More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0516 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 673 aa  1368    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  54.99 
 
 		 639 aa  632  1e-180  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  46.74 
 
 		 632 aa  531  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  44.88 
 
 		 638 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.09 
 
 		 645 aa  464  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000607684  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0616  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.65 
 
 		 647 aa  463  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.1691e-34 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  44.21 
 
 		 643 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.87 
 
 		 624 aa  332  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  38.91 
 
 		 423 aa  228  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  24.52 
 
 		 1676 aa  160  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1812  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.69 
 
 		 406 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.312909  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  23.26 
 
 		 887 aa  136  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 		 878 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.04 
 
 		 2240 aa  125  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.52 
 
 		 810 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0031  TPR repeat-containing protein  25.42 
 
 		 522 aa  121  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.15 
 
 		 1737 aa  121  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  24.6 
 
 		 936 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  26.38 
 
 		 725 aa  118  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  23.29 
 
 		 486 aa  118  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4211  TPR repeat-containing protein  25.12 
 
 		 522 aa  118  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.185796 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  24.45 
 
 		 847 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  23.33 
 
 		 3172 aa  114  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  25.27 
 
 		 1486 aa  110  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 		 3145 aa  109  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2400  TPR repeat-containing protein  23.99 
 
 		 520 aa  108  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  25.36 
 
 		 909 aa  105  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  26.42 
 
 		 676 aa  105  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.67 
 
 		 632 aa  104  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  24.14 
 
 		 3301 aa  104  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  23.04 
 
 		 448 aa  104  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  24.14 
 
 		 927 aa  103  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 		 681 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.13 
 
 		 1056 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  27.54 
 
 		 594 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.26 
 
 		 1022 aa  101  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.05 
 
 		 988 aa  101  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  27.32 
 
 		 1694 aa  100  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.02 
 
 		 818 aa  100  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  22.65 
 
 		 1154 aa  100  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  26.88 
 
 		 764 aa  100  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 		 714 aa  98.6  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  30.27 
 
 		 685 aa  97.4  8e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0730  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 		 518 aa  97.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.444597  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  25 
 
 		 837 aa  96.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  27.13 
 
 		 714 aa  97.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.34 
 
 		 4079 aa  95.9  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  22.61 
 
 		 567 aa  95.5  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  30.2 
 
 		 789 aa  95.5  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 		 2262 aa  94.7  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  26.83 
 
 		 321 aa  94.7  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.31 
 
 		 1056 aa  94.4  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 		 362 aa  93.2  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  21.87 
 
 		 681 aa  92.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  21.78 
 
 		 833 aa  92  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 718 aa  92  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  21.72 
 
 		 832 aa  92.4  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  23.14 
 
 		 505 aa  92  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  24.24 
 
 		 594 aa  91.7  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  22.54 
 
 		 1067 aa  90.9  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.11 
 
 		 784 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 2262 aa  90.1  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  25 
 
 		 884 aa  90.1  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  23.91 
 
 		 1276 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 		 649 aa  89.7  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  22.42 
 
 		 750 aa  89  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  27.39 
 
 		 465 aa  88.6  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  23.06 
 
 		 573 aa  88.6  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  24.48 
 
 		 1138 aa  88.2  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.83 
 
 		 397 aa  88.6  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  26.84 
 
 		 733 aa  88.6  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  25.72 
 
 		 562 aa  88.2  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  25.1 
 
 		 622 aa  88.2  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.49 
 
 		 689 aa  87.8  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  30.16 
 
 		 340 aa  86.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 		 1406 aa  87  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  29.22 
 
 		 545 aa  86.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.94 
 
 		 566 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  25.29 
 
 		 739 aa  85.9  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  28.71 
 
 		 267 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  26.44 
 
 		 3035 aa  85.5  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  23.8 
 
 		 4489 aa  85.5  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  22.88 
 
 		 573 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  24.14 
 
 		 808 aa  85.5  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  24.49 
 
 		 648 aa  85.5  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 		 711 aa  85.1  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  27.92 
 
 		 543 aa  84.3  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  28.4 
 
 		 725 aa  84.3  0.000000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0662  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.11 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0114263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.82 
 
 		 572 aa  84  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  26.3 
 
 		 637 aa  83.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  23.01 
 
 		 729 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  23.26 
 
 		 573 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  24.37 
 
 		 561 aa  83.6  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0446  TPR repeat-containing protein  25.28 
 
 		 377 aa  83.6  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.021695 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.36 
 
 		 572 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  24.74 
 
 		 566 aa  82.8  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  24.6 
 
 		 448 aa  82.8  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  24.37 
 
 		 561 aa  83.2  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  24.15 
 
 		 573 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>