More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2632 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_2240  hypothetical protein  34.85 
 
 
1400 aa  823    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.274881  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1994  TPR repeat-containing protein  34.37 
 
 
1400 aa  829    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1976  TPR repeat-containing protein  34.34 
 
 
1400 aa  817    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3132  tetratricopeptide repeat protein  35.06 
 
 
1400 aa  837    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0761546 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2322  tetratricopeptide repeat protein  34.63 
 
 
1400 aa  826    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.155443  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2185  tetratricopeptide repeat protein  35.27 
 
 
1400 aa  844    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2013  TPR repeat-containing protein  33.69 
 
 
1402 aa  801    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2200  tetratricopeptide repeat protein  34.39 
 
 
1400 aa  820    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000228728 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2632  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 
1385 aa  2779    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2025  hypothetical protein  37.71 
 
 
666 aa  466  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2026  TPR domain-containing protein  30.31 
 
 
708 aa  323  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137652  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  22.75 
 
 
878 aa  147  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.47 
 
 
810 aa  134  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  19.26 
 
 
1676 aa  110  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  20.43 
 
 
927 aa  100  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.59 
 
 
632 aa  100  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.58 
 
 
725 aa  92.8  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.62 
 
 
1056 aa  91.3  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  25.67 
 
 
847 aa  90.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  22.82 
 
 
1276 aa  89.4  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.5 
 
 
2240 aa  87.4  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.41 
 
 
818 aa  86.7  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  21.84 
 
 
4079 aa  85.9  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  23.3 
 
 
1694 aa  84.3  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.51 
 
 
1022 aa  81.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  19.91 
 
 
1297 aa  81.6  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.19 
 
 
624 aa  80.9  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.22 
 
 
784 aa  79.7  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  23.84 
 
 
729 aa  77.8  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  28.31 
 
 
626 aa  77.8  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  22.37 
 
 
934 aa  76.6  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.77 
 
 
988 aa  77  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  19.33 
 
 
3301 aa  76.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 
265 aa  75.1  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  22.91 
 
 
3145 aa  73.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.05 
 
 
689 aa  73.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  23.25 
 
 
795 aa  73.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  22.9 
 
 
567 aa  72.4  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  23.76 
 
 
622 aa  72.8  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  20.38 
 
 
887 aa  72  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  20.6 
 
 
1138 aa  71.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 
313 aa  71.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  26.34 
 
 
545 aa  70.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  28.37 
 
 
267 aa  70.5  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  20.9 
 
 
1737 aa  70.5  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  22.42 
 
 
3172 aa  70.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0049  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.99 
 
 
503 aa  69.7  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.492583  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 
808 aa  69.7  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  22.66 
 
 
1067 aa  69.3  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  20.92 
 
 
576 aa  69.3  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  22.03 
 
 
837 aa  68.9  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  23.32 
 
 
543 aa  68.9  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  22.82 
 
 
762 aa  68.6  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  21.37 
 
 
909 aa  67.8  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  24.16 
 
 
827 aa  68.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  25.34 
 
 
643 aa  67.8  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  25.66 
 
 
875 aa  67.8  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  20.27 
 
 
750 aa  68.2  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  21.82 
 
 
882 aa  67  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  21.85 
 
 
486 aa  67.4  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  28.78 
 
 
266 aa  66.6  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  26.51 
 
 
587 aa  67  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  21.96 
 
 
436 aa  66.6  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  21.35 
 
 
882 aa  66.6  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  22.2 
 
 
864 aa  66.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  23.88 
 
 
566 aa  66.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  26.5 
 
 
620 aa  65.9  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  26.38 
 
 
615 aa  65.5  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
649 aa  65.9  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
649 aa  65.9  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 
686 aa  65.5  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  27.35 
 
 
1154 aa  65.5  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  23.39 
 
 
505 aa  64.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.77 
 
 
784 aa  64.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  24.67 
 
 
646 aa  64.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 
435 aa  65.1  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0632  TPR repeat-containing protein  34.72 
 
 
198 aa  64.7  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 
573 aa  64.7  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  21.01 
 
 
733 aa  65.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  23.12 
 
 
884 aa  64.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0842  TPR repeat-containing protein  31.29 
 
 
201 aa  63.5  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  24.6 
 
 
1764 aa  64.3  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  23.59 
 
 
635 aa  63.5  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  24.07 
 
 
643 aa  64.3  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  20.46 
 
 
676 aa  64.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  22.07 
 
 
1069 aa  63.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  23.83 
 
 
265 aa  63.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  25.18 
 
 
620 aa  62.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.36 
 
 
265 aa  62.4  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 
614 aa  62.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  26.54 
 
 
626 aa  62.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  19.68 
 
 
1056 aa  62.4  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  28.52 
 
 
703 aa  62  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0959  TPR repeat-containing protein  31.94 
 
 
199 aa  62  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  22.67 
 
 
681 aa  62  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  23.08 
 
 
780 aa  62  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
162 aa  61.6  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  23.38 
 
 
685 aa  61.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  22.26 
 
 
750 aa  61.6  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  20.25 
 
 
614 aa  61.6  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>