31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2086 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2086  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  307  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3718  hypothetical protein  72.26 
 
 		 154 aa  221  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.98166  normal  0.257173 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1991  hypothetical protein  47.37 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.76176  normal  0.495244 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4670  hypothetical protein  46.77 
 
 		 164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1899  hypothetical protein  34.78 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1233  hypothetical protein  36.88 
 
 		 143 aa  89.4  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.258606  normal  0.166561 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0634  hypothetical protein  34.75 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000800273  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0719  hypothetical protein  36.44 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000971081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1405  hypothetical protein  33.83 
 
 		 155 aa  77  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3598  hypothetical protein  31.58 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000750539 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3258  cadherin  32.09 
 
 		 2454 aa  59.7  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104244 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3359  hypothetical protein  29.17 
 
 		 352 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.466327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0811  hypothetical protein  31.43 
 
 		 800 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0927  hypothetical protein  26.96 
 
 		 1248 aa  50.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0959972  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3662  hypothetical protein  28.06 
 
 		 333 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1557  hypothetical protein  31.91 
 
 		 235 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.647868 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4083  solute binding protein-like  23.87 
 
 		 376 aa  47  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0424858  normal  0.0912112 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1851  hypothetical protein  28.12 
 
 		 312 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7154  hypothetical protein  27.34 
 
 		 2039 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3753  hypothetical protein  26.67 
 
 		 335 aa  45.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4581  peptidoglycan-binding LysM  32.48 
 
 		 453 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0994346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0304  hypothetical protein  26.67 
 
 		 542 aa  44.3  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1127  hypothetical protein  29.37 
 
 		 410 aa  43.5  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.667413 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1415  peptidoglycan-binding LysM  32.48 
 
 		 453 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1437  peptidoglycan-binding LysM  32.2 
 
 		 453 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0955  peptidoglycan-binding LysM  32.2 
 
 		 453 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.310452  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2533  hypothetical protein  26.26 
 
 		 573 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.23365  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2345  hypothetical protein  26.67 
 
 		 581 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.722674  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0473  hypothetical protein  26.75 
 
 		 238 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.408859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1219  hypothetical protein  24 
 
 		 586 aa  40.4  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3155  hypothetical protein  25.56 
 
 		 576 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>