22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1324 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1324  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  454  1e-127  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.311232  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1878  peptidoglycan-binding LysM  31.15 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0622625 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1074  signal peptide protein  29.63 
 
 		 568 aa  52.8  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107534  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4581  peptidoglycan-binding LysM  26.45 
 
 		 453 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0994346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1317  peptidoglycan-binding LysM  26.45 
 
 		 453 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1970  hypothetical protein  28.5 
 
 		 348 aa  50.4  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000904058  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1356  peptidoglycan-binding LysM  26.45 
 
 		 453 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0299  anti-FecI sigma factor, FecR  31.4 
 
 		 1334 aa  49.7  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0955  peptidoglycan-binding LysM  25.62 
 
 		 453 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.310452  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1437  peptidoglycan-binding LysM  25.62 
 
 		 453 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1415  peptidoglycan-binding LysM  25.62 
 
 		 453 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2621  hypothetical protein  32.12 
 
 		 287 aa  46.6  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.829749  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0431  peptidoglycan-binding LysM  32.63 
 
 		 543 aa  46.6  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000410197  normal  0.723763 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3500  hypothetical protein  25.95 
 
 		 452 aa  45.4  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.496991  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4741  peptidoglycan-binding LysM  25.62 
 
 		 394 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2531  peptidoglycan-binding LysM  29.46 
 
 		 548 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.796598  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2915  Peptidoglycan-binding LysM  29.82 
 
 		 566 aa  44.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0282  anti-FecI sigma factor, FecR  32.79 
 
 		 1381 aa  43.5  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1219  hypothetical protein  26.83 
 
 		 586 aa  43.1  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7154  hypothetical protein  27.97 
 
 		 2039 aa  42.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1005  Peptidoglycan-binding LysM  25 
 
 		 559 aa  42.7  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0784845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0940  Peptidoglycan-binding LysM  25.81 
 
 		 559 aa  42.4  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.147374 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>