aa  139  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1309  GGDEF  42.01 
 
 		 334 aa  139  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365402 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2169  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.67 
 
 		 713 aa  139  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2375  diguanylate cyclase  41.77 
 
 		 764 aa  139  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1576  diguanylate cyclase  41.51 
 
 		 764 aa  139  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1885  diguanylate cyclase with GAF sensor  39.9 
 
 		 558 aa  139  6.0000000000000005e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1886  diguanylate cyclase  39.78 
 
 		 462 aa  139  7.000000000000001e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0847  two component diguanylate cyclase  42.7 
 
 		 327 aa  139  7.000000000000001e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1058  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.6 
 
 		 333 aa  139  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0856452  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2048  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.67 
 
 		 704 aa  139  7.000000000000001e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1476  diguanylate cyclase  36.49 
 
 		 414 aa  139  7.000000000000001e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.64785  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4798  diguanylate cyclase  39.55 
 
 		 485 aa  138  8e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393558 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01741  Putative CHASE3/GGDEF domain-containing signal protein  39.88 
 
 		 563 aa  138  9e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0613  diguanylate cyclase  42.07 
 
 		 611 aa  138  9e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3350  sensor histidine kinase/GGDEF domain-containing protein  44.94 
 
 		 565 aa  137  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1348  response regulator PleD  40.37 
 
 		 457 aa  137  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2951  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.18 
 
 		 306 aa  138  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1165  diguanylate cyclase  41.03 
 
 		 459 aa  137  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000192138 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3851  diguanylate cyclase  42.77 
 
 		 380 aa  138  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.344739 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2110  PAS:GGDEF  34.27 
 
 		 796 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172113  normal  0.0218284 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0085  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.11 
 
 		 301 aa  137  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0058  diguanylate cyclase  39.89 
 
 		 565 aa  138  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.714624  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  41.25 
 
 		 457 aa  138  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0057  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.44 
 
 		 550 aa  137  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3430  diguanylate cyclase  40.65 
 
 		 513 aa  138  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1499  response regulator/GGDEF domain protein  40.83 
 
 		 334 aa  137  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2067  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.66 
 
 		 317 aa  137  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0273  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.69 
 
 		 1078 aa  137  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2041  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.66 
 
 		 317 aa  137  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3816  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.69 
 
 		 797 aa  137  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.250791  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16500  two-component response regulator  42.2 
 
 		 347 aa  137  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.67066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1834  diguanylate cyclase  38.62 
 
 		 525 aa  137  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.245567  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0402  diguanylate cyclase  37.57 
 
 		 866 aa  137  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.362695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1025  diguanylate cyclase  40.36 
 
 		 492 aa  137  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1021  diguanylate cyclase  40.36 
 
 		 492 aa  137  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0128107  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2008  diguanylate cyclase  41.4 
 
 		 574 aa  137  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>