More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4282 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
715 aa  1414    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4326  TPR repeat-containing protein  49.71 
 
 
790 aa  514  1e-144  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  46.05 
 
 
795 aa  489  1e-136  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  43.59 
 
 
645 aa  480  1e-134  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  43.65 
 
 
744 aa  441  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0599  TPR repeat-containing protein  41.92 
 
 
748 aa  411  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.709055 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  34.24 
 
 
879 aa  371  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2410  TPR repeat-containing protein  34.85 
 
 
648 aa  340  5e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1408  TPR repeat-containing protein  35.65 
 
 
759 aa  333  5e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1274  TPR repeat-containing protein  35.67 
 
 
559 aa  293  6e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1542  TPR repeat-containing protein  36.2 
 
 
534 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00030715  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  28.27 
 
 
686 aa  186  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 
776 aa  180  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 
827 aa  172  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.41 
 
 
810 aa  171  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 
643 aa  169  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  31.05 
 
 
878 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  35.06 
 
 
865 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 
762 aa  160  9e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
681 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.23 
 
 
576 aa  152  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.86 
 
 
632 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  33.33 
 
 
1694 aa  142  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4471  tetratricopeptide TPR_4  31.78 
 
 
598 aa  141  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.623043 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  30.92 
 
 
685 aa  139  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 
686 aa  137  5e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  32.94 
 
 
362 aa  135  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 
1276 aa  135  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 
589 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  26.33 
 
 
792 aa  134  6e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 
4489 aa  134  6e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  36.43 
 
 
714 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1114  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.9 
 
 
641 aa  134  7.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  31.32 
 
 
816 aa  133  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.69 
 
 
3145 aa  133  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  31.86 
 
 
637 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  36.25 
 
 
828 aa  132  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3794  TPR repeat-containing protein  25.67 
 
 
657 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  35.86 
 
 
828 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  32.79 
 
 
718 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  30.04 
 
 
3035 aa  127  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  37.18 
 
 
714 aa  127  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
543 aa  127  7e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  33.46 
 
 
732 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  36.44 
 
 
620 aa  124  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 
909 aa  124  7e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  35.63 
 
 
620 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  35.56 
 
 
615 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  30.29 
 
 
603 aa  122  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 
1094 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  36.78 
 
 
626 aa  120  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  29.22 
 
 
764 aa  120  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  29.22 
 
 
622 aa  120  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.76 
 
 
397 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1840  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
657 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.829292 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 
597 aa  119  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.66 
 
 
1022 aa  118  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  24.06 
 
 
3301 aa  116  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.02 
 
 
1737 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 
505 aa  116  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  38.78 
 
 
700 aa  115  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  27.92 
 
 
3560 aa  115  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.71 
 
 
689 aa  115  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  35.95 
 
 
626 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  35.95 
 
 
614 aa  114  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.24 
 
 
927 aa  114  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  36.68 
 
 
614 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  36.68 
 
 
626 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  36.68 
 
 
614 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  36.68 
 
 
614 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  36.68 
 
 
614 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  26.48 
 
 
725 aa  113  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  30.77 
 
 
395 aa  112  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 
486 aa  111  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  25.16 
 
 
593 aa  111  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 
740 aa  110  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 
612 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  28.1 
 
 
733 aa  110  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  26.19 
 
 
745 aa  110  8.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  23.93 
 
 
3172 aa  110  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.67 
 
 
988 aa  110  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7095  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.01 
 
 
354 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.524118  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 
739 aa  109  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  32.78 
 
 
639 aa  110  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  25.54 
 
 
676 aa  110  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  25.78 
 
 
356 aa  109  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  31.35 
 
 
789 aa  109  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  31.47 
 
 
4079 aa  108  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  27.42 
 
 
875 aa  108  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  37.34 
 
 
635 aa  107  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  37.34 
 
 
635 aa  107  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  30.32 
 
 
512 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  26.79 
 
 
573 aa  107  6e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 
515 aa  107  6e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  33.19 
 
 
828 aa  107  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  36.42 
 
 
1005 aa  107  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  34.23 
 
 
833 aa  107  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  35.95 
 
 
636 aa  107  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  30.77 
 
 
1979 aa  106  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 
766 aa  106  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>