15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1851 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1851  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  629  1e-179  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1852  hypothetical protein  49.32 
 
 		 282 aa  225  9e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.428196  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4083  solute binding protein-like  27.71 
 
 		 376 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0424858  normal  0.0912112 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0719  hypothetical protein  29.75 
 
 		 153 aa  60.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000971081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.67 
 
 		 2507 aa  49.7  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1899  hypothetical protein  24.39 
 
 		 147 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7154  hypothetical protein  26.97 
 
 		 2039 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3258  cadherin  25.85 
 
 		 2454 aa  47.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104244 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1991  hypothetical protein  24.6 
 
 		 143 aa  46.6  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.76176  normal  0.495244 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2086  hypothetical protein  28.8 
 
 		 155 aa  43.5  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1762  hypothetical protein  27.45 
 
 		 294 aa  43.5  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.426629  normal  0.0904839 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2701  FecR protein  24.2 
 
 		 1237 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0375839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1113  hypothetical protein  23.59 
 
 		 322 aa  42.4  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.303813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1169  peptidoglycan-binding LysM  26.62 
 
 		 554 aa  42.7  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000824633  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1759  hypothetical protein  26.67 
 
 		 602 aa  42.4  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00474122  normal  0.0887156 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>