More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2471 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 643 aa  1310    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  35.46 
 
 		 686 aa  340  5.9999999999999996e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.23 
 
 		 576 aa  323  5e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  30.64 
 
 		 686 aa  273  1e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1114  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.67 
 
 		 641 aa  257  4e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  31.22 
 
 		 589 aa  257  5e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  32.19 
 
 		 593 aa  243  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  29.5 
 
 		 587 aa  231  4e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2470  TPR repeat-containing protein  36 
 
 		 581 aa  207  4e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 		 776 aa  207  6e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1451  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 585 aa  204  4e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  29.26 
 
 		 645 aa  179  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  24.14 
 
 		 762 aa  156  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 715 aa  152  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0599  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 		 748 aa  146  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709055 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  23.45 
 
 		 827 aa  141  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 		 605 aa  135  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 		 795 aa  134  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  23.87 
 
 		 792 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  26.07 
 
 		 744 aa  123  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 3145 aa  118  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  25.36 
 
 		 879 aa  118  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2410  TPR repeat-containing protein  25.3 
 
 		 648 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.2 
 
 		 810 aa  114  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 878 aa  114  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1112  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.94 
 
 		 536 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0584  hypothetical protein  27.59 
 
 		 546 aa  112  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 		 681 aa  110  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2508  TPR domain-containing protein  25.1 
 
 		 559 aa  103  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.849467  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 685 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  30.84 
 
 		 725 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 		 718 aa  101  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  33.72 
 
 		 637 aa  100  8e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 		 714 aa  99  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  30.77 
 
 		 603 aa  99  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 		 828 aa  98.6  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2298  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 570 aa  98.6  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  27.9 
 
 		 3172 aa  98.6  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0588  TPR repeat-containing protein  24.95 
 
 		 613 aa  98.2  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  29.03 
 
 		 816 aa  98.2  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  28.1 
 
 		 764 aa  98.2  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1220  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 		 609 aa  98.2  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00113386  hitchhiker  0.00622178 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3794  TPR repeat-containing protein  23.48 
 
 		 657 aa  97.8  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  30.6 
 
 		 622 aa  97.4  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  34.76 
 
 		 875 aa  97.4  7e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3602  TPR repeat-containing protein  23.82 
 
 		 556 aa  97.4  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0222501 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 		 4489 aa  97.1  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  30.74 
 
 		 828 aa  96.3  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0622  hypothetical protein  26.7 
 
 		 499 aa  95.9  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.130503  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 		 909 aa  95.9  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  29.55 
 
 		 714 aa  95.9  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1542  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 		 534 aa  95.5  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00030715  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.17 
 
 		 632 aa  95.5  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  35.09 
 
 		 340 aa  94.4  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 620 aa  94.4  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 		 3301 aa  94.4  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  23.57 
 
 		 766 aa  93.6  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 739 aa  93.6  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4326  TPR repeat-containing protein  28.31 
 
 		 790 aa  93.6  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  33.76 
 
 		 542 aa  92.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 1406 aa  92  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 		 3035 aa  92.4  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  34.36 
 
 		 833 aa  91.7  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  29.02 
 
 		 573 aa  91.7  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3173  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 697 aa  91.7  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0407738  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.95 
 
 		 689 aa  91.3  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  26.84 
 
 		 750 aa  91.3  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  35.5 
 
 		 649 aa  91.3  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1321  TPR repeat-containing protein  21.69 
 
 		 638 aa  91.3  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.002861  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  29.13 
 
 		 620 aa  91.3  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  35.5 
 
 		 649 aa  91.3  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  36.88 
 
 		 824 aa  91.3  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  30.49 
 
 		 626 aa  90.9  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  32.19 
 
 		 648 aa  91.3  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  32.71 
 
 		 1154 aa  90.9  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  38.16 
 
 		 754 aa  90.5  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 		 615 aa  89.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  30.53 
 
 		 626 aa  89  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  30.53 
 
 		 626 aa  89  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1840  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 		 657 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.829292 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  31.02 
 
 		 1737 aa  89.7  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  34.91 
 
 		 646 aa  89.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  31.1 
 
 		 832 aa  89  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  35.92 
 
 		 864 aa  89  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  30.53 
 
 		 614 aa  88.6  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  30.53 
 
 		 614 aa  88.6  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 614 aa  88.6  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 614 aa  88.6  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  30.42 
 
 		 614 aa  88.6  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  30 
 
 		 566 aa  88.2  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 		 362 aa  88.2  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  27.83 
 
 		 795 aa  88.2  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  31.84 
 
 		 732 aa  88.2  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  30.87 
 
 		 968 aa  86.3  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  27.78 
 
 		 865 aa  86.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.83 
 
 		 818 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  28.76 
 
 		 2262 aa  85.9  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 		 789 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.45 
 
 		 2240 aa  85.9  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  34.64 
 
 		 363 aa  85.5  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>