68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1404 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1404  hypothetical protein  100 
 
 		 571 aa  1154    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.35845 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1658  hypothetical protein  33.04 
 
 		 579 aa  266  5e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000685853  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2585  hypothetical protein  34.04 
 
 		 575 aa  265  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1641  hypothetical protein  32.06 
 
 		 572 aa  258  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1498  hypothetical protein  26.88 
 
 		 582 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.579024  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2696  hypothetical protein  29.6 
 
 		 460 aa  150  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1112  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.48 
 
 		 536 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 		 827 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2094  hypothetical protein  36.46 
 
 		 640 aa  110  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140167  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.31 
 
 		 576 aa  98.2  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 		 762 aa  94  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1321  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 		 638 aa  94  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.002861  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2410  TPR repeat-containing protein  26.65 
 
 		 648 aa  90.1  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0622  hypothetical protein  25.78 
 
 		 499 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.130503  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 		 645 aa  82.4  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 		 792 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4326  TPR repeat-containing protein  42.2 
 
 		 790 aa  77.8  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 795 aa  77  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  22.46 
 
 		 587 aa  76.3  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2298  TPR repeat-containing protein  25.59 
 
 		 570 aa  76.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0599  TPR repeat-containing protein  32.75 
 
 		 748 aa  74.3  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709055 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1408  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 		 759 aa  73.6  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  21.77 
 
 		 643 aa  72.4  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1274  TPR repeat-containing protein  24.05 
 
 		 559 aa  72.4  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  23.73 
 
 		 879 aa  72.4  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  29.88 
 
 		 744 aa  72.4  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0666  Tetratricopeptide TPR_4  25 
 
 		 575 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  24.46 
 
 		 715 aa  69.3  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0656  TPR repeat-containing protein  24.94 
 
 		 639 aa  68.6  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.329411  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3794  TPR repeat-containing protein  24.91 
 
 		 657 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1542  TPR repeat-containing protein  23.55 
 
 		 534 aa  67.4  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00030715  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1114  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.73 
 
 		 641 aa  67.4  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5160  hypothetical protein  31.03 
 
 		 639 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.666513  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 		 593 aa  66.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  21.4 
 
 		 589 aa  67  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0632  tetratricopeptide protein)  26.85 
 
 		 566 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  36.79 
 
 		 776 aa  65.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3602  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 556 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0222501 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6633  hypothetical protein  23.91 
 
 		 613 aa  63.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0642176 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.48 
 
 		 653 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000395442 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4471  tetratricopeptide TPR_4  38.46 
 
 		 598 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.623043 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.71 
 
 		 654 aa  60.8  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  22.41 
 
 		 686 aa  58.9  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2731  hypothetical protein  31.17 
 
 		 503 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0569  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 575 aa  58.2  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0593446 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2067  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 		 586 aa  58.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0230242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0677  TPR repeat-containing protein  21.26 
 
 		 616 aa  58.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0584  hypothetical protein  29.66 
 
 		 546 aa  58.2  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2508  TPR domain-containing protein  26.75 
 
 		 559 aa  57  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.849467  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  33.01 
 
 		 605 aa  57  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0666  Tetratricopeptide TPR_4  31.76 
 
 		 566 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 		 686 aa  54.7  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 		 766 aa  54.3  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3244  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.67 
 
 		 699 aa  53.5  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3173  TPR repeat-containing protein  21.86 
 
 		 697 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0407738  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2655  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.77 
 
 		 610 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1411  TPR repeat-containing protein  23.2 
 
 		 708 aa  52.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000178962  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2749  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.96 
 
 		 610 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1220  TPR repeat-containing protein  33.85 
 
 		 609 aa  50.8  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00113386  hitchhiker  0.00622178 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1451  TPR repeat-containing protein  26.08 
 
 		 585 aa  50.8  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3075  TPR repeat-containing protein  23.11 
 
 		 602 aa  50.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.320155  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2893  hypothetical protein  23.13 
 
 		 497 aa  50.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0588266 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 		 700 aa  48.5  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0588  TPR repeat-containing protein  23.75 
 
 		 613 aa  46.2  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6647  hypothetical protein  22.28 
 
 		 437 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3174  hypothetical protein  23.41 
 
 		 634 aa  43.9  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.676773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3222  TPR repeat-containing protein  19.92 
 
 		 544 aa  43.5  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.123328 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.44 
 
 		 2240 aa  43.5  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>