49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4463 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4463  putative proline-rich transmembrane protein  100 
 
 		 762 aa  1515    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.364594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3271  putative prolin-rich exported protein  45.58 
 
 		 846 aa  424  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4325  putative prolin-rich exported protein  45.51 
 
 		 769 aa  389  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0789  putative prolin-rich transmembrane protein  44.2 
 
 		 848 aa  362  1e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0494509 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2832  translation initiation factor 2  37.02 
 
 		 857 aa  362  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2894  hypothetical protein  36.89 
 
 		 857 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2944  putative prolin-rich exported protein  36.12 
 
 		 907 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298919  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2953  putative prolin-rich transmembrane protein  45.75 
 
 		 871 aa  356  7.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1032  putative prolin-rich transmembrane protein  45.55 
 
 		 874 aa  355  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2217  hypothetical protein  38.15 
 
 		 904 aa  355  2.9999999999999997e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3315  putative prolin-rich transmembrane protein  44.66 
 
 		 787 aa  351  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.534129  normal  0.208628 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1681  RE17165p  36.42 
 
 		 915 aa  351  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4200  hypothetical protein  38.63 
 
 		 857 aa  343  9e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3510  putative proline-rich transmembrane protein  42.86 
 
 		 799 aa  342  2e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000863907 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3185  putative prolin-rich transmembrane protein  42.59 
 
 		 799 aa  341  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.702606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1045  hypothetical protein  39.06 
 
 		 858 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.750877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0962  hypothetical protein  39.14 
 
 		 856 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0966  hypothetical protein  39.05 
 
 		 856 aa  334  3e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1086  hypothetical protein  39.12 
 
 		 855 aa  333  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4074  putative chromosome segregation ATPases  48.6 
 
 		 842 aa  330  6e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.307372 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3655  putative chromosome segregation ATPase  41.32 
 
 		 941 aa  327  6e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.228794  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3975  hypothetical protein  40.79 
 
 		 835 aa  323  6e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.584669  hitchhiker  0.0089061 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4013  hypothetical protein  43.56 
 
 		 790 aa  301  3e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4954  putative chromosome segregation ATPase  42.65 
 
 		 639 aa  297  4e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459285  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2294  putative proline-rich transmembrane protein  38.75 
 
 		 719 aa  296  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2520  translation initiation factor 2  46.15 
 
 		 367 aa  287  4e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0894  hypothetical protein  46.15 
 
 		 367 aa  287  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.357684  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4100  hypothetical protein  31.5 
 
 		 740 aa  262  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2637  hypothetical protein  37.46 
 
 		 680 aa  213  9e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812362  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0509  hypothetical protein  32.78 
 
 		 741 aa  202  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140536 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2528  hypothetical protein  32.22 
 
 		 704 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136644  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1357  hypothetical protein  25.06 
 
 		 784 aa  133  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1306  putative chromosome segregation ATPase  26.32 
 
 		 848 aa  89.7  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000692964  normal  0.11952 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3360  hypothetical protein  25.09 
 
 		 459 aa  88.6  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4200  hypothetical protein  35.23 
 
 		 438 aa  84  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156411  normal  0.730059 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2265  hypothetical protein  33.33 
 
 		 472 aa  82  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.184609 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7074  hypothetical protein  30.63 
 
 		 490 aa  74.3  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0296641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2318  hypothetical protein  42.59 
 
 		 473 aa  73.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0293143  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2406  hypothetical protein  42.59 
 
 		 485 aa  73.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542491  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0784  hypothetical protein  31.94 
 
 		 466 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4613  hypothetical protein  36.89 
 
 		 437 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1548  hypothetical protein  40.74 
 
 		 487 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.227278  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1125  hypothetical protein  32.8 
 
 		 488 aa  65.5  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0460  FHA domain-containing protein  37.6 
 
 		 341 aa  60.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3389  hypothetical protein  30.51 
 
 		 209 aa  60.1  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2170  hypothetical protein  30.16 
 
 		 479 aa  47.8  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.663586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1219  hypothetical protein  27.27 
 
 		 586 aa  46.6  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0895  hypothetical protein  34.58 
 
 		 464 aa  45.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  35.75 
 
 		 522 aa  44.7  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>