43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2621 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2621  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  568  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.829749  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0299  anti-FecI sigma factor, FecR  42.7 
 
 		 1334 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0282  anti-FecI sigma factor, FecR  42.11 
 
 		 1381 aa  138  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18170  hypothetical protein  27.49 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000581203  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0927  hypothetical protein  26.37 
 
 		 1248 aa  53.9  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0959972  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4083  solute binding protein-like  24.11 
 
 		 376 aa  53.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0424858  normal  0.0912112 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1345  hypothetical protein  27.1 
 
 		 3121 aa  53.1  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0923  LysM domain-containing protein  31.36 
 
 		 454 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1842  LysM domain-containing protein  31.36 
 
 		 454 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0737  LysM domain-containing protein  31.36 
 
 		 448 aa  49.7  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.990238  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1687  lysM domain-containing protein  31.36 
 
 		 454 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1665  lysM domain-containing protein  31.36 
 
 		 454 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0426  LysM domain-containing protein  31.36 
 
 		 448 aa  49.7  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.718442  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1456  LysM domain-containing protein  31.36 
 
 		 448 aa  49.7  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2637  LysM domain-containing protein  31.36 
 
 		 454 aa  49.3  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1074  signal peptide protein  32.2 
 
 		 568 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107534  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1127  hypothetical protein  27.06 
 
 		 410 aa  48.9  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.667413 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2196  hypothetical protein  27.71 
 
 		 213 aa  48.5  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.596477 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4670  hypothetical protein  35.54 
 
 		 164 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1169  peptidoglycan-binding LysM  33.61 
 
 		 554 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000824633  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1437  peptidoglycan-binding LysM  32.73 
 
 		 453 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0955  peptidoglycan-binding LysM  32.73 
 
 		 453 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.310452  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1415  peptidoglycan-binding LysM  31.08 
 
 		 453 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4992  putative peptidoglycan-binding LysM  30.07 
 
 		 484 aa  47  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.911035  normal  0.0172735 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0334  hypothetical protein  27.27 
 
 		 664 aa  46.2  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2531  peptidoglycan-binding LysM  29.63 
 
 		 548 aa  45.8  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.796598  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1660  putative peptidoglycan-binding LysM  29.63 
 
 		 484 aa  45.8  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0342216 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1324  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  45.8  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.311232  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4581  peptidoglycan-binding LysM  32.8 
 
 		 453 aa  45.8  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0994346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1356  peptidoglycan-binding LysM  31.25 
 
 		 453 aa  45.8  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0378  hypothetical protein  25.86 
 
 		 292 aa  45.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0582  hypothetical protein  33 
 
 		 463 aa  45.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000319564  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2370  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 1272 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0364694 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1219  hypothetical protein  28.08 
 
 		 586 aa  45.4  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1317  peptidoglycan-binding LysM  30.56 
 
 		 453 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0941  peptidoglycan-binding LysM  32.09 
 
 		 359 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.984882  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0719  hypothetical protein  29.11 
 
 		 153 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000971081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3258  cadherin  28.23 
 
 		 2454 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104244 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0721  hypothetical protein  44 
 
 		 175 aa  42.7  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.102946 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2701  FecR protein  27.43 
 
 		 1237 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0375839  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1705  hypothetical protein  24.29 
 
 		 259 aa  42.7  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1970  hypothetical protein  23.39 
 
 		 348 aa  42.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000904058  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0431  peptidoglycan-binding LysM  27.55 
 
 		 543 aa  42.4  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000410197  normal  0.723763 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>