18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4566 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4566  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  723    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.955909  normal  0.153993 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3869  hypothetical protein  29.63 
 
 		 874 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.059415 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0811  hypothetical protein  24.86 
 
 		 800 aa  49.3  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11650  hypothetical protein  34.51 
 
 		 333 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.220034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1070  hypothetical protein  34.51 
 
 		 335 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1851  pentapeptide repeat-containing protein  28.17 
 
 		 551 aa  46.6  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000406154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0964  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 		 488 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.824604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3227  hypothetical protein  46.34 
 
 		 996 aa  45.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.640032  normal  0.507723 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1160  hypothetical protein  38.1 
 
 		 3204 aa  45.8  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140088 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0017  hypothetical protein  26.06 
 
 		 620 aa  44.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000261883  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  34.04 
 
 		 453 aa  43.9  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2875  von Willebrand factor type A  22.5 
 
 		 615 aa  44.3  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0100265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3753  hypothetical protein  31.19 
 
 		 335 aa  43.5  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1557  hypothetical protein  26.04 
 
 		 235 aa  43.5  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.647868 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2531  peptidoglycan-binding LysM  28.68 
 
 		 548 aa  43.1  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.796598  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1221  hypothetical protein  22.22 
 
 		 623 aa  42.7  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1317  peptidoglycan-binding LysM  25.76 
 
 		 453 aa  43.1  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1356  peptidoglycan-binding LysM  25.76 
 
 		 453 aa  42.7  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53849  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>