68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1219 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1219  hypothetical protein  100 
 
 
586 aa  1176    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2701  FecR protein  30.56 
 
 
1237 aa  80.1  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0375839  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0334  hypothetical protein  24.34 
 
 
664 aa  79.3  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2370  TPR repeat-containing protein  30.12 
 
 
1272 aa  77.8  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0364694 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0058  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 
1198 aa  72  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.872531  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2953  putative prolin-rich transmembrane protein  30.9 
 
 
871 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1063  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 
1129 aa  62.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.194908  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1032  putative prolin-rich transmembrane protein  30.12 
 
 
874 aa  62  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3271  putative prolin-rich exported protein  30.3 
 
 
846 aa  61.2  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0789  putative prolin-rich transmembrane protein  25 
 
 
848 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0494509 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0299  anti-FecI sigma factor, FecR  27.84 
 
 
1334 aa  59.3  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1456  LysM domain-containing protein  28.47 
 
 
448 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1345  hypothetical protein  24.53 
 
 
3121 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1687  lysM domain-containing protein  28.47 
 
 
454 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0923  LysM domain-containing protein  28.47 
 
 
454 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0737  LysM domain-containing protein  28.47 
 
 
448 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.990238  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0426  LysM domain-containing protein  28.47 
 
 
448 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.718442  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1842  LysM domain-containing protein  28.47 
 
 
454 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1665  lysM domain-containing protein  28.47 
 
 
454 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0473  hypothetical protein  25.44 
 
 
238 aa  58.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.408859  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1169  peptidoglycan-binding LysM  23.43 
 
 
554 aa  58.2  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000824633  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3655  putative chromosome segregation ATPase  25.21 
 
 
941 aa  58.2  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.228794  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2637  LysM domain-containing protein  28.47 
 
 
454 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1045  hypothetical protein  27.53 
 
 
858 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.750877  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2217  hypothetical protein  28.03 
 
 
904 aa  56.6  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4200  hypothetical protein  31.16 
 
 
857 aa  56.6  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3975  hypothetical protein  28.85 
 
 
835 aa  56.6  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.584669  hitchhiker  0.0089061 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0966  hypothetical protein  31.11 
 
 
856 aa  56.6  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0962  hypothetical protein  31.16 
 
 
856 aa  56.2  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0012  hypothetical protein  24.92 
 
 
717 aa  55.8  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2894  hypothetical protein  29.65 
 
 
857 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0038  putative periplasmic protein  29.75 
 
 
290 aa  55.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0958409  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2944  putative prolin-rich exported protein  29.65 
 
 
907 aa  54.7  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298919  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0941  peptidoglycan-binding LysM  26.74 
 
 
359 aa  55.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.984882  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2832  translation initiation factor 2  29.65 
 
 
857 aa  55.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2520  translation initiation factor 2  28.07 
 
 
367 aa  54.7  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0894  hypothetical protein  28.07 
 
 
367 aa  54.7  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.357684  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1356  peptidoglycan-binding LysM  24.53 
 
 
453 aa  54.3  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53849  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3315  putative prolin-rich transmembrane protein  26.37 
 
 
787 aa  53.9  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.534129  normal  0.208628 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0282  anti-FecI sigma factor, FecR  27.11 
 
 
1381 aa  53.9  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1681  RE17165p  31.88 
 
 
915 aa  53.9  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1970  hypothetical protein  23.5 
 
 
348 aa  53.5  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000904058  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1317  peptidoglycan-binding LysM  24.53 
 
 
453 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4013  hypothetical protein  25.32 
 
 
790 aa  52.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3510  putative proline-rich transmembrane protein  29.3 
 
 
799 aa  52.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000863907 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4992  putative peptidoglycan-binding LysM  31.09 
 
 
484 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.911035  normal  0.0172735 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4581  peptidoglycan-binding LysM  25.55 
 
 
453 aa  52.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0994346  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1437  peptidoglycan-binding LysM  22.56 
 
 
453 aa  52  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0955  peptidoglycan-binding LysM  22.56 
 
 
453 aa  52  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.310452  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1878  peptidoglycan-binding LysM  24.1 
 
 
446 aa  52.4  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0622625 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3389  hypothetical protein  22.94 
 
 
209 aa  52  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3185  putative prolin-rich transmembrane protein  29.3 
 
 
799 aa  51.6  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.702606  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4325  putative prolin-rich exported protein  30.93 
 
 
769 aa  51.6  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1415  peptidoglycan-binding LysM  23.47 
 
 
453 aa  51.2  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1086  hypothetical protein  32.08 
 
 
855 aa  50.8  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1660  putative peptidoglycan-binding LysM  26.24 
 
 
484 aa  50.4  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0342216 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1899  hypothetical protein  25.69 
 
 
147 aa  49.3  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18170  hypothetical protein  24 
 
 
378 aa  48.1  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000581203  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4074  putative chromosome segregation ATPases  26.03 
 
 
842 aa  47.8  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.307372 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2531  peptidoglycan-binding LysM  24.68 
 
 
548 aa  47.8  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.796598  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0582  hypothetical protein  29.17 
 
 
463 aa  47.4  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000319564  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2528  hypothetical protein  23.43 
 
 
704 aa  47.4  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136644  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4463  putative proline-rich transmembrane protein  27.27 
 
 
762 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.364594  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2621  hypothetical protein  28.08 
 
 
287 aa  45.4  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.829749  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4566  hypothetical protein  23.65 
 
 
369 aa  45.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.955909  normal  0.153993 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1233  hypothetical protein  25 
 
 
143 aa  45.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.258606  normal  0.166561 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2294  putative proline-rich transmembrane protein  27.27 
 
 
719 aa  44.7  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4670  hypothetical protein  26.28 
 
 
164 aa  43.9  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>