49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2528 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2528  hypothetical protein  100 
 
 		 704 aa  1388    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136644  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3315  putative prolin-rich transmembrane protein  30.08 
 
 		 787 aa  171  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.534129  normal  0.208628 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3271  putative prolin-rich exported protein  32.25 
 
 		 846 aa  169  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4463  putative proline-rich transmembrane protein  30.56 
 
 		 762 aa  167  8e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.364594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3510  putative proline-rich transmembrane protein  31.35 
 
 		 799 aa  167  9e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000863907 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3185  putative prolin-rich transmembrane protein  31.96 
 
 		 799 aa  165  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.702606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2953  putative prolin-rich transmembrane protein  31.35 
 
 		 871 aa  165  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1032  putative prolin-rich transmembrane protein  31.6 
 
 		 874 aa  163  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0789  putative prolin-rich transmembrane protein  32.14 
 
 		 848 aa  162  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0494509 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3655  putative chromosome segregation ATPase  32.26 
 
 		 941 aa  157  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.228794  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4074  putative chromosome segregation ATPases  32.4 
 
 		 842 aa  156  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.307372 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1045  hypothetical protein  36.5 
 
 		 858 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.750877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2217  hypothetical protein  31.98 
 
 		 904 aa  152  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4325  putative prolin-rich exported protein  34.36 
 
 		 769 aa  150  8e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4200  hypothetical protein  30.52 
 
 		 857 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1086  hypothetical protein  32.84 
 
 		 855 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3975  hypothetical protein  30.98 
 
 		 835 aa  148  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.584669  hitchhiker  0.0089061 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0962  hypothetical protein  33.82 
 
 		 856 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2894  hypothetical protein  29.77 
 
 		 857 aa  146  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2832  translation initiation factor 2  29.77 
 
 		 857 aa  146  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2944  putative prolin-rich exported protein  29.77 
 
 		 907 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298919  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0966  hypothetical protein  33.82 
 
 		 856 aa  145  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1681  RE17165p  35.53 
 
 		 915 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4100  hypothetical protein  28.21 
 
 		 740 aa  139  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1357  hypothetical protein  27.16 
 
 		 784 aa  136  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4954  putative chromosome segregation ATPase  32.63 
 
 		 639 aa  128  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459285  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2520  translation initiation factor 2  36.33 
 
 		 367 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0894  hypothetical protein  36.33 
 
 		 367 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.357684  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0509  hypothetical protein  30.57 
 
 		 741 aa  119  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140536 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1306  putative chromosome segregation ATPase  25.31 
 
 		 848 aa  118  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000692964  normal  0.11952 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3360  hypothetical protein  29.26 
 
 		 459 aa  117  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3389  hypothetical protein  36.08 
 
 		 209 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4013  hypothetical protein  29.97 
 
 		 790 aa  113  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2265  hypothetical protein  39.61 
 
 		 472 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.184609 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2294  putative proline-rich transmembrane protein  27.94 
 
 		 719 aa  103  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2318  hypothetical protein  37.66 
 
 		 473 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0293143  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2406  hypothetical protein  37.66 
 
 		 485 aa  99.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542491  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1548  hypothetical protein  42.98 
 
 		 487 aa  97.8  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.227278  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2637  hypothetical protein  29.94 
 
 		 680 aa  94.4  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812362  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4200  hypothetical protein  25.82 
 
 		 438 aa  90.9  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156411  normal  0.730059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0784  hypothetical protein  31.84 
 
 		 466 aa  85.9  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0460  FHA domain-containing protein  35.07 
 
 		 341 aa  83.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1125  hypothetical protein  27.82 
 
 		 488 aa  83.2  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4613  hypothetical protein  36.36 
 
 		 437 aa  74.7  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  23.36 
 
 		 3409 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  25 
 
 		 3521 aa  47.8  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1219  hypothetical protein  22.64 
 
 		 586 aa  46.2  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  25.66 
 
 		 3472 aa  43.9  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  25.66 
 
 		 3471 aa  43.9  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>