49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2531 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2531  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 548 aa  1103    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.796598  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2915  Peptidoglycan-binding LysM  29.45 
 
 		 566 aa  209  7e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4942  peptidoglycan-binding LysM  30.63 
 
 		 558 aa  168  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1074  signal peptide protein  27.13 
 
 		 568 aa  151  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107534  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0940  Peptidoglycan-binding LysM  25.25 
 
 		 559 aa  139  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.147374 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1356  peptidoglycan-binding LysM  30.46 
 
 		 453 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0582  hypothetical protein  25.74 
 
 		 463 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000319564  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1005  Peptidoglycan-binding LysM  25.41 
 
 		 559 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0784845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4163  hypothetical protein  27.27 
 
 		 556 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.868125  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1317  peptidoglycan-binding LysM  29.98 
 
 		 453 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1415  peptidoglycan-binding LysM  29.86 
 
 		 453 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4581  peptidoglycan-binding LysM  28.99 
 
 		 453 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0994346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1878  peptidoglycan-binding LysM  30.4 
 
 		 446 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0622625 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1437  peptidoglycan-binding LysM  29.38 
 
 		 453 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0955  peptidoglycan-binding LysM  29.38 
 
 		 453 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.310452  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1660  putative peptidoglycan-binding LysM  29.33 
 
 		 484 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0342216 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4992  putative peptidoglycan-binding LysM  28.61 
 
 		 484 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.911035  normal  0.0172735 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1687  lysM domain-containing protein  27.36 
 
 		 454 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0923  LysM domain-containing protein  27.36 
 
 		 454 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1665  lysM domain-containing protein  27.36 
 
 		 454 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0737  LysM domain-containing protein  27.36 
 
 		 448 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.990238  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1456  LysM domain-containing protein  27.36 
 
 		 448 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0426  LysM domain-containing protein  27.36 
 
 		 448 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.718442  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1842  LysM domain-containing protein  27.36 
 
 		 454 aa  107  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2637  LysM domain-containing protein  26.79 
 
 		 454 aa  105  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0431  peptidoglycan-binding LysM  26.11 
 
 		 543 aa  103  7e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000410197  normal  0.723763 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1169  peptidoglycan-binding LysM  27.79 
 
 		 554 aa  102  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000824633  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5417  peptidoglycan-binding LysM  26.5 
 
 		 591 aa  76.3  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4741  peptidoglycan-binding LysM  30.63 
 
 		 394 aa  75.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0334  hypothetical protein  29.68 
 
 		 664 aa  65.9  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0299  anti-FecI sigma factor, FecR  32.67 
 
 		 1334 aa  58.2  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2701  FecR protein  29.3 
 
 		 1237 aa  57.4  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0375839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0941  peptidoglycan-binding LysM  30.77 
 
 		 359 aa  57  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.984882  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0012  hypothetical protein  27.68 
 
 		 717 aa  56.6  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0282  anti-FecI sigma factor, FecR  39.36 
 
 		 1381 aa  53.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0058  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 1198 aa  53.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.872531  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2370  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 		 1272 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0364694 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2196  hypothetical protein  27.38 
 
 		 213 aa  49.7  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.596477 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0473  hypothetical protein  32.31 
 
 		 238 aa  49.3  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.408859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4000  FecR-like transmembrane sensor, Fe2+-dicitrate sensor  28.22 
 
 		 314 aa  48.5  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0775508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18170  hypothetical protein  29.41 
 
 		 378 aa  48.5  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000581203  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1219  hypothetical protein  24.68 
 
 		 586 aa  47.8  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0038  putative periplasmic protein  24.82 
 
 		 290 aa  46.6  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0958409  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  25.86 
 
 		 338 aa  44.7  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1324  hypothetical protein  29.46 
 
 		 231 aa  44.7  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.311232  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0489  lysyl endopeptidase  36.84 
 
 		 868 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000398143  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2621  hypothetical protein  29.46 
 
 		 287 aa  44.7  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.829749  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0161  anti-FecI sigma factor, FecR  30 
 
 		 299 aa  44.7  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.554494  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1345  hypothetical protein  38.98 
 
 		 3121 aa  44.3  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>