24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1970 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1970  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  710    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000904058  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4581  peptidoglycan-binding LysM  26.25 
 
 		 453 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0994346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1852  hypothetical protein  29.31 
 
 		 282 aa  55.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.428196  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1660  putative peptidoglycan-binding LysM  33.67 
 
 		 484 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0342216 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1878  peptidoglycan-binding LysM  26.38 
 
 		 446 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0622625 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1415  peptidoglycan-binding LysM  25.15 
 
 		 453 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0955  peptidoglycan-binding LysM  23.12 
 
 		 453 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.310452  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1437  peptidoglycan-binding LysM  23.12 
 
 		 453 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1219  hypothetical protein  23.5 
 
 		 586 aa  53.5  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0038  putative periplasmic protein  28.48 
 
 		 290 aa  53.1  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0958409  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4992  putative peptidoglycan-binding LysM  29.91 
 
 		 484 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.911035  normal  0.0172735 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1324  hypothetical protein  28.5 
 
 		 231 aa  50.4  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.311232  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1317  peptidoglycan-binding LysM  23.7 
 
 		 453 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1356  peptidoglycan-binding LysM  23.7 
 
 		 453 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0299  anti-FecI sigma factor, FecR  30.15 
 
 		 1334 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0304  hypothetical protein  25 
 
 		 542 aa  47.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0282  anti-FecI sigma factor, FecR  30.88 
 
 		 1381 aa  46.2  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2346  hypothetical protein  29.44 
 
 		 300 aa  45.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1169  peptidoglycan-binding LysM  24.1 
 
 		 554 aa  44.3  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000824633  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18170  hypothetical protein  20.79 
 
 		 378 aa  43.5  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000581203  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4741  peptidoglycan-binding LysM  26.72 
 
 		 394 aa  43.5  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0719  hypothetical protein  26.87 
 
 		 153 aa  43.1  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000971081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2621  hypothetical protein  23.39 
 
 		 287 aa  43.1  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.829749  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4670  hypothetical protein  28 
 
 		 164 aa  42.7  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>