More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1304 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1370  hypothetical protein  98.26 
 
 		 690 aa  1338    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0105  TPR repeat-containing protein  52.03 
 
 		 689 aa  677    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688221 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1304  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 690 aa  1362    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.107632  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03573  tetratricopeptide repeat family  62.46 
 
 		 690 aa  823    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432087  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.61 
 
 		 632 aa  84.7  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  24.33 
 
 		 1676 aa  76.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.64 
 
 		 2240 aa  75.5  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.75 
 
 		 878 aa  73.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  26.7 
 
 		 733 aa  73.9  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  22.83 
 
 		 810 aa  73.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  25.99 
 
 		 313 aa  72.8  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 		 804 aa  71.6  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  27.85 
 
 		 837 aa  71.6  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  23.87 
 
 		 505 aa  68.6  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  26.91 
 
 		 808 aa  68.6  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  23.16 
 
 		 725 aa  68.2  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  21.45 
 
 		 927 aa  67.4  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 2262 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 		 607 aa  67  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.57 
 
 		 363 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2701  FecR protein  34.9 
 
 		 1237 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0375839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.57 
 
 		 363 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.12 
 
 		 1056 aa  65.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  29.67 
 
 		 729 aa  65.1  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 		 883 aa  65.1  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  19.49 
 
 		 3145 aa  65.5  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  23.93 
 
 		 762 aa  64.3  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  21.45 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 		 706 aa  64.3  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  23.93 
 
 		 762 aa  64.3  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0588  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 613 aa  63.9  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1722  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.98 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  20.05 
 
 		 676 aa  63.9  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.67 
 
 		 784 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  24.59 
 
 		 1121 aa  63.5  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  25.6 
 
 		 3301 aa  63.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.35 
 
 		 689 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  34.62 
 
 		 591 aa  62.8  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  22.04 
 
 		 884 aa  62.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  24.14 
 
 		 3172 aa  63.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0156  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 		 955 aa  62.4  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  24.21 
 
 		 607 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  22.19 
 
 		 934 aa  61.6  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 		 827 aa  61.6  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.9 
 
 		 553 aa  60.8  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2664  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  28.57 
 
 		 673 aa  60.1  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  25.4 
 
 		 399 aa  60.1  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0731  hypothetical protein  28.38 
 
 		 567 aa  60.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 776 aa  60.1  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  26.9 
 
 		 603 aa  60.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  25.65 
 
 		 607 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  24.61 
 
 		 607 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  25.73 
 
 		 936 aa  59.3  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  24.34 
 
 		 405 aa  59.7  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 		 265 aa  59.7  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2717  TPR repeat-containing protein  25.65 
 
 		 607 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0254637  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  21.89 
 
 		 436 aa  59.3  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  26.94 
 
 		 790 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  24.61 
 
 		 607 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  25.85 
 
 		 718 aa  60.1  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  24.61 
 
 		 607 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  21.49 
 
 		 1421 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3161  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.64 
 
 		 818 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2957  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338311  normal  0.060469 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.04 
 
 		 1022 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  22.3 
 
 		 884 aa  58.9  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  22.81 
 
 		 637 aa  58.5  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  22.73 
 
 		 681 aa  58.5  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 		 860 aa  58.2  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3465  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.89 
 
 		 451 aa  58.2  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0563364  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  28.66 
 
 		 589 aa  58.2  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.21 
 
 		 557 aa  58.2  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  24.2 
 
 		 573 aa  58.2  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  29.58 
 
 		 585 aa  58.2  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3025  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3401  Tetratricopeptide TPR_4  29.89 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0349174  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.38 
 
 		 1056 aa  57.8  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  24.67 
 
 		 697 aa  57  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  23.12 
 
 		 562 aa  56.6  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2752  TPR repeat-containing protein  29.48 
 
 		 556 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0761228  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  27.25 
 
 		 767 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  27.86 
 
 		 883 aa  57  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  23.64 
 
 		 820 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  21.62 
 
 		 764 aa  56.2  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.35 
 
 		 572 aa  56.6  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  23.94 
 
 		 1764 aa  55.8  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  22.63 
 
 		 357 aa  56.2  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  29.01 
 
 		 340 aa  56.6  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  20.99 
 
 		 603 aa  56.2  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.73 
 
 		 293 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  21.41 
 
 		 887 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 566 aa  56.2  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  25.35 
 
 		 594 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2220  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 		 430 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  19.45 
 
 		 448 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 		 311 aa  55.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  22.6 
 
 		 634 aa  55.8  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>