More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0588 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0588  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 613 aa  1224    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 		 686 aa  169  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 		 605 aa  168  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2298  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 		 570 aa  162  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 827 aa  152  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.87 
 
 		 576 aa  150  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1114  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.03 
 
 		 641 aa  148  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1321  TPR repeat-containing protein  27.29 
 
 		 638 aa  147  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.002861  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  28.52 
 
 		 587 aa  147  6e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2508  TPR domain-containing protein  30.08 
 
 		 559 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.849467  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  27.38 
 
 		 686 aa  147  7.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 		 762 aa  141  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0584  hypothetical protein  30.44 
 
 		 546 aa  141  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1840  TPR repeat-containing protein  27.77 
 
 		 657 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.829292 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3794  TPR repeat-containing protein  25.75 
 
 		 657 aa  138  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3075  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 		 602 aa  136  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.320155  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1112  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.82 
 
 		 536 aa  134  6.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0677  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 		 616 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  28.22 
 
 		 792 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 		 643 aa  130  6e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6647  hypothetical protein  28.75 
 
 		 437 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 589 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 		 776 aa  127  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.75 
 
 		 654 aa  127  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  26.5 
 
 		 593 aa  126  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0666  Tetratricopeptide TPR_4  28.21 
 
 		 575 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0632  tetratricopeptide protein)  26.37 
 
 		 566 aa  124  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.24 
 
 		 653 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000395442 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  26.37 
 
 		 879 aa  117  6e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3602  TPR repeat-containing protein  26.59 
 
 		 556 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0222501 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2410  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 		 648 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1498  hypothetical protein  26.13 
 
 		 582 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.579024  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1408  TPR repeat-containing protein  27.24 
 
 		 759 aa  111  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0622  hypothetical protein  29.21 
 
 		 499 aa  110  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.130503  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0666  Tetratricopeptide TPR_4  26.43 
 
 		 566 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3173  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 		 697 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0407738  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3222  TPR repeat-containing protein  25.59 
 
 		 544 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.123328 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1542  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 		 534 aa  105  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00030715  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2470  TPR repeat-containing protein  27.35 
 
 		 581 aa  103  7e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2893  hypothetical protein  28.48 
 
 		 497 aa  103  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0588266 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0599  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 		 748 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709055 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 		 795 aa  100  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 		 645 aa  98.6  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0656  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 		 639 aa  95.5  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.329411  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  25.39 
 
 		 766 aa  95.1  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4326  TPR repeat-containing protein  26.34 
 
 		 790 aa  94.4  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0125  TPR repeat-containing protein  23.73 
 
 		 812 aa  93.6  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.298389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 744 aa  92.8  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1220  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 		 609 aa  92.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00113386  hitchhiker  0.00622178 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1274  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 		 559 aa  91.3  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 		 715 aa  90.9  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1411  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 		 708 aa  87  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000178962  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3018  hypothetical protein  27.22 
 
 		 540 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00759929  hitchhiker  0.000000786199 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3244  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.22 
 
 		 699 aa  82.8  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2696  hypothetical protein  23.39 
 
 		 460 aa  82.4  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3076  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 697 aa  80.5  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2655  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.3 
 
 		 610 aa  79.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1451  TPR repeat-containing protein  20.89 
 
 		 585 aa  75.9  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.48 
 
 		 810 aa  75.5  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1404  hypothetical protein  24.57 
 
 		 571 aa  74.3  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.35845 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0569  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 		 575 aa  74.3  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0593446 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 		 878 aa  73.9  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2067  TPR repeat-containing protein  28.49 
 
 		 586 aa  72  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0230242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2585  hypothetical protein  33.68 
 
 		 575 aa  72  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  26.15 
 
 		 560 aa  71.2  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1658  hypothetical protein  25.82 
 
 		 579 aa  71.2  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000685853  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2749  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.15 
 
 		 610 aa  70.1  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  25.91 
 
 		 661 aa  70.1  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  30.59 
 
 		 583 aa  70.1  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  25.44 
 
 		 1714 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 		 3145 aa  69.7  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 		 3172 aa  69.3  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  28.39 
 
 		 603 aa  68.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.11 
 
 		 836 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  25.91 
 
 		 622 aa  68.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  28.93 
 
 		 764 aa  68.2  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 		 968 aa  66.6  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  25.17 
 
 		 545 aa  66.6  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  25.85 
 
 		 587 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0156  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 		 955 aa  66.2  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4471  tetratricopeptide TPR_4  26.56 
 
 		 598 aa  65.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.623043 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  32.41 
 
 		 875 aa  65.1  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  22.4 
 
 		 676 aa  64.7  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.56 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.617467  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 681 aa  64.7  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0276  hypothetical protein  27.05 
 
 		 531 aa  64.7  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1123  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.86 
 
 		 176 aa  64.3  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0172242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 448 aa  64.3  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1370  hypothetical protein  29.8 
 
 		 690 aa  64.3  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6633  hypothetical protein  26.46 
 
 		 613 aa  63.9  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0642176 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 		 718 aa  63.9  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3958  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 		 811 aa  63.5  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0310982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.7 
 
 		 927 aa  63.5  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1251  FkbM family methyltransferase  23.38 
 
 		 415 aa  63.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0112173 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1304  TPR repeat-containing protein  28.86 
 
 		 690 aa  62.4  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.107632  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.63 
 
 		 358 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.99 
 
 		 632 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 		 688 aa  62.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  24.46 
 
 		 612 aa  62  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  27.81 
 
 		 733 aa  61.6  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>