23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1762 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1762  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  590  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.426629  normal  0.0904839 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3662  hypothetical protein  53 
 
 		 333 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3359  hypothetical protein  60.85 
 
 		 352 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.466327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1557  hypothetical protein  31.43 
 
 		 235 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.647868 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3753  hypothetical protein  34.04 
 
 		 335 aa  88.6  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1810  hypothetical protein  31.06 
 
 		 556 aa  61.2  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.131395  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2345  hypothetical protein  30.47 
 
 		 581 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.722674  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1675  hypothetical protein  31.65 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.642671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2533  hypothetical protein  31.25 
 
 		 573 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.23365  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1759  hypothetical protein  31.82 
 
 		 602 aa  55.5  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00474122  normal  0.0887156 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  25 
 
 		 2507 aa  55.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0719  hypothetical protein  29.45 
 
 		 153 aa  53.9  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000971081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3155  hypothetical protein  30.28 
 
 		 576 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2346  hypothetical protein  25.83 
 
 		 300 aa  52.8  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0811  hypothetical protein  28.35 
 
 		 800 aa  50.4  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0304  hypothetical protein  29.5 
 
 		 542 aa  48.9  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1070  hypothetical protein  27.19 
 
 		 335 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1991  hypothetical protein  31.34 
 
 		 143 aa  46.2  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.76176  normal  0.495244 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11650  hypothetical protein  26.8 
 
 		 333 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.220034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1851  hypothetical protein  27.45 
 
 		 312 aa  43.5  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1233  hypothetical protein  26.14 
 
 		 143 aa  43.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.258606  normal  0.166561 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18170  hypothetical protein  24.58 
 
 		 378 aa  43.1  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000581203  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4670  hypothetical protein  31.31 
 
 		 164 aa  43.1  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>