More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3198 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
645 aa  1296    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  53.55 
 
 
795 aa  618  1e-175  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0599  TPR repeat-containing protein  51.09 
 
 
748 aa  519  1e-146  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.709055 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  43.09 
 
 
715 aa  459  9.999999999999999e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4326  TPR repeat-containing protein  45.58 
 
 
790 aa  459  9.999999999999999e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  46.25 
 
 
744 aa  435  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2410  TPR repeat-containing protein  35.41 
 
 
648 aa  324  3e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  33.53 
 
 
879 aa  320  5e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1274  TPR repeat-containing protein  39.12 
 
 
559 aa  294  3e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1408  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 
759 aa  266  7e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1542  TPR repeat-containing protein  34.59 
 
 
534 aa  250  7e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00030715  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 
686 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  29.26 
 
 
643 aa  179  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 
686 aa  169  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.43 
 
 
576 aa  164  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  28.59 
 
 
776 aa  156  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 
762 aa  150  5e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 
589 aa  150  5e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1114  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.94 
 
 
641 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4471  tetratricopeptide TPR_4  32.06 
 
 
598 aa  141  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.623043 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  33.63 
 
 
878 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.86 
 
 
810 aa  134  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  28.31 
 
 
766 aa  132  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  24.21 
 
 
827 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.5 
 
 
632 aa  131  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 
587 aa  128  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  37.17 
 
 
847 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 
593 aa  121  4.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  33.19 
 
 
685 aa  120  9e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  23.74 
 
 
792 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2508  TPR domain-containing protein  29.26 
 
 
559 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.849467  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 
362 aa  119  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0584  hypothetical protein  29.25 
 
 
546 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2470  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 
581 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  32.59 
 
 
681 aa  114  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 
909 aa  114  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1451  TPR repeat-containing protein  24.74 
 
 
585 aa  114  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  35.18 
 
 
725 aa  110  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  36.84 
 
 
875 aa  109  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  30.8 
 
 
637 aa  109  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  29.69 
 
 
816 aa  108  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  32.84 
 
 
626 aa  108  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 
739 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 
626 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 
626 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
614 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 
614 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
614 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 
614 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
614 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3602  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 
556 aa  104  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0222501 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  36.62 
 
 
1694 aa  103  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  33.93 
 
 
828 aa  103  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  33.93 
 
 
828 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
718 aa  102  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1112  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.81 
 
 
536 aa  102  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  33.46 
 
 
620 aa  100  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  33 
 
 
392 aa  100  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  29.14 
 
 
795 aa  99.8  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3244  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.76 
 
 
699 aa  99  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 
605 aa  98.2  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 
3145 aa  98.2  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1897  TPR repeat-containing protein  35.61 
 
 
268 aa  98.2  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0935119 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  31.8 
 
 
732 aa  97.8  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 
639 aa  97.4  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  34.2 
 
 
714 aa  97.8  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  32.69 
 
 
620 aa  97.4  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 
3035 aa  97.1  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 
1276 aa  97.1  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 
612 aa  97.1  9e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 
750 aa  97.1  9e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  33.88 
 
 
615 aa  96.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  33.07 
 
 
636 aa  95.9  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  32.68 
 
 
612 aa  95.5  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.9 
 
 
406 aa  94.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  29.41 
 
 
764 aa  94.7  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  30.8 
 
 
4489 aa  94.7  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.9 
 
 
406 aa  94.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 
3172 aa  94.7  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  32.72 
 
 
824 aa  94.4  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  31.47 
 
 
865 aa  93.6  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  29.85 
 
 
603 aa  93.2  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  27.95 
 
 
622 aa  93.2  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.44 
 
 
1056 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  38.29 
 
 
833 aa  92.8  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  26.16 
 
 
352 aa  92  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28 
 
 
988 aa  91.7  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  30.04 
 
 
637 aa  91.3  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.33 
 
 
1022 aa  91.3  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 
594 aa  90.5  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 
649 aa  89.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 
611 aa  88.6  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  26.59 
 
 
3301 aa  88.6  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.53 
 
 
397 aa  88.2  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1321  TPR repeat-containing protein  22.91 
 
 
638 aa  88.2  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.002861  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.82 
 
 
1737 aa  88.2  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 
573 aa  87.4  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  35.26 
 
 
1406 aa  87.4  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  33.78 
 
 
714 aa  87.4  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  31.25 
 
 
733 aa  87.4  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>