More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3197 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  100 
 
 
395 aa  804    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  38.86 
 
 
732 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  37.38 
 
 
795 aa  255  9e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3194  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  36.13 
 
 
349 aa  186  6e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.756541  hitchhiker  0.0088423 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  37.36 
 
 
681 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  33.78 
 
 
816 aa  182  7e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  36.06 
 
 
685 aa  172  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  31.29 
 
 
909 aa  172  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  36.96 
 
 
637 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  33.07 
 
 
362 aa  156  8e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  33.88 
 
 
878 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 
810 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  31.72 
 
 
865 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 
714 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  30.03 
 
 
725 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  31.17 
 
 
714 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 
739 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 
750 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 
847 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  31.66 
 
 
543 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  27.82 
 
 
603 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  32.4 
 
 
4489 aa  124  4e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  30.29 
 
 
620 aa  122  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
612 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 
505 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  30.29 
 
 
620 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  29.68 
 
 
927 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.82 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.75 
 
 
632 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  31.05 
 
 
366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  30.82 
 
 
626 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 
1094 aa  117  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  34.98 
 
 
649 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  34.98 
 
 
649 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  34.98 
 
 
646 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
968 aa  115  8.999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 
1276 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 
3145 aa  114  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  30.31 
 
 
3035 aa  113  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
715 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 
615 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  28.85 
 
 
626 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 
614 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 
955 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 
718 aa  110  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  30.34 
 
 
875 aa  109  7.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  29.15 
 
 
1406 aa  109  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  28.52 
 
 
626 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  28.52 
 
 
614 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  28.52 
 
 
614 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  28.52 
 
 
614 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.58 
 
 
1737 aa  107  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  30.92 
 
 
1694 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 
639 aa  105  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
602 aa  105  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.93 
 
 
739 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  34.22 
 
 
437 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 
935 aa  104  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 
583 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7095  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.02 
 
 
354 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.524118  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 
612 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  29.58 
 
 
4079 aa  102  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 
448 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 
766 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  36.26 
 
 
542 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 
374 aa  101  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25.74 
 
 
1676 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 
3172 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  30.58 
 
 
623 aa  101  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  28.52 
 
 
3560 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  31.92 
 
 
824 aa  100  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 
636 aa  100  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  27.18 
 
 
1979 aa  99  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 
740 aa  99.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  31.16 
 
 
601 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 
808 aa  99.4  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 
448 aa  98.6  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 
662 aa  97.8  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  29.18 
 
 
614 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  30.87 
 
 
608 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  30.5 
 
 
635 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  30.5 
 
 
635 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 
617 aa  96.7  6e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  29.91 
 
 
340 aa  96.7  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  28.11 
 
 
3301 aa  96.3  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  33.21 
 
 
795 aa  95.9  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.4 
 
 
565 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  30.12 
 
 
611 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  27.91 
 
 
561 aa  95.1  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  27.91 
 
 
561 aa  95.1  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0815  TPR repeat-containing protein  32.93 
 
 
235 aa  94.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0605859  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  32.48 
 
 
594 aa  94  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  32.66 
 
 
465 aa  94  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  29.64 
 
 
637 aa  93.2  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 
711 aa  93.6  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.7 
 
 
586 aa  93.2  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 
708 aa  93.2  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 
1085 aa  92.8  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 
323 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 
562 aa  91.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>