More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4326 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4326  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
790 aa  1556    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  49.93 
 
 
715 aa  543  1e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  42.06 
 
 
795 aa  540  9.999999999999999e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  45.59 
 
 
645 aa  516  1.0000000000000001e-145  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  43.03 
 
 
744 aa  459  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0599  TPR repeat-containing protein  42.06 
 
 
748 aa  435  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.709055 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  33.42 
 
 
879 aa  372  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1408  TPR repeat-containing protein  36.18 
 
 
759 aa  332  2e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2410  TPR repeat-containing protein  35.28 
 
 
648 aa  319  1e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1274  TPR repeat-containing protein  37.96 
 
 
559 aa  293  7e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1542  TPR repeat-containing protein  34.91 
 
 
534 aa  277  6e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00030715  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 
776 aa  178  4e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  28.25 
 
 
686 aa  166  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  26.43 
 
 
827 aa  167  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  35.04 
 
 
878 aa  165  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 
762 aa  160  8e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.05 
 
 
810 aa  157  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4471  tetratricopeptide TPR_4  31.55 
 
 
598 aa  154  5e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.623043 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.32 
 
 
576 aa  153  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 
686 aa  139  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  26.65 
 
 
643 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  27.29 
 
 
589 aa  135  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  24.45 
 
 
792 aa  134  6e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 
909 aa  130  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.31 
 
 
632 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  31.64 
 
 
1694 aa  123  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  32.25 
 
 
1276 aa  122  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  24.6 
 
 
587 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 
847 aa  118  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  33.15 
 
 
714 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  26.98 
 
 
816 aa  115  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 
1094 aa  114  6e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  27.93 
 
 
1737 aa  112  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  27.44 
 
 
795 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 
615 aa  111  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 
685 aa  110  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 
714 aa  110  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 
593 aa  108  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  33.44 
 
 
620 aa  108  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  33.44 
 
 
620 aa  108  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 
566 aa  107  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 
3172 aa  105  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  30.79 
 
 
764 aa  104  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.11 
 
 
725 aa  104  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1114  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.67 
 
 
641 aa  103  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 
486 aa  103  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  28.49 
 
 
3035 aa  103  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  28.62 
 
 
573 aa  102  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 
505 aa  101  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.07 
 
 
3145 aa  101  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  30.51 
 
 
865 aa  99.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 
681 aa  98.6  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 
362 aa  98.2  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.32 
 
 
784 aa  98.2  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28.53 
 
 
4489 aa  98.2  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0584  hypothetical protein  26.72 
 
 
546 aa  97.8  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  30.79 
 
 
824 aa  97.8  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  33.58 
 
 
614 aa  96.3  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  33.58 
 
 
614 aa  96.3  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  33.21 
 
 
626 aa  96.3  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  24.93 
 
 
3301 aa  95.9  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 
614 aa  96.3  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  33.58 
 
 
626 aa  95.9  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 
392 aa  95.5  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  33.58 
 
 
626 aa  95.5  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 
614 aa  95.5  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  33.62 
 
 
789 aa  95.1  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  26.95 
 
 
1154 aa  95.1  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
602 aa  95.1  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  30.2 
 
 
808 aa  94.7  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  31.1 
 
 
612 aa  93.6  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  30.5 
 
 
750 aa  94  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
3560 aa  93.2  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.51 
 
 
1056 aa  93.6  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.98 
 
 
988 aa  91.7  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1404  hypothetical protein  26.44 
 
 
571 aa  90.9  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.35845 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.26 
 
 
689 aa  91.3  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.59 
 
 
927 aa  90.9  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 
732 aa  90.9  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 
740 aa  90.5  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  33.5 
 
 
875 aa  90.1  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 
828 aa  90.5  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 
955 aa  89.7  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  30.46 
 
 
828 aa  89.4  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  26.8 
 
 
732 aa  89  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 
465 aa  89  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  27.56 
 
 
622 aa  89  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  28.91 
 
 
603 aa  89  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.52 
 
 
1022 aa  87.8  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  25.87 
 
 
1421 aa  87.8  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  29.64 
 
 
637 aa  87.4  9e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.21 
 
 
818 aa  87  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  31.09 
 
 
639 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  31.44 
 
 
718 aa  87.4  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1451  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
585 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  30.79 
 
 
828 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 
597 aa  86.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.5 
 
 
2240 aa  86.3  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  34.18 
 
 
605 aa  85.1  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  38.76 
 
 
556 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>