More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3213 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 
639 aa  1276    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  54.79 
 
 
673 aa  629  1e-179  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  47.58 
 
 
632 aa  534  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  47.74 
 
 
638 aa  496  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  47.41 
 
 
643 aa  484  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.38 
 
 
645 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000607684  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0616  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.21 
 
 
647 aa  462  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.1691e-34 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.6 
 
 
624 aa  318  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  39.05 
 
 
423 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  28.22 
 
 
1676 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1812  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.47 
 
 
406 aa  155  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.312909  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 
878 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 
1737 aa  145  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 
847 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  27.29 
 
 
936 aa  140  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.15 
 
 
810 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  25.29 
 
 
887 aa  136  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 
3301 aa  134  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  29.39 
 
 
718 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  31.7 
 
 
594 aa  128  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 
448 aa  128  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  27.13 
 
 
884 aa  126  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25.79 
 
 
725 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 
3145 aa  124  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.67 
 
 
1056 aa  121  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.31 
 
 
2240 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.48 
 
 
988 aa  118  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  27.48 
 
 
3172 aa  117  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.32 
 
 
632 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 
685 aa  116  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  29.53 
 
 
909 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.31 
 
 
818 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.68 
 
 
1022 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  24.21 
 
 
486 aa  114  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  23.83 
 
 
832 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.35 
 
 
1056 aa  111  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 
681 aa  109  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  23.78 
 
 
1486 aa  110  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  30.16 
 
 
789 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  24.22 
 
 
505 aa  109  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2400  TPR repeat-containing protein  25.43 
 
 
520 aa  108  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0031  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 
522 aa  107  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  26.39 
 
 
577 aa  107  7e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  24.76 
 
 
676 aa  107  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4211  TPR repeat-containing protein  24.7 
 
 
522 aa  107  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.185796 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  24.47 
 
 
573 aa  105  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  29.39 
 
 
362 aa  105  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  26.1 
 
 
577 aa  104  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  23.47 
 
 
1154 aa  104  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  28.03 
 
 
622 aa  104  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  28.22 
 
 
816 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.19 
 
 
784 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  26.54 
 
 
764 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  24.23 
 
 
729 aa  101  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  27.3 
 
 
837 aa  102  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 
594 aa  101  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 
649 aa  100  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.15 
 
 
689 aa  100  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 
637 aa  99.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  25.31 
 
 
561 aa  100  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  23.51 
 
 
733 aa  99  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  25 
 
 
561 aa  98.6  3e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  27.35 
 
 
827 aa  98.2  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  24.93 
 
 
808 aa  98.2  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  25.95 
 
 
1764 aa  98.2  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 
1406 aa  97.8  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  28.69 
 
 
824 aa  97.8  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3925  TPR repeat-containing protein  26.57 
 
 
1180 aa  97.4  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3220  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 
1178 aa  96.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.166794 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  23.09 
 
 
750 aa  96.3  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  24.37 
 
 
681 aa  96.7  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  24.7 
 
 
567 aa  95.9  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  27 
 
 
597 aa  96.3  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 
465 aa  95.9  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 
782 aa  96.3  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  25.24 
 
 
321 aa  95.9  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  25.94 
 
 
573 aa  95.1  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  28.22 
 
 
795 aa  95.1  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  25.39 
 
 
2262 aa  94.7  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 
2262 aa  94.4  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  23.83 
 
 
566 aa  94.7  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  29.88 
 
 
725 aa  94  8e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  24.25 
 
 
1138 aa  93.2  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 
766 aa  92.4  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3398  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 
274 aa  92.8  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0527752  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  21.15 
 
 
4079 aa  92.8  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  24.22 
 
 
573 aa  92.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 
828 aa  91.7  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  26.82 
 
 
955 aa  91.3  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  26.86 
 
 
714 aa  91.3  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 
828 aa  90.9  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  23.18 
 
 
1694 aa  90.5  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.09 
 
 
397 aa  90.5  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  24.38 
 
 
4489 aa  89.7  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  27.08 
 
 
883 aa  90.1  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 
776 aa  89.4  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24 
 
 
572 aa  89.4  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 
686 aa  89.7  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  24.75 
 
 
833 aa  89.4  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.78 
 
 
572 aa  89.4  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>