More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1127 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 725 aa  1436    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 		 878 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.4 
 
 		 810 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  24.2 
 
 		 1676 aa  118  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  24.79 
 
 		 562 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 		 681 aa  114  6e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.12 
 
 		 2240 aa  109  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  30.74 
 
 		 362 aa  107  7e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  22.93 
 
 		 750 aa  107  9e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  25.75 
 
 		 909 aa  106  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 		 505 aa  106  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.84 
 
 		 988 aa  105  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  28.62 
 
 		 649 aa  105  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  24.81 
 
 		 847 aa  103  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.35 
 
 		 632 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  22.18 
 
 		 1421 aa  101  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 685 aa  100  8e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  24.58 
 
 		 795 aa  98.6  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  24.72 
 
 		 936 aa  99  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  22.83 
 
 		 4079 aa  97.4  8e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.94 
 
 		 1737 aa  95.5  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  26.64 
 
 		 708 aa  95.1  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  24.34 
 
 		 1276 aa  94.7  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.46 
 
 		 1022 aa  94.7  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  26.63 
 
 		 816 aa  94.4  7e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.09 
 
 		 1056 aa  93.6  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.72 
 
 		 543 aa  93.6  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.41 
 
 		 1056 aa  94  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.55 
 
 		 818 aa  92.4  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  23.96 
 
 		 730 aa  92.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  26.62 
 
 		 887 aa  91.7  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  28.26 
 
 		 865 aa  91.7  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 		 3035 aa  91.7  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  24.91 
 
 		 711 aa  91.7  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.08 
 
 		 639 aa  90.5  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  22.63 
 
 		 366 aa  89.7  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  24.47 
 
 		 733 aa  89.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  27.54 
 
 		 620 aa  89.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 		 1094 aa  89.7  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  22.87 
 
 		 566 aa  89.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.5 
 
 		 3145 aa  89.7  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  25 
 
 		 837 aa  89  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  23.54 
 
 		 935 aa  89  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 		 352 aa  88.6  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  25.13 
 
 		 462 aa  88.2  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.99 
 
 		 707 aa  87.8  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  22.58 
 
 		 576 aa  87.4  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 		 637 aa  87.4  9e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  24.93 
 
 		 4489 aa  86.7  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  27.06 
 
 		 808 aa  87  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.26 
 
 		 689 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.81 
 
 		 784 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  24.92 
 
 		 626 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  24.28 
 
 		 955 aa  85.1  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.42 
 
 		 927 aa  84.7  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  28.94 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  23.96 
 
 		 620 aa  84.3  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 		 450 aa  84.3  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 		 402 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.74 
 
 		 397 aa  83.6  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 		 1069 aa  82.8  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  24.14 
 
 		 1013 aa  82.8  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 		 804 aa  82.8  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  23.44 
 
 		 767 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  22.8 
 
 		 573 aa  82  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3220  TPR repeat-containing protein  23.91 
 
 		 1178 aa  82.4  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.166794 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  25.76 
 
 		 764 aa  82.4  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  23.28 
 
 		 2262 aa  81.6  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  24.37 
 
 		 561 aa  82  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  24.3 
 
 		 577 aa  81.3  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  27.38 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  23.32 
 
 		 725 aa  81.6  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  23.04 
 
 		 1694 aa  81.6  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 		 750 aa  81.3  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 673 aa  80.9  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  21.71 
 
 		 486 aa  80.9  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  24.3 
 
 		 577 aa  80.1  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  24.05 
 
 		 561 aa  80.5  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0031  TPR repeat-containing protein  23.56 
 
 		 522 aa  80.1  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  24.44 
 
 		 594 aa  80.5  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  26.88 
 
 		 875 aa  80.1  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  23.11 
 
 		 573 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  23.82 
 
 		 448 aa  80.5  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 		 523 aa  80.5  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  23.71 
 
 		 614 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 		 356 aa  79.7  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  26.74 
 
 		 395 aa  79.7  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  23.71 
 
 		 626 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  21.88 
 
 		 2262 aa  79.7  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  24.84 
 
 		 1486 aa  79.7  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  22.92 
 
 		 3172 aa  79.7  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 		 761 aa  79.3  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  23.15 
 
 		 573 aa  79  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4211  TPR repeat-containing protein  23.59 
 
 		 522 aa  79  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.185796 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  23.37 
 
 		 792 aa  79  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  21.05 
 
 		 448 aa  79  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 		 739 aa  78.6  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 		 612 aa  78.6  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  26.08 
 
 		 632 aa  78.6  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  24.92 
 
 		 617 aa  78.6  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>