More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3925 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3925  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1180 aa  2303    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3220  TPR repeat-containing protein  72.95 
 
 		 1178 aa  1598    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.166794 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0600  TPR repeat-containing protein  35.4 
 
 		 1112 aa  467  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.272318  normal  0.386774 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3469  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 		 1161 aa  323  9.999999999999999e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 		 878 aa  137  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  27.25 
 
 		 681 aa  135  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.66 
 
 		 810 aa  135  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25.5 
 
 		 725 aa  129  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  29.21 
 
 		 816 aa  129  5e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  27.25 
 
 		 685 aa  127  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  29.17 
 
 		 733 aa  124  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  25.96 
 
 		 3301 aa  121  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 909 aa  120  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 		 637 aa  115  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.4 
 
 		 2240 aa  115  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  24.22 
 
 		 676 aa  115  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25.26 
 
 		 1676 aa  114  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 		 3145 aa  113  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  25.3 
 
 		 764 aa  111  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.41 
 
 		 1737 aa  111  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.53 
 
 		 397 aa  110  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  26.1 
 
 		 1276 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  23.14 
 
 		 1979 aa  108  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 		 4079 aa  108  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  32.81 
 
 		 714 aa  108  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  26.38 
 
 		 828 aa  108  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  26.38 
 
 		 828 aa  108  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  26.52 
 
 		 795 aa  108  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.71 
 
 		 632 aa  108  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  25.09 
 
 		 622 aa  105  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  23.73 
 
 		 750 aa  105  5e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 		 649 aa  105  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.32 
 
 		 639 aa  102  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 		 362 aa  101  7e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  23.34 
 
 		 1421 aa  101  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 		 1694 aa  101  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  28.3 
 
 		 837 aa  100  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.89 
 
 		 1056 aa  99.8  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 		 594 aa  99.4  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 448 aa  97.4  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 		 847 aa  96.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 		 935 aa  96.7  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 		 750 aa  95.5  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.14 
 
 		 689 aa  95.5  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  25.56 
 
 		 887 aa  95.1  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  28.03 
 
 		 865 aa  94  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  21.27 
 
 		 1154 aa  94.4  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  24.94 
 
 		 706 aa  94  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  22.7 
 
 		 462 aa  94  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 		 566 aa  94  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  24.04 
 
 		 681 aa  93.6  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 486 aa  92.8  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.15 
 
 		 746 aa  92.4  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 		 612 aa  92  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  32.01 
 
 		 714 aa  92.4  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.36 
 
 		 1022 aa  91.7  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  24.84 
 
 		 936 aa  91.7  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.4 
 
 		 261 aa  91.3  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 260 aa  91.3  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  25.18 
 
 		 3172 aa  91.3  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  21.38 
 
 		 391 aa  89.7  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 		 955 aa  89.7  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 		 615 aa  89.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  21.73 
 
 		 1056 aa  89.4  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  30.24 
 
 		 626 aa  88.6  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.93 
 
 		 466 aa  88.6  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.5 
 
 		 265 aa  88.2  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 		 573 aa  88.2  9e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  29.54 
 
 		 828 aa  87.8  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  29.73 
 
 		 875 aa  87.8  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 		 1406 aa  87.8  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 762 aa  87  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 		 465 aa  87  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  21.41 
 
 		 833 aa  87  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  26.43 
 
 		 505 aa  87  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  23.71 
 
 		 934 aa  86.7  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 		 718 aa  86.3  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 		 750 aa  86.3  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 		 279 aa  85.9  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  29.66 
 
 		 620 aa  85.9  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  27.24 
 
 		 739 aa  85.9  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.67 
 
 		 624 aa  85.5  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 732 aa  85.1  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 968 aa  85.5  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.47 
 
 		 543 aa  85.5  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.8 
 
 		 471 aa  84.7  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  24.7 
 
 		 265 aa  84.3  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  28.57 
 
 		 820 aa  84  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  29.87 
 
 		 695 aa  83.2  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 		 311 aa  84  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  23.22 
 
 		 561 aa  84  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  25.43 
 
 		 780 aa  84  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0539  TPR repeat-containing protein  22.97 
 
 		 389 aa  84  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  23.42 
 
 		 706 aa  83.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 448 aa  83.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  31.62 
 
 		 535 aa  83.6  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  20.76 
 
 		 832 aa  84  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  25.52 
 
 		 1252 aa  83.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  28.73 
 
 		 614 aa  83.2  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  28.73 
 
 		 614 aa  83.2  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>