More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2701 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0058  TonB-dependent receptor  53.3 
 
 		 1198 aa  1243    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.872531  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2701  FecR protein  100 
 
 		 1237 aa  2517    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0375839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2370  TPR repeat-containing protein  80.78 
 
 		 1272 aa  2046    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0364694 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1063  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 		 1129 aa  119  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.194908  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1219  hypothetical protein  30.56 
 
 		 586 aa  80.1  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  30.84 
 
 		 267 aa  70.1  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18170  hypothetical protein  31.32 
 
 		 378 aa  70.1  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000581203  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 361 aa  69.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 		 878 aa  68.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 649 aa  68.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 		 927 aa  66.6  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 		 620 aa  66.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  26.53 
 
 		 820 aa  66.6  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1304  TPR repeat-containing protein  34.9 
 
 		 690 aa  65.9  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.107632  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.95 
 
 		 557 aa  65.1  0.000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.17 
 
 		 810 aa  64.3  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6840  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.82 
 
 		 370 aa  63.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 		 323 aa  63.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 301 aa  63.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  32.72 
 
 		 265 aa  63.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  29.21 
 
 		 706 aa  63.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 265 aa  63.2  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1530  TPR repeat-containing protein  29.48 
 
 		 873 aa  63.2  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0304158  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  26.37 
 
 		 706 aa  62.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2561  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.88 
 
 		 547 aa  62.8  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  27 
 
 		 643 aa  62.8  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.59 
 
 		 916 aa  62.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.52 
 
 		 632 aa  62.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  27.04 
 
 		 582 aa  62.4  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1370  hypothetical protein  34.9 
 
 		 690 aa  62.4  0.00000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 		 597 aa  62.4  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1429  PDZ/DHR/GLGF domain protein  27.78 
 
 		 668 aa  62.4  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000479067  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.59 
 
 		 1022 aa  62  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  21.4 
 
 		 594 aa  62  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 615 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0116  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 289 aa  61.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  25.23 
 
 		 462 aa  61.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.27 
 
 		 265 aa  60.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.81 
 
 		 1056 aa  60.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.98 
 
 		 818 aa  60.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3548  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.08 
 
 		 313 aa  60.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.385244  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.42 
 
 		 988 aa  60.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  20.61 
 
 		 3145 aa  59.7  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 		 573 aa  59.3  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.95 
 
 		 274 aa  59.3  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 217 aa  59.3  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  29.19 
 
 		 620 aa  59.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.29 
 
 		 563 aa  59.7  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2801  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 291 aa  59.3  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3333  TPR repeat-containing protein  31.41 
 
 		 274 aa  58.9  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34116  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2201  Tfp pilus assembly protein PilF-like  30.16 
 
 		 542 aa  58.9  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3398  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 		 274 aa  59.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0527752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.31 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.63 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  32.85 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 		 450 aa  58.5  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  29.17 
 
 		 626 aa  58.2  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.85 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.92 
 
 		 237 aa  57.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 		 614 aa  57.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.72 
 
 		 778 aa  58.2  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.77 
 
 		 1056 aa  57.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.7 
 
 		 542 aa  57.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  24.48 
 
 		 733 aa  58.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 515 aa  57.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 		 614 aa  57  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.57 
 
 		 739 aa  57.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3255  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 		 354 aa  57  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360912 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  27.4 
 
 		 626 aa  57.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 		 399 aa  57.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2531  peptidoglycan-binding LysM  29.3 
 
 		 548 aa  57.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.796598  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  25.98 
 
 		 566 aa  56.6  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  27 
 
 		 847 aa  56.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  24.61 
 
 		 792 aa  56.6  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 		 562 aa  56.2  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.11 
 
 		 784 aa  56.2  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  26.64 
 
 		 1676 aa  55.8  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6170  hypothetical protein  30 
 
 		 612 aa  56.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.198655 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 		 331 aa  56.2  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1114  TPR domain-containing protein  25.52 
 
 		 299 aa  55.8  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0729535  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2023  TPR domain-containing protein  27.33 
 
 		 369 aa  55.8  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000313787  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  23.65 
 
 		 612 aa  55.8  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4689  TPR repeat-containing protein  35.04 
 
 		 341 aa  55.8  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1463  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 329 aa  55.8  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951693  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3414  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.77 
 
 		 274 aa  55.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.187348  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 		 605 aa  55.5  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2050  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  31.58 
 
 		 258 aa  55.5  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.024552  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.53 
 
 		 406 aa  55.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.53 
 
 		 406 aa  55.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16741  hypothetical protein  24.88 
 
 		 467 aa  55.5  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 383 aa  55.5  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000586322  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1875  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 		 201 aa  55.5  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  22.43 
 
 		 594 aa  55.1  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  29.03 
 
 		 574 aa  55.1  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.27 
 
 		 574 aa  55.1  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 567 aa  55.1  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  26.92 
 
 		 626 aa  54.7  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  27.27 
 
 		 764 aa  54.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  26.92 
 
 		 614 aa  54.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>