65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1658 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1658  hypothetical protein  100 
 
 
579 aa  1180    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000685853  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1404  hypothetical protein  33.04 
 
 
571 aa  279  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.35845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2585  hypothetical protein  31.54 
 
 
575 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1641  hypothetical protein  30.41 
 
 
572 aa  211  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2094  hypothetical protein  28.25 
 
 
640 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140167  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1498  hypothetical protein  31.46 
 
 
582 aa  151  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.579024  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2696  hypothetical protein  29.56 
 
 
460 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1112  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.98 
 
 
536 aa  102  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2508  TPR domain-containing protein  26.23 
 
 
559 aa  87  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.849467  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  23.59 
 
 
827 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.7 
 
 
576 aa  84  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1411  TPR repeat-containing protein  23.54 
 
 
708 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000178962  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 
593 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1542  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
534 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00030715  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  25.59 
 
 
605 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2067  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 
586 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0230242  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6633  hypothetical protein  24.51 
 
 
613 aa  76.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0642176 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  22.67 
 
 
643 aa  75.9  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2410  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 
648 aa  76.3  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  26.13 
 
 
589 aa  75.1  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  23.48 
 
 
762 aa  74.3  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  32.48 
 
 
776 aa  72  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  25.65 
 
 
792 aa  70.9  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  37.62 
 
 
686 aa  70.1  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3018  hypothetical protein  23.94 
 
 
540 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00759929  hitchhiker  0.000000786199 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  21.6 
 
 
587 aa  67  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1321  TPR repeat-containing protein  24.16 
 
 
638 aa  66.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.002861  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1114  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.02 
 
 
641 aa  64.3  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0622  hypothetical protein  26.07 
 
 
499 aa  62.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.130503  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0569  TPR repeat-containing protein  34.12 
 
 
575 aa  62  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0593446 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0584  hypothetical protein  34.23 
 
 
546 aa  60.8  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5160  hypothetical protein  34.06 
 
 
639 aa  60.5  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.666513  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3602  TPR repeat-containing protein  34.53 
 
 
556 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0222501 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 
686 aa  59.7  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3244  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.55 
 
 
699 aa  59.3  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1408  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 
759 aa  59.3  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1274  TPR repeat-containing protein  33.57 
 
 
559 aa  59.7  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  21.93 
 
 
645 aa  58.2  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2731  hypothetical protein  25.52 
 
 
503 aa  57.8  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 
879 aa  57.4  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4326  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 
790 aa  57.4  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3222  TPR repeat-containing protein  22.66 
 
 
544 aa  57.4  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.123328 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 
766 aa  57  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1840  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 
657 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.829292 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  24.62 
 
 
795 aa  55.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  27.92 
 
 
744 aa  52.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  27.32 
 
 
715 aa  52.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0656  TPR repeat-containing protein  22.06 
 
 
639 aa  52.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.329411  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.33 
 
 
653 aa  52  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000395442 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.53 
 
 
654 aa  51.2  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0588  TPR repeat-containing protein  26.34 
 
 
613 aa  50.8  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4471  tetratricopeptide TPR_4  29.56 
 
 
598 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.623043 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0125  TPR repeat-containing protein  22.57 
 
 
812 aa  50.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.298389  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0632  tetratricopeptide protein)  24.3 
 
 
566 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2893  hypothetical protein  27.78 
 
 
497 aa  48.5  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0588266 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0795  hypothetical protein  25.29 
 
 
650 aa  48.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.492982  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0599  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 
748 aa  47.8  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.709055 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1451  TPR repeat-containing protein  26.6 
 
 
585 aa  47  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2298  TPR repeat-containing protein  23.46 
 
 
570 aa  46.2  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2470  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 
581 aa  45.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6647  hypothetical protein  22.6 
 
 
437 aa  45.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2663  hypothetical protein  31.11 
 
 
504 aa  45.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0666  Tetratricopeptide TPR_4  29.09 
 
 
566 aa  43.9  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3075  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 
602 aa  43.5  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.320155  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3174  hypothetical protein  26.6 
 
 
634 aa  43.5  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.676773  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>