More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1274 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1274  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 559 aa  1139    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  53.85 
 
 		 879 aa  555  1e-156  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2410  TPR repeat-containing protein  56.48 
 
 		 648 aa  486  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1542  TPR repeat-containing protein  38.31 
 
 		 534 aa  342  1e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00030715  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  39.12 
 
 		 645 aa  313  5.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  38.18 
 
 		 744 aa  302  9e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  36.99 
 
 		 715 aa  299  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4326  TPR repeat-containing protein  37.85 
 
 		 790 aa  298  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1408  TPR repeat-containing protein  39.56 
 
 		 759 aa  286  5e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  35.67 
 
 		 795 aa  280  4e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0599  TPR repeat-containing protein  38.76 
 
 		 748 aa  248  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709055 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.36 
 
 		 576 aa  164  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4471  tetratricopeptide TPR_4  32.66 
 
 		 598 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.623043 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  50 
 
 		 686 aa  139  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 		 589 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0584  hypothetical protein  28.04 
 
 		 546 aa  110  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 		 776 aa  107  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  25.99 
 
 		 643 aa  106  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 		 827 aa  103  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  25.38 
 
 		 593 aa  103  7e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  23.9 
 
 		 686 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1112  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.05 
 
 		 536 aa  98.6  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 		 762 aa  98.6  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 		 587 aa  98.6  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1404  hypothetical protein  23.84 
 
 		 571 aa  93.2  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.35845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1114  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.83 
 
 		 641 aa  91.3  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 792 aa  87.4  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2470  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 		 581 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2508  TPR domain-containing protein  39.58 
 
 		 559 aa  84  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.849467  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2585  hypothetical protein  33.99 
 
 		 575 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6647  hypothetical protein  26.45 
 
 		 437 aa  80.5  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2696  hypothetical protein  25.73 
 
 		 460 aa  79.3  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1641  hypothetical protein  34.83 
 
 		 572 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  23.54 
 
 		 766 aa  77.8  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3602  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 		 556 aa  75.1  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0222501 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1498  hypothetical protein  24.84 
 
 		 582 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.579024  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  36.11 
 
 		 878 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0622  hypothetical protein  24.68 
 
 		 499 aa  71.6  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.130503  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1411  TPR repeat-containing protein  23.7 
 
 		 708 aa  71.6  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000178962  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0588  TPR repeat-containing protein  25.78 
 
 		 613 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1840  TPR repeat-containing protein  23.94 
 
 		 657 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.829292 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.19 
 
 		 810 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 		 452 aa  67.8  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0666  Tetratricopeptide TPR_4  28.57 
 
 		 575 aa  67.4  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6471  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.4 
 
 		 1274 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.707662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  28.45 
 
 		 808 aa  65.1  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  38.24 
 
 		 789 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  36.56 
 
 		 733 aa  63.9  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1658  hypothetical protein  24.85 
 
 		 579 aa  62  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000685853  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.03 
 
 		 689 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1876  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 		 123 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1850  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 		 123 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  33.61 
 
 		 1005 aa  61.6  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 718 aa  60.8  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  34.26 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  36.56 
 
 		 754 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0604  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  37 
 
 		 878 aa  60.5  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3333  TPR repeat-containing protein  37.89 
 
 		 274 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34116  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1321  TPR repeat-containing protein  22.85 
 
 		 638 aa  60.1  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.002861  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  36.56 
 
 		 754 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 		 828 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  34.91 
 
 		 697 aa  59.3  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3414  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.95 
 
 		 274 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.187348  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 		 833 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0125  TPR repeat-containing protein  22.62 
 
 		 812 aa  58.9  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.298389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.04 
 
 		 1034 aa  58.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 		 3172 aa  58.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 		 828 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1451  TPR repeat-containing protein  22.11 
 
 		 585 aa  58.9  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 1252 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.39 
 
 		 836 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 1252 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 		 573 aa  58.2  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 824 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  33.68 
 
 		 3301 aa  58.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 626 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3018  hypothetical protein  23.55 
 
 		 540 aa  57.8  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00759929  hitchhiker  0.000000786199 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1598  hypothetical protein  30.23 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000392317  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 3145 aa  57.4  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4444  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.69 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.03 
 
 		 1056 aa  57  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.25 
 
 		 784 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  33.59 
 
 		 833 aa  56.6  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 620 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  29.75 
 
 		 820 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4040  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 226 aa  56.2  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.48 
 
 		 725 aa  56.2  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.89 
 
 		 274 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2067  TPR repeat-containing protein  29.15 
 
 		 586 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0230242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4902  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.96 
 
 		 737 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  30.16 
 
 		 875 aa  56.2  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.11 
 
 		 988 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  27.97 
 
 		 622 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 		 1406 aa  55.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.43 
 
 		 632 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 		 639 aa  55.1  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 		 3560 aa  55.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  34.69 
 
 		 780 aa  55.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  27.54 
 
 		 887 aa  55.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 		 635 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>