More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2626 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
587 aa  1200    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  36.45 
 
 
589 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.4 
 
 
576 aa  301  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
593 aa  277  4e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1451  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 
585 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  32.11 
 
 
686 aa  243  9e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  29.5 
 
 
643 aa  238  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  30.02 
 
 
686 aa  231  3e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1114  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.4 
 
 
641 aa  204  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2470  TPR repeat-containing protein  31.55 
 
 
581 aa  182  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  29.26 
 
 
776 aa  148  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  26.27 
 
 
762 aa  137  5e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0588  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 
613 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 
645 aa  132  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1112  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.55 
 
 
536 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2508  TPR domain-containing protein  26.31 
 
 
559 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.849467  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  25.87 
 
 
792 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0584  hypothetical protein  26.38 
 
 
546 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1542  TPR repeat-containing protein  25.05 
 
 
534 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00030715  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  24.82 
 
 
827 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2410  TPR repeat-containing protein  24.02 
 
 
648 aa  109  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  24.03 
 
 
795 aa  107  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.19 
 
 
810 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  24.81 
 
 
766 aa  105  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  35.85 
 
 
878 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  32.23 
 
 
605 aa  103  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  23.77 
 
 
879 aa  101  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0622  hypothetical protein  28.16 
 
 
499 aa  100  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.130503  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  35.26 
 
 
927 aa  97.8  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  35 
 
 
620 aa  95.9  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 
3145 aa  94.7  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  35 
 
 
620 aa  93.6  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 
715 aa  93.2  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6633  hypothetical protein  22.53 
 
 
613 aa  93.2  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0642176 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4326  TPR repeat-containing protein  33.05 
 
 
790 aa  92  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3173  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 
697 aa  91.3  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0407738  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  34.44 
 
 
615 aa  90.5  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 
1094 aa  90.1  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  37.2 
 
 
626 aa  89.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  35.26 
 
 
612 aa  90.1  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  34.15 
 
 
795 aa  89.4  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  36.25 
 
 
744 aa  89.4  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  33.12 
 
 
808 aa  88.6  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  35.26 
 
 
636 aa  88.6  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  32.47 
 
 
637 aa  87.8  5e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2893  hypothetical protein  23.74 
 
 
497 aa  87.8  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0588266 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0599  TPR repeat-containing protein  25.09 
 
 
748 aa  87.8  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.709055 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  31.89 
 
 
573 aa  87.8  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2067  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 
586 aa  87.8  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0230242  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 
909 aa  87  9e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  34.68 
 
 
639 aa  87  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  33.55 
 
 
626 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  32.28 
 
 
875 aa  86.7  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  33.55 
 
 
614 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  33.55 
 
 
614 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  37.98 
 
 
754 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1840  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 
657 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.829292 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.45 
 
 
632 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 
1450 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  37.98 
 
 
754 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  33.53 
 
 
637 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 
681 aa  84.7  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  34.1 
 
 
635 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  34.1 
 
 
635 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
1737 aa  84.7  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  34.1 
 
 
611 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  32.9 
 
 
626 aa  84  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.37 
 
 
565 aa  84  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  32.9 
 
 
614 aa  84  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  32.9 
 
 
614 aa  84  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  32.9 
 
 
614 aa  84  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  30.67 
 
 
603 aa  84  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  32.26 
 
 
560 aa  83.6  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  34.41 
 
 
654 aa  83.6  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 
739 aa  83.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  32.16 
 
 
688 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  32.34 
 
 
750 aa  83.2  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  30.95 
 
 
764 aa  81.3  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  31.06 
 
 
622 aa  81.3  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  36.59 
 
 
703 aa  81.3  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  30.25 
 
 
725 aa  81.3  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  34.75 
 
 
789 aa  80.9  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  32.3 
 
 
708 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  31.45 
 
 
824 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  31.45 
 
 
865 aa  79  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  30.29 
 
 
4079 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  24.71 
 
 
3301 aa  79.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 
685 aa  78.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  32.1 
 
 
583 aa  78.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 
217 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0632  tetratricopeptide protein)  25.33 
 
 
566 aa  78.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  30.86 
 
 
340 aa  78.2  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3076  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
697 aa  78.2  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
374 aa  78.2  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 
612 aa  77.8  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  31.45 
 
 
362 aa  77.8  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  28.93 
 
 
816 aa  77.4  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.95 
 
 
689 aa  77.4  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  30.86 
 
 
3035 aa  76.6  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 
1421 aa  76.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>