82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0431 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_0431  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 543 aa  1116    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000410197  normal  0.723763 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5417  peptidoglycan-binding LysM  30.74 
 
 		 591 aa  234  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1074  signal peptide protein  29.45 
 
 		 568 aa  178  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107534  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0940  Peptidoglycan-binding LysM  28.07 
 
 		 559 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.147374 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1005  Peptidoglycan-binding LysM  27.88 
 
 		 559 aa  163  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0784845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2915  Peptidoglycan-binding LysM  27.11 
 
 		 566 aa  159  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4942  peptidoglycan-binding LysM  29.64 
 
 		 558 aa  155  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0426  LysM domain-containing protein  27.66 
 
 		 448 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.718442  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0737  LysM domain-containing protein  27.66 
 
 		 448 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.990238  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1687  lysM domain-containing protein  27.66 
 
 		 454 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1665  lysM domain-containing protein  27.66 
 
 		 454 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2637  LysM domain-containing protein  27.58 
 
 		 454 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1456  LysM domain-containing protein  27.66 
 
 		 448 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0923  LysM domain-containing protein  27.66 
 
 		 454 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1842  LysM domain-containing protein  27.66 
 
 		 454 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4163  hypothetical protein  28.35 
 
 		 556 aa  139  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.868125  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4992  putative peptidoglycan-binding LysM  27.64 
 
 		 484 aa  137  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.911035  normal  0.0172735 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1356  peptidoglycan-binding LysM  27.46 
 
 		 453 aa  137  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1317  peptidoglycan-binding LysM  27 
 
 		 453 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1660  putative peptidoglycan-binding LysM  26.44 
 
 		 484 aa  130  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0342216 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0955  peptidoglycan-binding LysM  26.38 
 
 		 453 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.310452  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1437  peptidoglycan-binding LysM  26.38 
 
 		 453 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4581  peptidoglycan-binding LysM  26.57 
 
 		 453 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0994346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1878  peptidoglycan-binding LysM  26.6 
 
 		 446 aa  125  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0622625 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1415  peptidoglycan-binding LysM  26.38 
 
 		 453 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1169  peptidoglycan-binding LysM  26.44 
 
 		 554 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000824633  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0582  hypothetical protein  27.08 
 
 		 463 aa  116  7.999999999999999e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000319564  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2531  peptidoglycan-binding LysM  26.11 
 
 		 548 aa  103  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.796598  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4741  peptidoglycan-binding LysM  29.9 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18170  hypothetical protein  37.61 
 
 		 378 aa  64.7  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000581203  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11650  hypothetical protein  23.95 
 
 		 333 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.220034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0038  putative periplasmic protein  29.41 
 
 		 290 aa  51.2  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0958409  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5385  Peptidoglycan-binding LysM  41.38 
 
 		 251 aa  50.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0299  anti-FecI sigma factor, FecR  32.06 
 
 		 1334 aa  50.8  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0334  hypothetical protein  27.01 
 
 		 664 aa  50.8  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0282  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 		 1381 aa  50.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2701  FecR protein  28.32 
 
 		 1237 aa  50.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0375839  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1985  hypothetical protein  23.67 
 
 		 924 aa  49.3  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.063002  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2370  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 1272 aa  48.5  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0364694 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6062  hypothetical protein  29.79 
 
 		 434 aa  48.5  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8593  Peptidoglycan-binding LysM  39.29 
 
 		 356 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902374  normal  0.799796 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3268  Peptidoglycan-binding LysM  25.4 
 
 		 339 aa  48.5  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000361142  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2695  peptidoglycan-binding LysM  43.48 
 
 		 435 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0516695  normal  0.123815 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  42.86 
 
 		 954 aa  47.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0044  peptidoglycan-binding LysM  31.82 
 
 		 338 aa  47.4  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1070  hypothetical protein  28.57 
 
 		 335 aa  47  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2713  Peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 		 335 aa  46.6  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.292431  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0076  putative cell wall degradation enzyme  41.3 
 
 		 353 aa  46.6  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5114  Peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 		 405 aa  47  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0439251  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1527  Peptidoglycan-binding LysM  32.89 
 
 		 338 aa  46.6  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.27524e-30 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2944  Peptidoglycan-binding LysM  47.92 
 
 		 236 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.34706  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1324  hypothetical protein  32.63 
 
 		 231 aa  46.6  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.311232  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0058  TonB-dependent receptor  30.84 
 
 		 1198 aa  46.6  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.872531  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0981  hypothetical protein  47.73 
 
 		 205 aa  45.8  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.787443  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2794  Peptidoglycan-binding LysM  35.8 
 
 		 440 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0244523  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1233  hypothetical protein  31.63 
 
 		 143 aa  46.2  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.258606  normal  0.166561 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0013  peptidoglycan-binding LysM-like protein  30.65 
 
 		 403 aa  45.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.154454 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0033  peptidoglycan-binding LysM  26.72 
 
 		 376 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0022  hypothetical protein  33.78 
 
 		 352 aa  45.8  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.124597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2887  Peptidoglycan-binding LysM  35.8 
 
 		 440 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04054  LysM domain protein  38.33 
 
 		 366 aa  45.1  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3586  Peptidoglycan-binding LysM  32.93 
 
 		 377 aa  45.4  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3879  peptidoglycan-binding LysM  35.09 
 
 		 430 aa  45.1  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4389  Peptidoglycan-binding LysM  37.14 
 
 		 237 aa  45.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.855659  normal  0.278561 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0019  Peptidoglycan-binding LysM  30.86 
 
 		 349 aa  45.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.154254 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0036  peptidoglycan-binding LysM  31.94 
 
 		 374 aa  45.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243599 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0018  LysM domain protein  30.86 
 
 		 349 aa  45.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0028  peptidoglycan-binding LysM  31.94 
 
 		 374 aa  45.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.198583 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2497  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  35.42 
 
 		 190 aa  44.3  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0032  peptidoglycan-binding LysM  30.34 
 
 		 376 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0032  Peptidoglycan-binding LysM  30.34 
 
 		 376 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235775 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0025  peptidoglycan-binding LysM  29.03 
 
 		 374 aa  44.3  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0028  peptidoglycan-binding LysM  30.34 
 
 		 376 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2701  peptidoglycan-binding LysM  34.57 
 
 		 440 aa  44.3  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0072  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  35.85 
 
 		 334 aa  44.3  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.859252  normal  0.733338 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1955  Peptidoglycan-binding LysM  34.57 
 
 		 239 aa  43.9  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 219 aa  43.9  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3683  peptidoglycan-binding LysM  37.74 
 
 		 5236 aa  43.5  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1923  peptidoglycan-binding LysM  37.74 
 
 		 5189 aa  43.5  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0096  Peptidoglycan-binding LysM  35.29 
 
 		 349 aa  43.9  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3797  putative FecR  38.55 
 
 		 319 aa  43.5  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253699  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0032  peptidoglycan-binding LysM  32.84 
 
 		 362 aa  43.5  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>