52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2637 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009080  BMA10247_0737  LysM domain-containing protein  93.3 
 
 		 448 aa  807    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.990238  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1456  LysM domain-containing protein  93.3 
 
 		 448 aa  807    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0426  LysM domain-containing protein  93.3 
 
 		 448 aa  807    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.718442  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1665  lysM domain-containing protein  93.17 
 
 		 454 aa  818    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1687  lysM domain-containing protein  93.17 
 
 		 454 aa  818    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2637  LysM domain-containing protein  100 
 
 		 454 aa  914    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1842  LysM domain-containing protein  93.17 
 
 		 454 aa  816    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0923  LysM domain-containing protein  93.17 
 
 		 454 aa  818    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1878  peptidoglycan-binding LysM  66.74 
 
 		 446 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0622625 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1415  peptidoglycan-binding LysM  67.15 
 
 		 453 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4581  peptidoglycan-binding LysM  66.91 
 
 		 453 aa  565  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0994346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0955  peptidoglycan-binding LysM  67.22 
 
 		 453 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.310452  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1317  peptidoglycan-binding LysM  65.47 
 
 		 453 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1356  peptidoglycan-binding LysM  65.23 
 
 		 453 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1437  peptidoglycan-binding LysM  67.22 
 
 		 453 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1660  putative peptidoglycan-binding LysM  51.86 
 
 		 484 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0342216 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4992  putative peptidoglycan-binding LysM  50.21 
 
 		 484 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.911035  normal  0.0172735 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4163  hypothetical protein  31.47 
 
 		 556 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.868125  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5417  peptidoglycan-binding LysM  30.86 
 
 		 591 aa  154  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1074  signal peptide protein  31.63 
 
 		 568 aa  153  7e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107534  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4942  peptidoglycan-binding LysM  30.48 
 
 		 558 aa  152  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0431  peptidoglycan-binding LysM  28.08 
 
 		 543 aa  143  7e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000410197  normal  0.723763 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1005  Peptidoglycan-binding LysM  28.85 
 
 		 559 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0784845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4741  peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 		 394 aa  140  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0940  Peptidoglycan-binding LysM  29.4 
 
 		 559 aa  139  7e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.147374 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2915  Peptidoglycan-binding LysM  29.38 
 
 		 566 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0582  hypothetical protein  27.9 
 
 		 463 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000319564  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1169  peptidoglycan-binding LysM  27.33 
 
 		 554 aa  106  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000824633  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11650  hypothetical protein  34.25 
 
 		 333 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.220034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2531  peptidoglycan-binding LysM  26.06 
 
 		 548 aa  106  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.796598  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1070  hypothetical protein  34.98 
 
 		 335 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0334  hypothetical protein  31.03 
 
 		 664 aa  62.4  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1219  hypothetical protein  28.47 
 
 		 586 aa  58.2  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0012  hypothetical protein  27.56 
 
 		 717 aa  58.2  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3500  hypothetical protein  28.35 
 
 		 452 aa  54.3  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.496991  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0038  putative periplasmic protein  30.63 
 
 		 290 aa  54.3  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0958409  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1233  hypothetical protein  37.61 
 
 		 143 aa  51.2  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.258606  normal  0.166561 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2621  hypothetical protein  31.36 
 
 		 287 aa  49.3  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.829749  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4963  peptidoglycan-binding LysM  41.67 
 
 		 380 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.867782  normal  0.121696 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0282  anti-FecI sigma factor, FecR  33.93 
 
 		 1381 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0299  anti-FecI sigma factor, FecR  32.17 
 
 		 1334 aa  48.9  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1405  hypothetical protein  29.63 
 
 		 155 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  41.94 
 
 		 954 aa  47  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3586  Peptidoglycan-binding LysM  39.19 
 
 		 377 aa  45.8  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0022  hypothetical protein  27.73 
 
 		 352 aa  45.8  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.124597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04054  LysM domain protein  37.14 
 
 		 366 aa  44.3  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18170  hypothetical protein  28.08 
 
 		 378 aa  44.3  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000581203  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  36.36 
 
 		 288 aa  43.5  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2695  peptidoglycan-binding LysM  40.43 
 
 		 435 aa  43.5  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0516695  normal  0.123815 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1345  hypothetical protein  27.97 
 
 		 3121 aa  43.1  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  36.36 
 
 		 288 aa  43.1  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1527  Peptidoglycan-binding LysM  29.92 
 
 		 338 aa  43.1  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.27524e-30 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>