More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1063 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1063  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1129 aa  2308    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.194908  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2701  FecR protein  27.22 
 
 		 1237 aa  125  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0375839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.86 
 
 		 632 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2370  TPR repeat-containing protein  25.43 
 
 		 1272 aa  100  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0364694 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.84 
 
 		 810 aa  99  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  21.38 
 
 		 927 aa  97.4  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0058  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 1198 aa  93.2  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.872531  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.13 
 
 		 878 aa  93.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  22.18 
 
 		 3145 aa  83.2  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 1096 aa  81.6  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  26.22 
 
 		 828 aa  80.9  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  26.22 
 
 		 828 aa  80.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  26.13 
 
 		 1676 aa  79.7  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.24 
 
 		 357 aa  78.2  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 		 847 aa  77  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 827 aa  76.6  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  27.14 
 
 		 1154 aa  76.6  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  27.8 
 
 		 676 aa  77  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 1276 aa  76.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.34 
 
 		 2240 aa  75.1  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 		 1737 aa  74.7  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 		 612 aa  73.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 		 465 aa  73.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.53 
 
 		 1022 aa  72.8  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  24.92 
 
 		 837 aa  72.4  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  22.91 
 
 		 583 aa  72  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 		 265 aa  72.4  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  21.43 
 
 		 3172 aa  72  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 		 1094 aa  70.9  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  24.62 
 
 		 331 aa  71.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  25.73 
 
 		 279 aa  71.2  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  24.65 
 
 		 366 aa  70.9  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.88 
 
 		 265 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  23.89 
 
 		 685 aa  70.1  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  26.47 
 
 		 1979 aa  70.5  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.32 
 
 		 689 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  26.87 
 
 		 334 aa  69.7  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  27.39 
 
 		 718 aa  70.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 		 265 aa  69.7  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  23.59 
 
 		 706 aa  69.3  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 		 566 aa  68.9  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.63 
 
 		 818 aa  68.9  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  23.37 
 
 		 2262 aa  68.9  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0243  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 		 208 aa  68.6  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.127552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  23.38 
 
 		 3301 aa  68.6  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  25.63 
 
 		 750 aa  68.6  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  22.57 
 
 		 573 aa  68.2  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  24.91 
 
 		 865 aa  67.4  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  22.92 
 
 		 1297 aa  67.4  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  25.79 
 
 		 376 aa  67  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 		 4079 aa  67  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  24.6 
 
 		 860 aa  67  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 		 3035 aa  67.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.09 
 
 		 739 aa  66.6  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  28.07 
 
 		 267 aa  67  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1722  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.62 
 
 		 354 aa  67  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  23.73 
 
 		 649 aa  66.6  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  24.76 
 
 		 1056 aa  66.6  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25.43 
 
 		 725 aa  66.6  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9475  predicted protein  26.35 
 
 		 336 aa  66.2  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  24.25 
 
 		 576 aa  65.5  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1201  tetratricopeptide TPR_2  26.95 
 
 		 918 aa  65.5  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.173975  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 		 637 aa  65.1  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  32.39 
 
 		 540 aa  65.1  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  31.22 
 
 		 833 aa  64.7  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  20.75 
 
 		 750 aa  64.7  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 828 aa  64.7  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  23.88 
 
 		 462 aa  64.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  25.99 
 
 		 2262 aa  64.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 		 290 aa  64.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.38 
 
 		 988 aa  64.3  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 280 aa  64.7  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  22.03 
 
 		 745 aa  64.7  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 		 1421 aa  64.3  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.09 
 
 		 471 aa  63.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  24.22 
 
 		 681 aa  63.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.47 
 
 		 1056 aa  63.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.71 
 
 		 1056 aa  63.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1837  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 		 344 aa  63.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.53 
 
 		 784 aa  63.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0741  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 191 aa  63.5  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  21.46 
 
 		 750 aa  63.5  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.17 
 
 		 344 aa  63.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  25 
 
 		 561 aa  63.9  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  22.52 
 
 		 543 aa  63.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  25.44 
 
 		 936 aa  63.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  24.27 
 
 		 909 aa  63.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 		 428 aa  63.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1219  hypothetical protein  25.13 
 
 		 586 aa  62.8  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.11 
 
 		 739 aa  62.4  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  26.83 
 
 		 306 aa  62  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  19.49 
 
 		 739 aa  62  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47492  predicted protein  25.13 
 
 		 640 aa  62  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00475484  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  22.14 
 
 		 681 aa  62  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 		 1827 aa  61.6  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  24.55 
 
 		 561 aa  61.6  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 		 361 aa  61.6  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>