88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2258 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2258  SARP family transcriptional regulator  100 
 
 		 647 aa  1326    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0203775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 636 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  31.17 
 
 		 713 aa  76.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2055  ATPase-like protein  30.92 
 
 		 1289 aa  73.2  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.125092  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 1116 aa  67  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7646  TPR repeat-containing protein  33.08 
 
 		 529 aa  64.3  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.158995  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2731  SARP family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 644 aa  63.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1647  transcriptional regulator, SARP family  29.46 
 
 		 549 aa  62.4  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  25.88 
 
 		 494 aa  62.4  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1299  hypothetical protein  33.56 
 
 		 644 aa  62.4  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135233  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2958  SARP family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 644 aa  62  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.30707  normal  0.853466 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6036  transcriptional regulator, SARP family  22.81 
 
 		 650 aa  60.8  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0951775  normal  0.443759 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7193  transcriptional regulator, SARP family  22.63 
 
 		 641 aa  60.8  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0854307  normal  0.06484 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  28.44 
 
 		 1055 aa  60.5  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.49 
 
 		 878 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  29.09 
 
 		 992 aa  58.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  29.07 
 
 		 1118 aa  58.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  29.07 
 
 		 1118 aa  58.2  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3925  SARP family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 528 aa  58.2  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3122  SARP family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 773 aa  57.4  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3806  SARP family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.57 
 
 		 810 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4194  SARP family transcriptional regulator  21.56 
 
 		 629 aa  57  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  28.4 
 
 		 1029 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  25.78 
 
 		 1034 aa  55.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  21.43 
 
 		 591 aa  54.3  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0078  transcriptional activator domain-containing protein  29.27 
 
 		 914 aa  54.3  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  31.32 
 
 		 1067 aa  54.3  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3421  response regulator receiver and SARP domain protein  28.51 
 
 		 300 aa  53.9  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1276  transcriptional regulator domain-containing protein  24.24 
 
 		 499 aa  54.3  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3460  transcriptional activator domain-containing protein  26.96 
 
 		 1061 aa  53.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0968  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 584 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1578  SARP family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 530 aa  52.8  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.584481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1956  transcriptional regulator domain protein  24.13 
 
 		 502 aa  51.6  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00706169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1697  SARP family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 349 aa  51.6  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000546308  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  28.79 
 
 		 1163 aa  51.2  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0666  protein kinase  34.04 
 
 		 889 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415154 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  25.53 
 
 		 1126 aa  50.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  28.45 
 
 		 1143 aa  50.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1736  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.62 
 
 		 737 aa  50.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5193  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.29 
 
 		 582 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117733  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1624  SARP family transcriptional regulator  21.4 
 
 		 349 aa  50.1  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0861  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 		 580 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  25.97 
 
 		 1013 aa  50.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0284  transcriptional regulator, SARP family  25.12 
 
 		 689 aa  50.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0233  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 911 aa  49.3  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 583 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1512  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  26.61 
 
 		 561 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  29.84 
 
 		 1075 aa  49.3  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2653  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  25.32 
 
 		 572 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2003  transcriptional regulator, SARP family  27.11 
 
 		 867 aa  48.9  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.228987  hitchhiker  0.0000000440234 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  22.84 
 
 		 573 aa  48.5  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  25 
 
 		 1050 aa  48.9  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5465  SARP family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 775 aa  48.9  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.36 
 
 		 880 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1384  putative adenylate cyclase  23.73 
 
 		 581 aa  48.1  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316041  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4892  transcriptional activator domain-containing protein  25.67 
 
 		 597 aa  47.4  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  27.51 
 
 		 1066 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0538  SARP family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 266 aa  46.6  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.224574  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2412  transcriptional regulator, SARP family  26.79 
 
 		 370 aa  47  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0744334 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  28.14 
 
 		 1109 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  22.44 
 
 		 634 aa  46.2  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2632  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.88 
 
 		 1385 aa  46.6  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5023  transcriptional regulator, SARP family  32.12 
 
 		 623 aa  45.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494336  normal  0.650955 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.19 
 
 		 632 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  24.3 
 
 		 1204 aa  45.8  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3528  SARP family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 539 aa  45.8  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1942  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 		 626 aa  45.4  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.420919 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0084  transcriptional activator domain  24.45 
 
 		 1071 aa  45.1  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5093  transcriptional regulator, SARP family  27.35 
 
 		 516 aa  45.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.093357  normal  0.464925 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 1064 aa  44.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2832  transcriptional regulator, SARP family  24.89 
 
 		 1145 aa  44.7  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1015  SARP family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 1216 aa  44.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 824 aa  44.7  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  23.7 
 
 		 745 aa  44.3  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  21.4 
 
 		 1111 aa  44.3  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7386  SARP family transcriptional regulator(alpha/beta hydrolase superfamily)  29.13 
 
 		 514 aa  44.3  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.18914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.6 
 
 		 397 aa  43.9  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  30.53 
 
 		 990 aa  44.3  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 		 1454 aa  43.9  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05450  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  23.69 
 
 		 907 aa  43.9  0.009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  36.62 
 
 		 957 aa  43.9  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  36.9 
 
 		 740 aa  43.9  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 		 1451 aa  43.9  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  29.25 
 
 		 566 aa  43.9  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1383  putative adenylate cyclase  22.77 
 
 		 603 aa  43.9  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0706  transcriptional regulator, CadC  33.33 
 
 		 479 aa  43.9  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303496  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  27.87 
 
 		 4079 aa  43.9  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>