More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0215 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
2262 aa  4385    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  78.3 
 
 
2262 aa  3090    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26 
 
 
2240 aa  561  1e-158  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.46 
 
 
4079 aa  265  1e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  23.85 
 
 
1676 aa  258  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  23.91 
 
 
1694 aa  220  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.55 
 
 
878 aa  194  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.52 
 
 
810 aa  182  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.95 
 
 
1737 aa  177  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  23.94 
 
 
3172 aa  157  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  21.73 
 
 
927 aa  151  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  19.5 
 
 
3301 aa  147  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.71 
 
 
1056 aa  144  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  26.65 
 
 
909 aa  140  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0626  tetratricopeptide TPR_2  19.28 
 
 
2059 aa  139  7.000000000000001e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00762464 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 
685 aa  133  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.45 
 
 
632 aa  133  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.41 
 
 
818 aa  134  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  24.21 
 
 
1069 aa  133  5.0000000000000004e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25.19 
 
 
725 aa  132  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 
681 aa  131  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  21.82 
 
 
887 aa  130  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  22.05 
 
 
1049 aa  129  6e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  26.96 
 
 
816 aa  129  7e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  23.93 
 
 
1276 aa  129  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  20.97 
 
 
1154 aa  129  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.88 
 
 
1056 aa  126  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 
486 aa  126  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  21.07 
 
 
1486 aa  122  7e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.86 
 
 
1022 aa  121  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  27.45 
 
 
795 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 
3145 aa  121  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.58 
 
 
988 aa  119  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 
450 aa  118  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 
566 aa  118  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  23.56 
 
 
634 aa  117  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  21.44 
 
 
1297 aa  116  4.0000000000000004e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  22 
 
 
1421 aa  116  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  21.76 
 
 
1979 aa  116  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  25.42 
 
 
865 aa  116  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  22 
 
 
1067 aa  116  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 
847 aa  116  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 
792 aa  115  7.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  25.45 
 
 
733 aa  115  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  31.56 
 
 
626 aa  115  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  29.06 
 
 
620 aa  115  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  26.13 
 
 
637 aa  114  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  31.56 
 
 
626 aa  114  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  31.56 
 
 
614 aa  114  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  27.87 
 
 
620 aa  114  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  23.52 
 
 
643 aa  113  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 
828 aa  112  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
614 aa  111  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  19.75 
 
 
1056 aa  112  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  32.13 
 
 
789 aa  112  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  31.25 
 
 
614 aa  111  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  31.25 
 
 
614 aa  111  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
562 aa  111  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  24.71 
 
 
837 aa  111  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  31.25 
 
 
626 aa  111  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  31.04 
 
 
828 aa  110  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 
614 aa  110  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  22.65 
 
 
1213 aa  110  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.41 
 
 
784 aa  111  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.57 
 
 
689 aa  109  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  23.38 
 
 
543 aa  109  8e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  27.16 
 
 
603 aa  108  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  26.5 
 
 
681 aa  108  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  32.78 
 
 
754 aa  107  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 
362 aa  107  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 
576 aa  107  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  23.94 
 
 
614 aa  107  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 
3035 aa  107  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.08 
 
 
784 aa  107  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  25.07 
 
 
764 aa  106  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  20.18 
 
 
750 aa  105  8e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  23.38 
 
 
462 aa  105  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
597 aa  105  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
612 aa  105  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 
573 aa  105  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  29.78 
 
 
636 aa  104  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  24.34 
 
 
936 aa  103  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  23.82 
 
 
577 aa  103  5e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 
739 aa  103  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  25.81 
 
 
622 aa  103  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  23.82 
 
 
577 aa  102  7e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 
639 aa  102  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  22.51 
 
 
934 aa  102  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  21.95 
 
 
732 aa  102  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  22.65 
 
 
676 aa  102  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  22.97 
 
 
573 aa  101  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  26.15 
 
 
864 aa  100  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  30.94 
 
 
637 aa  100  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 
612 aa  100  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 
750 aa  100  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  30.57 
 
 
875 aa  100  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  30.15 
 
 
714 aa  100  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  22.76 
 
 
448 aa  100  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  26.15 
 
 
594 aa  100  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  20.2 
 
 
832 aa  100  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>