161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0315 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_0315  SARP family transcriptional regulator  100 
 
 		 648 aa  1231    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.658605  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0326  transcriptional regulator, SARP family  92.74 
 
 		 647 aa  995    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0337  transcriptional regulator, SARP family  92.89 
 
 		 647 aa  1013    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  42.71 
 
 		 1143 aa  441  9.999999999999999e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0243  transcriptional activator domain protein  42.9 
 
 		 1083 aa  373  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  35.33 
 
 		 1163 aa  243  6e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  31.14 
 
 		 1029 aa  174  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  28.92 
 
 		 1055 aa  154  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  29.51 
 
 		 1013 aa  151  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  29.07 
 
 		 1139 aa  145  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  27.26 
 
 		 1034 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  31.47 
 
 		 1075 aa  135  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  29.22 
 
 		 1067 aa  124  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  26.36 
 
 		 713 aa  120  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1630  SARP family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 1089 aa  119  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  29.63 
 
 		 494 aa  116  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  27.63 
 
 		 1126 aa  100  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  28 
 
 		 1190 aa  93.2  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  28.4 
 
 		 1193 aa  92.8  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  34.44 
 
 		 1056 aa  92.8  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 1064 aa  90.1  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  28.49 
 
 		 1141 aa  88.2  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1015  SARP family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 1216 aa  88.2  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2486  transcriptional regulator, SARP family  34.98 
 
 		 270 aa  85.9  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2409  transcriptional regulator, SARP family  37.96 
 
 		 244 aa  85.9  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374187  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  36.43 
 
 		 1044 aa  85.9  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  33.46 
 
 		 992 aa  84  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2832  transcriptional regulator, SARP family  30.75 
 
 		 1145 aa  84  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 636 aa  83.2  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  30.11 
 
 		 1109 aa  83.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 1116 aa  78.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1647  transcriptional regulator, SARP family  31 
 
 		 549 aa  77.8  0.0000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  29.91 
 
 		 1118 aa  77  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  29.91 
 
 		 1118 aa  77  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  26.68 
 
 		 1141 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  26.68 
 
 		 1141 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  26.96 
 
 		 1148 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2507  transcriptional activator domain-containing protein  34.55 
 
 		 275 aa  76.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0440426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 1141 aa  74.3  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  32.45 
 
 		 999 aa  73.9  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  34.71 
 
 		 1146 aa  71.6  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2581  transcriptional activator domain-containing protein  26.11 
 
 		 1183 aa  71.2  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 1151 aa  70.1  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  26.62 
 
 		 1264 aa  66.6  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  27.89 
 
 		 1682 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0072  transcriptional activator domain protein  27.98 
 
 		 1101 aa  66.2  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.713941  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2691  SARP family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 271 aa  65.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144834 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  26.36 
 
 		 927 aa  65.1  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1158  transcriptional regulator, SARP family  34.36 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000016652 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  28.05 
 
 		 1663 aa  64.3  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3681  SARP family transcriptional regulator  27 
 
 		 1217 aa  63.9  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134161  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  26.43 
 
 		 1398 aa  63.5  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  30.03 
 
 		 996 aa  63.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6036  transcriptional regulator, SARP family  32.41 
 
 		 650 aa  63.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0951775  normal  0.443759 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4971  transcriptional regulator, SARP family  33.19 
 
 		 261 aa  62.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.602293  normal  0.15867 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1963  transcriptional regulator, SARP family  32.51 
 
 		 248 aa  62  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0662749  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.05 
 
 		 1055 aa  61.6  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  27.62 
 
 		 1050 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.62 
 
 		 1050 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05450  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  32.2 
 
 		 907 aa  60.5  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3762  serine/threonine protein kinase  33.16 
 
 		 1192 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00167797  normal  0.557916 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1512  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  28.44 
 
 		 561 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  29.18 
 
 		 993 aa  59.7  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 1050 aa  58.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.95 
 
 		 1175 aa  58.9  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  29.92 
 
 		 1097 aa  57.8  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  27.54 
 
 		 1682 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  26.73 
 
 		 1668 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  24.94 
 
 		 1666 aa  57  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  29.15 
 
 		 1133 aa  55.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5519  serine/threonine protein kinase  26.07 
 
 		 1188 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7193  transcriptional regulator, SARP family  32.11 
 
 		 641 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0854307  normal  0.06484 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  25.91 
 
 		 1114 aa  55.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.41 
 
 		 1149 aa  55.1  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2258  SARP family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 647 aa  55.1  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0203775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2088  transcriptional regulator, SARP family  33.47 
 
 		 244 aa  55.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  31.84 
 
 		 926 aa  55.1  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 973 aa  54.7  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  29.8 
 
 		 952 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2653  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  26.47 
 
 		 572 aa  54.3  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.96 
 
 		 1087 aa  53.9  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  36.55 
 
 		 910 aa  53.9  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4017  transcriptional regulator, SARP family  29.44 
 
 		 535 aa  53.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00126088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.09 
 
 		 1053 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  26.12 
 
 		 1198 aa  52.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  29.33 
 
 		 1163 aa  53.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  32.45 
 
 		 1733 aa  52  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  26.34 
 
 		 1837 aa  52.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  29 
 
 		 967 aa  52.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  28.63 
 
 		 1100 aa  52.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3122  SARP family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 773 aa  51.6  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 621 aa  51.6  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1953  transcriptional activator domain protein  37.63 
 
 		 1083 aa  51.6  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247822 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  29.14 
 
 		 954 aa  52  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  22.07 
 
 		 1111 aa  51.2  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  24.24 
 
 		 723 aa  51.2  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  30.59 
 
 		 971 aa  50.8  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.69 
 
 		 1422 aa  50.8  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  26.37 
 
 		 1121 aa  51.2  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  29.58 
 
 		 943 aa  50.4  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>