40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0334 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0334  hypothetical protein  100 
 
 		 664 aa  1308    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0012  hypothetical protein  39.45 
 
 		 717 aa  439  9.999999999999999e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1521  hypothetical protein  39.84 
 
 		 393 aa  257  4e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0114  hypothetical protein  32.33 
 
 		 382 aa  155  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000105969  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1219  hypothetical protein  24.7 
 
 		 586 aa  80.9  0.00000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0378  hypothetical protein  30.5 
 
 		 292 aa  79  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2531  peptidoglycan-binding LysM  29.68 
 
 		 548 aa  66.2  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.796598  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1660  putative peptidoglycan-binding LysM  33.91 
 
 		 484 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0342216 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1842  LysM domain-containing protein  31.9 
 
 		 454 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0737  LysM domain-containing protein  31.9 
 
 		 448 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.990238  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1456  LysM domain-containing protein  31.9 
 
 		 448 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0426  LysM domain-containing protein  31.9 
 
 		 448 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.718442  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0923  LysM domain-containing protein  31.9 
 
 		 454 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1356  peptidoglycan-binding LysM  28.57 
 
 		 453 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1687  lysM domain-containing protein  31.9 
 
 		 454 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1665  lysM domain-containing protein  31.9 
 
 		 454 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1317  peptidoglycan-binding LysM  28.57 
 
 		 453 aa  62  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2637  LysM domain-containing protein  31.03 
 
 		 454 aa  62  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4992  putative peptidoglycan-binding LysM  32.17 
 
 		 484 aa  61.2  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.911035  normal  0.0172735 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4581  peptidoglycan-binding LysM  26.14 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0994346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1878  peptidoglycan-binding LysM  29.41 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0622625 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1415  peptidoglycan-binding LysM  27.92 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1437  peptidoglycan-binding LysM  27.27 
 
 		 453 aa  56.2  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0955  peptidoglycan-binding LysM  27.27 
 
 		 453 aa  56.2  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.310452  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0038  putative periplasmic protein  27.5 
 
 		 290 aa  52.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0958409  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0299  anti-FecI sigma factor, FecR  30.19 
 
 		 1334 aa  52.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5417  peptidoglycan-binding LysM  24.51 
 
 		 591 aa  52  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0282  anti-FecI sigma factor, FecR  25 
 
 		 1381 aa  50.8  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0431  peptidoglycan-binding LysM  27.01 
 
 		 543 aa  50.4  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000410197  normal  0.723763 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1005  Peptidoglycan-binding LysM  25.76 
 
 		 559 aa  49.7  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0784845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18170  hypothetical protein  33.6 
 
 		 378 aa  49.7  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000581203  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2370  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 		 1272 aa  48.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0364694 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2701  FecR protein  26.77 
 
 		 1237 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0375839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4741  peptidoglycan-binding LysM  26.73 
 
 		 394 aa  46.6  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1074  signal peptide protein  25.44 
 
 		 568 aa  45.4  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107534  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0940  Peptidoglycan-binding LysM  24.24 
 
 		 559 aa  45.1  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.147374 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0941  peptidoglycan-binding LysM  27.42 
 
 		 359 aa  45.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.984882  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2621  hypothetical protein  26.98 
 
 		 287 aa  45.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.829749  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3500  hypothetical protein  30.5 
 
 		 452 aa  44.7  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.496991  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4942  peptidoglycan-binding LysM  24.56 
 
 		 558 aa  43.9  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>