28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3753 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3753  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  663    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1810  hypothetical protein  46.12 
 
 		 556 aa  152  8e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.131395  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2345  hypothetical protein  56.06 
 
 		 581 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.722674  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1759  hypothetical protein  48.35 
 
 		 602 aa  145  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00474122  normal  0.0887156 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3155  hypothetical protein  54.89 
 
 		 576 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2533  hypothetical protein  58.62 
 
 		 573 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.23365  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1675  hypothetical protein  41.77 
 
 		 296 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.642671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2346  hypothetical protein  34.18 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1762  hypothetical protein  34.88 
 
 		 294 aa  87  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.426629  normal  0.0904839 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1557  hypothetical protein  32.17 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.647868 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3359  hypothetical protein  31.52 
 
 		 352 aa  79.7  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.466327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3662  hypothetical protein  32.22 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7154  hypothetical protein  35.56 
 
 		 2039 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.03 
 
 		 2507 aa  64.3  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1233  hypothetical protein  28.36 
 
 		 143 aa  62.4  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.258606  normal  0.166561 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1991  hypothetical protein  34.07 
 
 		 143 aa  62.4  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.76176  normal  0.495244 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0304  hypothetical protein  33.33 
 
 		 542 aa  59.3  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4670  hypothetical protein  34.23 
 
 		 164 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0719  hypothetical protein  29.66 
 
 		 153 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000971081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1899  hypothetical protein  27.78 
 
 		 147 aa  55.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0811  hypothetical protein  26.09 
 
 		 800 aa  53.5  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4083  solute binding protein-like  31.25 
 
 		 376 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0424858  normal  0.0912112 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0634  hypothetical protein  27.78 
 
 		 146 aa  48.5  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000800273  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1852  hypothetical protein  27.78 
 
 		 282 aa  47  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.428196  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0927  hypothetical protein  29.67 
 
 		 1248 aa  46.6  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0959972  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3718  hypothetical protein  28.71 
 
 		 154 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.98166  normal  0.257173 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2086  hypothetical protein  26.67 
 
 		 155 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1127  hypothetical protein  29.93 
 
 		 410 aa  45.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.667413 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>