39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4741 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4741  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 394 aa  766    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1878  peptidoglycan-binding LysM  36.79 
 
 		 446 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0622625 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1317  peptidoglycan-binding LysM  36.66 
 
 		 453 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1356  peptidoglycan-binding LysM  36.66 
 
 		 453 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2637  LysM domain-containing protein  34.49 
 
 		 454 aa  158  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1415  peptidoglycan-binding LysM  36.22 
 
 		 453 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0955  peptidoglycan-binding LysM  36.22 
 
 		 453 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.310452  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1437  peptidoglycan-binding LysM  36.22 
 
 		 453 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0426  LysM domain-containing protein  33.52 
 
 		 448 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.718442  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1456  LysM domain-containing protein  33.52 
 
 		 448 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0737  LysM domain-containing protein  33.52 
 
 		 448 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.990238  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1665  lysM domain-containing protein  33.52 
 
 		 454 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0923  LysM domain-containing protein  33.52 
 
 		 454 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1687  lysM domain-containing protein  33.52 
 
 		 454 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1842  LysM domain-containing protein  33.52 
 
 		 454 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4581  peptidoglycan-binding LysM  35.24 
 
 		 453 aa  153  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0994346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4163  hypothetical protein  33.02 
 
 		 556 aa  143  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.868125  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1660  putative peptidoglycan-binding LysM  32.19 
 
 		 484 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0342216 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4992  putative peptidoglycan-binding LysM  31.4 
 
 		 484 aa  136  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.911035  normal  0.0172735 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2915  Peptidoglycan-binding LysM  31.85 
 
 		 566 aa  126  6e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4942  peptidoglycan-binding LysM  31.58 
 
 		 558 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1074  signal peptide protein  31.04 
 
 		 568 aa  116  8.999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107534  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1005  Peptidoglycan-binding LysM  29.97 
 
 		 559 aa  113  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0784845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0940  Peptidoglycan-binding LysM  30.2 
 
 		 559 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.147374 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11650  hypothetical protein  33.75 
 
 		 333 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.220034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2531  peptidoglycan-binding LysM  28.53 
 
 		 548 aa  90.5  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.796598  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0431  peptidoglycan-binding LysM  26.04 
 
 		 543 aa  90.5  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000410197  normal  0.723763 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1070  hypothetical protein  32.23 
 
 		 335 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1169  peptidoglycan-binding LysM  28.92 
 
 		 554 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000824633  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5417  peptidoglycan-binding LysM  28.77 
 
 		 591 aa  77.8  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0582  hypothetical protein  27.53 
 
 		 463 aa  73.9  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000319564  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0038  putative periplasmic protein  31.01 
 
 		 290 aa  53.5  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0958409  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0334  hypothetical protein  26.73 
 
 		 664 aa  47.8  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18170  hypothetical protein  28.7 
 
 		 378 aa  47  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000581203  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0299  anti-FecI sigma factor, FecR  31.97 
 
 		 1334 aa  46.6  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1324  hypothetical protein  24.86 
 
 		 231 aa  45.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.311232  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1970  hypothetical protein  26.5 
 
 		 348 aa  44.3  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000904058  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1127  hypothetical protein  31.09 
 
 		 410 aa  43.1  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.667413 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  40.58 
 
 		 954 aa  43.1  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>