32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1991 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1991  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  282  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.76176  normal  0.495244 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3718  hypothetical protein  48.55 
 
 		 154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.98166  normal  0.257173 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2086  hypothetical protein  49.58 
 
 		 155 aa  120  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1233  hypothetical protein  43.7 
 
 		 143 aa  105  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.258606  normal  0.166561 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0719  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  90.1  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000971081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1899  hypothetical protein  35.88 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4670  hypothetical protein  37.21 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0634  hypothetical protein  35.54 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000800273  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1405  hypothetical protein  32.52 
 
 		 155 aa  80.5  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3598  hypothetical protein  36.59 
 
 		 152 aa  80.1  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000750539 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3753  hypothetical protein  34.07 
 
 		 335 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4083  solute binding protein-like  31.54 
 
 		 376 aa  61.6  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0424858  normal  0.0912112 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1557  hypothetical protein  30.22 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.647868 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3662  hypothetical protein  31.06 
 
 		 333 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1810  hypothetical protein  27.14 
 
 		 556 aa  55.1  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.131395  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3359  hypothetical protein  31.5 
 
 		 352 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.466327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7154  hypothetical protein  26.15 
 
 		 2039 aa  54.3  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0811  hypothetical protein  30.09 
 
 		 800 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1759  hypothetical protein  29 
 
 		 602 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00474122  normal  0.0887156 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3258  cadherin  26.87 
 
 		 2454 aa  51.6  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104244 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2345  hypothetical protein  28.89 
 
 		 581 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.722674  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1113  hypothetical protein  32.32 
 
 		 322 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.303813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0927  hypothetical protein  25.2 
 
 		 1248 aa  48.9  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0959972  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2533  hypothetical protein  28.57 
 
 		 573 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.23365  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3155  hypothetical protein  28.89 
 
 		 576 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1675  hypothetical protein  29.7 
 
 		 296 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.642671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1851  hypothetical protein  24.6 
 
 		 312 aa  47.4  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.63 
 
 		 2507 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1762  hypothetical protein  32.94 
 
 		 294 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.426629  normal  0.0904839 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1852  hypothetical protein  27.47 
 
 		 282 aa  43.5  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.428196  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0304  hypothetical protein  25.95 
 
 		 542 aa  43.5  0.0009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2346  hypothetical protein  27.21 
 
 		 300 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>