30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_18170 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_18170  hypothetical protein  100 
 
 		 378 aa  748    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000581203  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2701  FecR protein  31.32 
 
 		 1237 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0375839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2370  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 1272 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0364694 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2621  hypothetical protein  27.49 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.829749  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0058  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 1198 aa  66.2  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.872531  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0431  peptidoglycan-binding LysM  37.61 
 
 		 543 aa  64.3  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000410197  normal  0.723763 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0038  putative periplasmic protein  27.23 
 
 		 290 aa  62.4  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0958409  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0299  anti-FecI sigma factor, FecR  29.03 
 
 		 1334 aa  56.6  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4992  putative peptidoglycan-binding LysM  33.87 
 
 		 484 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.911035  normal  0.0172735 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1660  putative peptidoglycan-binding LysM  30.77 
 
 		 484 aa  50.1  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0342216 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1074  signal peptide protein  28.47 
 
 		 568 aa  49.7  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107534  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0282  anti-FecI sigma factor, FecR  31.19 
 
 		 1381 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1169  peptidoglycan-binding LysM  27.73 
 
 		 554 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000824633  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2531  peptidoglycan-binding LysM  29.41 
 
 		 548 aa  47.8  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.796598  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6062  hypothetical protein  31.71 
 
 		 434 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2915  Peptidoglycan-binding LysM  27.67 
 
 		 566 aa  47.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1005  Peptidoglycan-binding LysM  27.74 
 
 		 559 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0784845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0334  hypothetical protein  33.6 
 
 		 664 aa  45.1  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1219  hypothetical protein  24.86 
 
 		 586 aa  45.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1345  hypothetical protein  27.4 
 
 		 3121 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1063  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 		 1129 aa  45.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.194908  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0940  Peptidoglycan-binding LysM  27.74 
 
 		 559 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.147374 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4741  peptidoglycan-binding LysM  28.7 
 
 		 394 aa  43.5  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0737  LysM domain-containing protein  27.45 
 
 		 448 aa  42.7  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.990238  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0426  LysM domain-containing protein  27.45 
 
 		 448 aa  42.7  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.718442  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1456  LysM domain-containing protein  27.45 
 
 		 448 aa  42.7  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1687  lysM domain-containing protein  27.45 
 
 		 454 aa  42.7  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1665  lysM domain-containing protein  27.45 
 
 		 454 aa  42.7  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1842  LysM domain-containing protein  27.45 
 
 		 454 aa  42.7  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0923  LysM domain-containing protein  27.45 
 
 		 454 aa  42.7  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>