89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2013 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS2025  hypothetical protein  78.98 
 
 
666 aa  1124    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2013  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
1402 aa  2877    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2322  tetratricopeptide repeat protein  77.53 
 
 
1400 aa  2264    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.155443  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2185  tetratricopeptide repeat protein  78.46 
 
 
1400 aa  2283    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3132  tetratricopeptide repeat protein  78.46 
 
 
1400 aa  2283    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0761546 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2200  tetratricopeptide repeat protein  77.37 
 
 
1400 aa  2248    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000228728 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2632  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.69 
 
 
1385 aa  768    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2240  hypothetical protein  78.1 
 
 
1400 aa  2267    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.274881  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1976  TPR repeat-containing protein  77.44 
 
 
1400 aa  2252    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2026  TPR domain-containing protein  75.63 
 
 
708 aa  1077    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1994  TPR repeat-containing protein  76.59 
 
 
1400 aa  2253    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  21 
 
 
1676 aa  77.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.33 
 
 
557 aa  65.9  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.63 
 
 
927 aa  61.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  22.64 
 
 
725 aa  59.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1796  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 
352 aa  59.3  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  21.38 
 
 
4079 aa  58.9  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  23.59 
 
 
878 aa  58.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  23.63 
 
 
543 aa  57.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.46 
 
 
818 aa  57.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  22.96 
 
 
576 aa  57  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  24.02 
 
 
804 aa  56.6  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.94 
 
 
2240 aa  56.6  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  22.08 
 
 
567 aa  56.2  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.69 
 
 
784 aa  55.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  23.04 
 
 
1694 aa  53.5  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  26.26 
 
 
587 aa  52.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23 
 
 
1737 aa  52.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  23.76 
 
 
827 aa  52.4  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0378  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.28 
 
 
545 aa  51.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.579733  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  24.56 
 
 
465 aa  51.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  24.16 
 
 
716 aa  51.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  20.38 
 
 
1069 aa  51.2  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  24.82 
 
 
480 aa  50.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.74 
 
 
836 aa  50.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.31 
 
 
1022 aa  51.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  18.34 
 
 
968 aa  50.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.23 
 
 
624 aa  50.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  25.49 
 
 
750 aa  49.7  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0297  TPR repeat-containing protein  24.59 
 
 
922 aa  49.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.276018  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  23.89 
 
 
635 aa  49.7  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  22.15 
 
 
832 aa  49.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  25 
 
 
545 aa  48.9  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  26.53 
 
 
795 aa  48.9  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  20.04 
 
 
617 aa  48.9  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 
605 aa  48.5  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2243  TPR repeat-containing protein  24.63 
 
 
311 aa  48.5  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6122  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  21.71 
 
 
245 aa  48.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3949  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 
361 aa  48.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1816  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.7 
 
 
174 aa  47.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.706847  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1955  TPR repeat-containing protein  24.63 
 
 
311 aa  48.5  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0490064  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3352  TPR repeat-containing protein  26.13 
 
 
404 aa  48.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000220615  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0750  glycosyl transferase, group 1  24.79 
 
 
773 aa  47.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  21.25 
 
 
402 aa  48.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  21.24 
 
 
676 aa  48.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3925  TPR repeat-containing protein  23.38 
 
 
1180 aa  48.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  21.7 
 
 
3145 aa  47.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  24.06 
 
 
614 aa  47.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0828  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.49 
 
 
335 aa  47.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.375671  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  25.62 
 
 
603 aa  47.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.18 
 
 
296 aa  47.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  22.82 
 
 
1979 aa  47  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  20.36 
 
 
626 aa  46.6  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0517  hypothetical protein  29.05 
 
 
1134 aa  46.6  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 
356 aa  46.6  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0600  TPR repeat-containing protein  22.58 
 
 
1112 aa  47  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.272318  normal  0.386774 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  19.76 
 
 
1276 aa  46.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  26.9 
 
 
883 aa  47  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  24.54 
 
 
1040 aa  46.6  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  21.82 
 
 
884 aa  46.2  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  21.6 
 
 
767 aa  46.2  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  24.62 
 
 
1297 aa  46.2  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  21.88 
 
 
810 aa  46.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0958  peptidase C39 bacteriocin processing  25.93 
 
 
164 aa  46.2  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000835793  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  22.42 
 
 
435 aa  45.8  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  21.75 
 
 
409 aa  45.8  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 
409 aa  45.8  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 
1085 aa  45.8  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0823  TPR repeat-containing protein  25.67 
 
 
502 aa  45.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  29.46 
 
 
809 aa  45.8  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  20.71 
 
 
393 aa  45.8  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.93 
 
 
639 aa  45.4  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.16 
 
 
572 aa  45.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  29.5 
 
 
699 aa  45.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1308  Flp pilus assembly protein TadD  24.64 
 
 
272 aa  45.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.59735e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3161  tetratricopeptide TPR_2  26.21 
 
 
444 aa  45.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  26.56 
 
 
622 aa  45.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1727  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 
280 aa  45.1  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000433623 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01444  TPR repeat protein  34.18 
 
 
937 aa  45.1  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0688079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>