53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1233 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1233  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  285  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.258606  normal  0.166561 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1991  hypothetical protein  43.7 
 
 		 143 aa  105  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.76176  normal  0.495244 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1405  hypothetical protein  46.36 
 
 		 155 aa  97.8  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3718  hypothetical protein  38.35 
 
 		 154 aa  90.5  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.98166  normal  0.257173 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2086  hypothetical protein  39.5 
 
 		 155 aa  88.2  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4670  hypothetical protein  40.91 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0719  hypothetical protein  34 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000971081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1899  hypothetical protein  29.69 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0634  hypothetical protein  31.94 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000800273  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7154  hypothetical protein  31.2 
 
 		 2039 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3598  hypothetical protein  31.19 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000750539 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3753  hypothetical protein  28.36 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1759  hypothetical protein  40.54 
 
 		 602 aa  61.6  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00474122  normal  0.0887156 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0927  hypothetical protein  29.91 
 
 		 1248 aa  61.2  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0959972  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1810  hypothetical protein  38.46 
 
 		 556 aa  60.8  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.131395  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1557  hypothetical protein  32.26 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.647868 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1127  hypothetical protein  29.41 
 
 		 410 aa  57.4  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.667413 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2346  hypothetical protein  34.83 
 
 		 300 aa  57.4  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2533  hypothetical protein  36.49 
 
 		 573 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.23365  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2345  hypothetical protein  37.84 
 
 		 581 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.722674  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3155  hypothetical protein  36.49 
 
 		 576 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1113  hypothetical protein  30.83 
 
 		 322 aa  55.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.303813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0737  LysM domain-containing protein  37.61 
 
 		 448 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.990238  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0426  LysM domain-containing protein  37.61 
 
 		 448 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.718442  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1456  LysM domain-containing protein  37.61 
 
 		 448 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0923  LysM domain-containing protein  37.61 
 
 		 454 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1842  LysM domain-containing protein  37.61 
 
 		 454 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1852  hypothetical protein  31.58 
 
 		 282 aa  51.2  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.428196  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1665  lysM domain-containing protein  37.61 
 
 		 454 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1687  lysM domain-containing protein  37.61 
 
 		 454 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2637  LysM domain-containing protein  37.61 
 
 		 454 aa  50.8  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.96 
 
 		 2507 aa  48.9  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4083  solute binding protein-like  24.09 
 
 		 376 aa  48.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0424858  normal  0.0912112 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3258  cadherin  26.98 
 
 		 2454 aa  47  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104244 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0811  hypothetical protein  27.97 
 
 		 800 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0431  peptidoglycan-binding LysM  31.63 
 
 		 543 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000410197  normal  0.723763 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1219  hypothetical protein  25 
 
 		 586 aa  45.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1851  hypothetical protein  25.81 
 
 		 312 aa  43.9  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1878  peptidoglycan-binding LysM  32.97 
 
 		 446 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0622625 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0473  hypothetical protein  31.25 
 
 		 238 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.408859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1437  peptidoglycan-binding LysM  31.91 
 
 		 453 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0955  peptidoglycan-binding LysM  31.91 
 
 		 453 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.310452  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1356  peptidoglycan-binding LysM  30.97 
 
 		 453 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1415  peptidoglycan-binding LysM  31.91 
 
 		 453 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1317  peptidoglycan-binding LysM  30.97 
 
 		 453 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1762  hypothetical protein  27.47 
 
 		 294 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.426629  normal  0.0904839 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4992  putative peptidoglycan-binding LysM  28.69 
 
 		 484 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.911035  normal  0.0172735 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1675  hypothetical protein  25.29 
 
 		 296 aa  41.6  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.642671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4581  peptidoglycan-binding LysM  31.91 
 
 		 453 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0994346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3359  hypothetical protein  27.14 
 
 		 352 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.466327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3662  hypothetical protein  29.89 
 
 		 333 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.95 
 
 		 11716 aa  40.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3164  hypothetical protein  28.81 
 
 		 214 aa  40.4  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>