More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3220 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3925  TPR repeat-containing protein  72.95 
 
 		 1180 aa  1592    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3220  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1178 aa  2301    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.166794 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0600  TPR repeat-containing protein  37.1 
 
 		 1112 aa  500  1e-140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.272318  normal  0.386774 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3469  TPR repeat-containing protein  27.92 
 
 		 1161 aa  303  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.29 
 
 		 810 aa  132  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 		 878 aa  129  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  29.17 
 
 		 733 aa  125  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.61 
 
 		 725 aa  125  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  28.69 
 
 		 909 aa  122  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 		 681 aa  122  6e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  29.54 
 
 		 816 aa  119  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 		 685 aa  116  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 		 4079 aa  116  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  25.61 
 
 		 764 aa  115  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  24.93 
 
 		 795 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  24.23 
 
 		 1676 aa  113  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 		 1276 aa  113  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.9 
 
 		 1737 aa  111  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  25.65 
 
 		 3301 aa  108  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 		 3145 aa  109  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 		 828 aa  107  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 		 828 aa  107  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  21.15 
 
 		 750 aa  106  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 		 649 aa  106  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 362 aa  105  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  28.32 
 
 		 622 aa  103  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  31.27 
 
 		 714 aa  104  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 		 637 aa  103  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.57 
 
 		 397 aa  102  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  32.13 
 
 		 626 aa  101  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  28.29 
 
 		 615 aa  101  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  25.22 
 
 		 634 aa  101  9e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  29.62 
 
 		 505 aa  100  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  27.36 
 
 		 837 aa  100  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 714 aa  100  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  22.52 
 
 		 676 aa  100  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.74 
 
 		 639 aa  99.8  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.08 
 
 		 1056 aa  99  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  23.62 
 
 		 1421 aa  99  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.95 
 
 		 1022 aa  98.6  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 		 750 aa  97.4  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  24.71 
 
 		 1694 aa  97.8  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  26.49 
 
 		 887 aa  97.8  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 		 486 aa  96.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  23.46 
 
 		 594 aa  97.1  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.82 
 
 		 632 aa  96.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  28.24 
 
 		 620 aa  95.1  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.14 
 
 		 746 aa  94.7  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  20.82 
 
 		 1979 aa  94  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.17 
 
 		 818 aa  94  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.65 
 
 		 1056 aa  94  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  23.72 
 
 		 391 aa  94  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 847 aa  93.6  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  26.37 
 
 		 935 aa  93.2  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.34 
 
 		 2240 aa  92.8  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  26.74 
 
 		 706 aa  93.2  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 		 448 aa  93.2  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 		 311 aa  92.8  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 		 566 aa  92.4  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 614 aa  92  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  29.81 
 
 		 626 aa  91.7  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  23.59 
 
 		 934 aa  91.7  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  24.52 
 
 		 3172 aa  91.3  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  29.58 
 
 		 739 aa  90.9  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  23.06 
 
 		 462 aa  91.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  29.54 
 
 		 626 aa  90.5  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  29.54 
 
 		 614 aa  90.5  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  29.54 
 
 		 614 aa  90.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  29.54 
 
 		 614 aa  90.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  25.97 
 
 		 865 aa  90.1  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  28.09 
 
 		 1154 aa  90.5  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  24.15 
 
 		 827 aa  89.7  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.09 
 
 		 738 aa  89.7  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.73 
 
 		 863 aa  89.4  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  29.54 
 
 		 614 aa  89  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  25.11 
 
 		 279 aa  88.6  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.48 
 
 		 927 aa  88.2  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 		 313 aa  88.2  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 		 620 aa  88.2  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.26 
 
 		 988 aa  88.2  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  26.07 
 
 		 392 aa  87.8  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.61 
 
 		 784 aa  87.8  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  24.1 
 
 		 448 aa  87.8  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.28 
 
 		 689 aa  87.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 		 1252 aa  86.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 		 766 aa  85.9  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  22.97 
 
 		 864 aa  85.1  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 		 968 aa  85.5  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  27.82 
 
 		 718 aa  85.5  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.52 
 
 		 466 aa  85.1  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  30.5 
 
 		 703 aa  85.1  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 		 260 aa  85.1  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.69 
 
 		 261 aa  85.1  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 789 aa  84.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  30.05 
 
 		 875 aa  84.3  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 2262 aa  84.3  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 		 465 aa  84  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  23.91 
 
 		 725 aa  84  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  25.67 
 
 		 824 aa  83.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  20.9 
 
 		 860 aa  84  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>